SYNDECAN 结合蛋白
多聚体(例如,SDC1;186355 )是跨膜蛋白聚糖,其将结构上异质的硫酸乙酰肝素链置于细胞表面,并将高度保守的多肽置于细胞质中。多功能硫酸乙酰肝素部分支持分子识别、信号传导和转移的各种过程。Grootjans 等人(1997)报道了在酵母 2-杂交筛选和其他测定中鉴定到与多聚体的胞质结构域结合的蛋白质。这种称为 syntenin 的蛋白质包含一个串联重复的 PDZ 结构域,该结构域与 Syndecans 的 FYA(phe-tyr-ala) C-末端氨基酸序列反应。由绿色荧光蛋白和 syntenin 融合产生的蛋白质共定位于质膜和细胞内囊泡与 syndecans。过表达融合蛋白的细胞显示出许多细胞表面延伸,表明 syntenin 对细胞骨架膜组织的影响。Grootjans 等人(1997)提出,syntenin 可以作为一个接头,将 syndecans 与细胞骨架蛋白或胞质下游信号效应器偶联。
费尔南德斯-拉雷亚等人(1999)使用 2-hybrid 筛选来识别 pro-TGF-α( 190170 ) 细胞质结构域结合蛋白,他们将其称为 TACIP(pro-TGF-α 细胞质结构域相互作用蛋白),参与 pro-TGF-α 的转移。 -TGF-α。他们克隆了 2 种这样的蛋白质,TACIP1 和 TACIP18,这两种蛋白质都显示出与未到达细胞表面的前 TGF-α C 末端突变体缺乏相互作用。TACIP1 和 TACP18 分别与 PDZ 蛋白 α-1-syntrophin( 601017 ) 和 syntenin 相同。费尔南德斯-拉雷亚等人(1999)注意到 TACIP18/syntenin 也被Lin 等人鉴定为黑色素瘤分化相关基因 9 或 MDA9(1998 年)。
Borrell-Pages 等人使用 Northern 印迹分析(2000)在检查的所有 8 个人体组织中检测到 2.4-kb TACIP18 转录本。RNA 斑点印迹分析显示广泛且可变的 TACIP18 表达,在胎盘中含量最高。TACIP18 在胎儿组织中的表达通常高于成人组织。
▼ 基因功能
已知 PDZ 结构域与多种跨膜蛋白的 C 末端结合。因此,Fernandez-Larrea 等人(1999)证明 TACIP1 和 TACIP18 的 PDZ 结构域负责与前 TGF-α 的细胞质结构域的相互作用。对一组 pro-TGF-α C 末端突变体的分析表明,阻止与 TACIP1 结合但不与 TACIP18 结合的突变不会破坏 pro-TGF-α 在体内向细胞表面的转运。此外,syndecan-2 的胞质结构域( 142460),也已知与 TACIP18 结合,有效地取代了 pro-TGF-α,因为 pro-TGF-α/syndecan 嵌合分子以正常动力学被转运到细胞表面。阻止TACIP18与多聚体胞质结构域结合的突变也干扰了前TGF-α/多聚体嵌合体的正常转移,进一步支持了TACIP18在前TGF-α转移中的作用。与大多数定位于质膜附近的 PDZ 蛋白不同,TACIP18 定位于分泌途径的早期。在体内,TACIP18 在与内质网标记共定位的核周区域中与未成熟的前TGF-α 特异性相互作用。
白细胞介素 5(IL5; 147850 ) 受体由 IL5 特异性 α 亚基(IL5RA; 147851 ) 和与 IL3( 147740 ) 和 GMCSF( 138960 )共享的信号转导β亚基 CFS2RB( 138981 ) 组成. Geijsen 等人使用具有 IL5RA 细胞质结构域的粒细胞 cDNA 文库的酵母 2 杂交筛选作为诱饵(2001)确定了 IL5RA 与 syntenin 的相互作用。GST pull-down、BIAcore、共免疫沉淀和缺失突变分析证实了 syntenin 与 IL5RA 最后 15 个 C 末端残基的关联;syntenin 不与 CFS2RB 相互作用。在这 15 个残基的 IL5RA 中,C 末端苯丙氨酸至关重要。删除已知与 C 末端肽序列相互作用的 syntenin 的 2 个串联 PDZ 结构域中的任何一个,消除了 IL5RA-syntenin 相互作用。第二个 2 杂交筛选确定了小鼠转录因子 Sox4( 184430) 作为 syntenin 的结合伙伴,但不作为 IL5RA 的结合伙伴。syntenin-Sox4 相互作用发生在 syntenin 的 PDZ 结构域之外。萤光素酶报告基因分析和荧光显微镜显示,IL5,但不是 IL3,诱导 Syntenin 的细胞质和细胞核表达,并且以 Syntenin 和细胞质 IL5RA 依赖性方式诱导 Sox4 的表达。盖森等人(2001)得出结论,syntenin 在 IL5RA 介导的 SOX4 激活中充当衔接分子。他们还指出,缺乏 Il5ra 或 Sox4 的小鼠在 B 细胞发育方面存在缺陷。
齐默尔曼等人(2002)表明几种蛋白质的 PDZ 结构域与磷脂酰肌醇 4,5-二磷酸(PIP2) 结合。syntenin 与含有 PIP2 的脂质层的高亲和力结合需要其两个 PDZ 结构域。竞争和诱变实验表明,PDZ 结构域中的蛋白质和 PIP2 结合位点重叠。叠加分析表明 syntenin 的 2 个 PDZ 结构域协同结合同源肽和 PIP2。活细胞实验证明了 syntenin 的 PDZ 结构域的质膜结合的 PIP2 依赖性和肽依赖性模式。这些观察结果表明,磷酸肌醇浓度的局部变化控制了 PDZ 蛋白与其在质膜上的靶受体的结合。
Koroll 等人使用酵母 2-杂交和共沉淀分析(2001)发现大鼠 syntenin-1 和人 syntenin-2(SDCBP2; 617358 ) 的长同工型同源二聚体和异源二聚体。酵母 2-杂交分析表明 syntenin-1 的第二个 PDZ 结构域与几种跨膜蛋白的 C 末端尾部结合,包括神经肌成束蛋白(NFASC; 609145 )、前 TGF-α、syndecan-3(SDC3; 186357 )、ephrin B2(EFNB2; 600527 )、肝配蛋白受体 EPHA7( 602190 ) 和神经突蛋白 I(NRXN1; 600565 )。
▼ 测绘
Gross(2014)基于 SDCBP 序列(GenBank AF000652 ) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 SDCBP 基因对应到染色体 8q12.1。