RAS相关蛋白RAB6B

RAB6B 是小 GTP 酶的大 RAB 亚家族的成员,在细胞内转移路线的调节中起重要作用(Opdam 等人,2000)。

▼ 克隆与表达

Opdam 等人使用 RT-PCR,引物对应于结直肠腺癌细胞中 GTP 结合的保守 RAB 结构域(2000)克隆了 RAB6B。推断的 207 个氨基酸的蛋白质与 RAB6A( 179513 ) 有 91% 的相同,C 末端的差异最大。RAB6B 包含 6 个参与 GTP 结合的保守基序和一个参与异戊二烯化的 CxC 基序。Northern 印迹分析检测到主要存在于人脑和人神经母细胞瘤细胞系中的 1.35、3.1 和 5.6kb 转录物。免疫印迹分析显示 23-kD 蛋白的表达。免疫组织化学分析显示在神经母细胞瘤细胞的核周区域和高尔基体中表达。在人脑中,RAB6B 在小胶质细胞、周细胞和浦肯野细胞中表达。

▼ 基因功能

Opdam 等人使用 GTP 结合试验(2000)发现 RAB6B 的结合活性低于 RAB6A。两种蛋白质共定位在高尔基复合体。酵母 2 杂交分析表明,RAB6B 与 RAB6A 一样,与 KIF20A( 605664 ) 和 GAPCENA(RABGAP1; 615882 ) 相互作用。奥普丹等人(2000)得出结论,RAB6B 在神经元细胞中发挥细胞类型特异性功能。

通过酵母 2 杂交、共免疫沉淀和下拉分析,Wanschers 等人(2007)表明 RAB6B 与双尾 D1(BICD1; 602204 ) 相互作用。共聚焦显微镜显示 RAB6B 和 BICD1 在高尔基体和沿微管排列的囊泡共定位,并且两种蛋白质在神经母细胞瘤细胞的神经突中与动力蛋白(见600112 )共定位。万舍斯等人(2007 年)得出结论,通过 BICD1 的 RAB6B 与动力蛋白/动力蛋白(见601143)复合物有关,这表明 RAB6B 在神经元细胞中货物的逆行转移中具有调节作用。

Schlager 等人使用蛋白质下拉分析(2010)发现小鼠 Bicdr1(BICDL1; 617002 ) 与 Rab6b 的相互作用最强,其次是 Rab6a,与测试的其他 Rab 几乎没有结合。在酵母 2 杂交试验中,Bicdr1 的 C 末端区域包含第二个卷曲螺旋结构域,该结构域与组成型活性、GTPase 缺陷型 Rab6a 结合,但与非活性、GDP 锁定的 Rab6a 结合。Bicdr1 在人和猴上皮细胞中的过表达导致 Bicdr1 在中心体周围区域的积累以及 Rab6 阳性囊泡。在小鼠海马神经元的早期培养物中,Bicdr1 积累了 Rab6- 和 Npy( 162640)-以剂量依赖性方式围绕中心体的阳性分泌囊泡,限制顺行分泌转运,并抑制神经突生长。施拉格等人(2010)得出结论,RAB6 和 BICDR1 在分泌囊泡的逆行转移中起作用。

▼ 生化特征

加西亚-赛斯等人(2006)分别以 1.8 和 2.3 埃的分辨率确定了 RAB6B 的活性和非活性形式的晶体结构。

▼ 测绘

通过辐射混合分析,Opdam 等人(2000)将 RAB6B 基因对应到染色体 3q21-q23。

Gross(2014)根据 RAB6B 序列(GenBank AF498940 ) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 RAB6B 基因对应到染色体 3q22.1。