核帽结合蛋白 2
在转录时将单甲基化帽结构添加到由 RNA 聚合酶 II 转录的 RNA。帽结构通过促进mRNA与细胞质中的核糖体结合来增强翻译。它在核事件中也很重要,例如前 mRNA 剪接和 RNA 的核输出,以及剪接体的形成。一种 80-kD 的核帽结合蛋白 NCBP1( 600469 ) 是涉及帽依赖性核过程的一个因素。NCBP2 与 NCBP1 形成复合物,这两种蛋白质都是结合帽结构所必需的(Kataoka 等人,1995 年)。
▼ 克隆与表达
通过使用以 NCBP1 作为诱饵的酵母 2-杂交相互作用陷阱系统筛选 HeLa 细胞 cDNA 文库,Kataoka 等人(1995)分离出一个编码 NCBP2 的 cDNA,他们称之为 NIP1。孤立地,Izaurralde 等人(1995)使用对应于纯化和微测序的 20-kD 帽结合蛋白的寡核苷酸引物,通过对 HeLa 细胞 cDNA 文库进行 PCR 分析,孤立出编码 NCBP2 的 cDNA,他们称之为 CBP20。推断的 156 个氨基酸的 NCBP2 蛋白与非洲爪蟾 Ncbp2 蛋白具有 84% 的氨基酸同一性,包含一个具有高度保守的 RNP1 和 RNP2 结构域的 RNP 基序。Northern 印迹分析检测到一个主要的 2.0 和一个次要的 0.8-kb NCBP2 转录物(Kataoka 等人,1995)。
▼ 基因功能
片冈等人(1995)证明 NCBP2 和 NCBP1 仅在相互复合时才与帽结构结合。
Izaurralde 等人(1995)表明 NCBP1 和 NCBP2 的抗体可以抑制它们与加帽 RNA 的相互作用。
通过对共沉淀的 HeLa 细胞蛋白进行质谱分析,Gebhardt 等人(2015)发现 NCBP2 优先与参与输出小核 RNA(snRNA) 的蛋白质相互作用,而其旁系同源物 NCBP3( 616624) 优先与参与 mRNA 加工和输出的蛋白质相互作用。RNA 免疫沉淀显示 NCBP2 和 NCBP3 都与加帽的 mRNA 相互作用,但 snRNA、长基因间非编码 RNA 和反义 RNA 优先结合 NCBP2。单独敲除 NCBP3 或 NCBP2 对 HeLa 细胞和 NIH3T3 小鼠成纤维细胞的生长或 mRNA 核积累几乎没有影响。然而,敲低 NCBP2 和 NCBP3 会降低细胞生长,减少 NCBP1 与 N7 甲基化 GTP 的关联,并导致 mRNA 的核积累。在 HeLa 细胞中敲除 NCPB3 而不是 NCBP2 会提高受感染的水泡性口炎病毒、Semliki 森林病毒和脑心肌炎病毒的细胞质复制。格布哈特等人(2015)得出的结论是 NCBP2 和 NCBP3 在稳态条件下可以相互补偿,但 NCBP3 是特别需要限制病毒感染的程度。
▼ 生化特征
马扎等人(2001)确定了人类核帽结合复合物的 2 埃晶体结构。该结构表明,大亚基 CBP80 有 3 个结构域,每个结构域都包含连续的螺旋发夹结构,类似于在其他几种参与 RNA 代谢的蛋白质中发现的所谓 MIF4G 结构域。小亚基 CBP20 具有 RNP 折叠并与 CBP80 的第二和第三结构域相关联。定点诱变揭示了 CBP20 的 4 个残基,这些残基对帽结合至关重要。
▼ 测绘
Hartz(2015)根据 NCBP2 序列(GenBank BC001255 ) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 NCBP2 基因对应到染色体 3q29。