核酸内切酶/核酸外切酶/磷酸酶家族结构域含蛋白 1
EEPD1 是一种 DNA 5 元核酸内切酶,可在停滞的复制叉处促进 DNA 双链断裂处的 5 元末端切除。EEPD1 是通过同源重组修复 DNA 所必需的( Wu et al., 2015 )。
▼ 克隆与表达
通过对从大小分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,Nagase 等人(2000)克隆了 EEPD1,他们将其命名为 KIAA1706。转录本在其 3 素末端具有重复元素,推导出的蛋白质含有 573 个氨基酸。RT-PCR ELSA 在所有检查的成人和胎儿组织中检测到可变的 KIAA1706 表达,在胎儿和成人大脑以及成人脊髓和骨骼肌中表达最高。在检查的特定成人大脑区域内,在黑质中检测到最高的 KIAA1706 表达。
吴等人(2015)报道,全长 569 个氨基酸的 EEPD1 蛋白具有 2 个 N 端螺旋-发夹-螺旋 DNA 结合结构域和一个 C 端 DNAse 1(DNASE1; 125505 ) 样结构域。它还有一个与 N 端和 C 端结构域重叠的核酸酶活性位点。RT-PCR 和蛋白质印迹分析检测到广泛的 EEPD1 表达,在睾丸、白细胞和大脑中水平最高。
▼ 基因功能
Wu 等人使用蛋白质组学筛选(2015)发现 EEPD1 表达在 DNA 损伤后在人类胚胎干细胞中上调。通过小干扰 RNA 消耗人类细胞系中的 EEPD1 会增加 S 期和 G2 期细胞的比例,抑制细胞增殖,并导致基因组不稳定。敲低和过表达研究表明,EEPD1 通过其 5 素突出端内切核酸酶活性促进 DNA 双链断裂处受压复制叉的重新启动,从而通过同源重组启动 DNA 损伤修复。同时,EEPD1 通过经典的非同源末端连接和微同源介导的末端连接抑制 DNA 损伤修复。EEPD1 被迅速招募到停滞的复制叉中。EEPD1 与 EXO1 共免疫沉淀( 606063)、RPA32(RPA2; 179836 ) 和 BLM(RECQL3; 604610 ),是将 DNA 修复组分加载到受损复制叉上以及下游激活 ATR( 601215 )/CHK1(CHEK1; 603078 ) 和磷酸化 H2AX(H2AFX) 所必需的; 601772 )。
▼ 测绘
吴等人(2015)指出 EEPD1 基因对应到染色体 7p14.2。