参与肝癌发生的剪接变体

通过代表性差异分析,然后进行数据库分析,并筛选出肝癌细胞系 cDNA 文库,Huang 等人(2003)克隆了他们称之为 SVH 的 ARMC10。推导出的 343 个氨基酸蛋白包含一个犰狳重复序列、一个 N 端细胞附着序列、一个 N 端跨膜结构域和 3 个 PKC 和 6 个酪蛋白激酶 II 磷酸化位点。Northern印迹分析在胎盘、肝脏、肾脏、心脏和大脑中高表达的所有测试组织中检测到一个主要的2.6-kb转录物。RT-PCR 分析确定了 4 个剪接变体,它们是由外显子 2 和 5 的可变剪接产生的,他们将其命名为 SVHA、SVHB、SVHC 和 SVHD。共聚焦显微镜和免疫荧光研究将所有剪接变体定位于内质网膜,并且 N 末端跨膜结构域是 ER 亚细胞定位所必需的。定量 RT-PCR 显示只有缺乏外显子 2 的 SVHB 在肝细胞癌样本中上调。

▼ 基因功能

黄等人(2003)表明 SVHB 变体的过表达加速了正常肝细胞系中的细胞生长并促进了裸鼠的肿瘤形成。SVHB mRNA 的反义抑制降低了肝癌细胞系的细胞生长并诱导细胞凋亡。

▼ 基因结构

黄等人(2003)确定 ARMC10 基因包含 7 个外显子,跨越约 25 kb。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Huang 等人(2003)将 ARMC10 基因对应到染色体 7q11.2。