NOP2/SUN RNA 甲基转移酶家族,成员 4
NSUN4 是一种 5-甲基胞嘧啶 RNA 甲基转移酶,被 MTERFD2( 615393 ) 募集到大核糖体亚基,这是核糖体生物发生必不可少的步骤( Spahr 等人,2012 年)。
▼ 克隆与表达
卡马拉等人(2011)确定推导的 384 个氨基酸 NSUN4 蛋白包含一个 RNA 甲基转移酶结构域,其功能基序从细菌到人类都是保守的。它还具有一个 N 端线粒体靶向序列,该序列被切割成以 arg26 开头的线粒体形式。尺寸排阻色谱显示,人 NSUN4 的线粒体形式的表观分子量为 33 kD,接近其预测的 40 kD 质量。
斯帕尔等人(2012)报道 NSUN4 包含一个典型的 5-甲基胞嘧啶 RNA 甲基转移酶核心结构域,该结构域具有识别 S-腺苷-L-蛋氨酸(SAM) 共底物和甲基转移酶活性所必需的活性位点残基。然而,NSUN4 缺乏相关 RNA 甲基转移酶中 RNA 识别所需的可变 N 端或 C 端延伸。
▼ 基因功能
通过免疫沉淀分析和尺寸排阻色谱,Camara 等人(2011)表明成熟的线粒体形式的 NSUN4 和 MTERF4 在 HeLa 细胞中相互作用形成表观分子量为 112 kD 的二聚体。在 HeLa 细胞中转染后,表位标记的 MTERF4-NSUN4 复合物与大的(39S) 线粒体核糖体亚基共迁移。通过 RNA 干扰敲低 MTERF4 可减少 NSUN4 对 39S 亚基的靶向作用。卡马拉等人(2011)得出结论,MTERF4 通过结合 NSUN4 和核糖体 RNA 的能力将 NSUN4 靶向核糖体 RNA。
▼ 生化特征
斯帕尔等人(2012)以 2.9 埃的分辨率描述了 NSUN4-MTERF4 异二聚体复合物的结构。MTERF4 通过保守的极性和疏水相互作用结合 NSUN4。带正电荷的 RNA 结合路径沿着 MTERF4 的凹面和凸面延伸,并进入甲基供体 SAM 结合位点附近的 NSUN4 活性位点。在 NSUN4 的活性位点裂隙内,SAM 的腺嘌呤环位于一个主要疏水的口袋中,SAM 的羰基结合了一个强碱性口袋。SAM 供体甲基指向将甲基转移到传入 RNA 所需的 2 个保守半胱氨酸附近的开放裂缝。
▼ 测绘
Hartz(2013)基于 NSUN4 序列(Genbank AK021577 ) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 NSUN4 基因对应到染色体 1p33。