米切尔-莱利综合征; 调节因子 X , 6
RFX6 是调节因子 X(RFX) 转录因子家族的成员(参见RFX1,600006)(Aftab 等人,2008)。
▼ 克隆与表达
通过数据库分析来搜索包含 RFX DNA 结合域(DBD) 的序列,Aftab 等人(2008)确定了 RFX6 和 5 个相应的哺乳动物直系同源物。推导出的 928 个氨基酸蛋白是带翼螺旋家族的 DNA 结合蛋白的成员,与 DBD 具有高度相似性,与 RFX4 的总体相似性最高( 603958 )。RFX6 包含一个带翼的螺旋区域,预计与 DNA 的大沟相互作用,以及一个保守的螺旋 H3,预计与小沟相互作用。EST 数据库分析显示,RFX6 主要在胰腺中表达,而在肝脏中表达较低,这通过小鼠 SAGE 文库的分析得到证实。
▼ 基因结构
阿夫塔布等人(2008)确定 RFX6 基因包含 19 个外显子。
▼ 测绘
通过数据库分析,Aftab 等人(2008)将 RFX6 基因对应到染色体 6q22.2。
▼ 基因功能
通过对蛋白质相互作用的大规模酵母 2-杂交蛋白质组分析,Aftab 等人(2008)确定 RFX6除了与 DTX1( 602582 )、DTX2( 613141 )、FHL3( 602790 )、CCNK( 603544 ) 和SS18L1( 606472 ) 相互作用外,还与 RFX 家族成员 RFX2( 142765 ) 和 RFX3( 601337 ) 相互作用)。
史密斯等人(2010)证明小鼠中的转录因子 Rfx6 指导 Neurog3 下游的胰岛细胞分化( 604882 )。缺乏 Rfx6 的小鼠不能产生任何正常的胰岛细胞类型,但产生胰腺多肽的细胞除外。
黄等人(2014 年)发现 RFX6 基因内含子 4 中的一个进化保守区域作为具有等位基因特异性活性的转录增强子发挥作用。该区域中单核苷酸多态性(SNP) 的 T 等位基因rs339331增强 HOXB13( 604607 ) 染色质结合并驱动 RFX6 的等位基因特异性上调。
▼ 分子遗传学
米切尔-莱利综合征
史密斯等人(2010)分析了 6 名患有新生儿糖尿病、发育不全或环状胰腺、肠闭锁和/或旋转不良、胆囊发育不全或发育不全(Mitchell-Riley 综合征;MTCHRS;615710)患者的候选基因 RFX6,并确定了6 名先证者中有 5 名出现 RFX6 突变(612659.0001 - 612659.0006)。作者指出,3 名具有导致功能完全丧失的突变的患者在生命的最初几个月内死亡,而 2 名具有与残余功能相关的突变的患者分别在 4.5 年和 9 岁时仍存活。
Sansbury 等人在两名患有 Mitchell-Riley 综合征的 9 岁土耳其双亲表亲中(2015)确定了 RFX6 基因中 2 个无义突变的复合杂合性(R726X,612659.0007;R866X,612659.0008)。注意到 2 名受影响的表亲表现出比先前报道的患者相对温和的表型,作者认为他们的突变可能导致 RFX6 的不完全失活。
前列腺癌易感性
黄等人(2014)发现染色体 6q22 上的前列腺癌( 176807 ) 风险相关 SNP,rs339331,位于作为 HOXB13 结合位点起作用的转录因子 RFX6 基因的内含子 4 的进化保守区域内。rs339331处与风险相关的 T 等位基因增加了 HOXB13 与转录增强子的结合,从而赋予了 RFX6 的等位基因特异性上调。RFX6 的抑制会减少前列腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭。临床数据表明,人前列腺癌中的 RFX6 上调与肿瘤进展、转移和生化复发风险相关。黄等人(2014)观察到rs339331的风险相关 T 等位基因与人前列腺肿瘤中 RFX6 mRNA 水平增加之间存在显着关联。作者得出结论,rs339331通过与前列腺癌易感基因 HOXB13 的功能相互作用改变 RFX6 表达来影响前列腺癌风险。
▼ 动物模型
史密斯等人(2010)产生了 Rfx6-null 小鼠。他们还生成了 Rfx6 基因座以 β-半乳糖苷酶表达为标志的小鼠,这些研究表明,Rfx6 在原肠胚形成后最初在定形内胚层中广泛表达,并在妊娠中期局限于肠道和胰芽。此外,Rfx6 在胰岛祖细胞中被 Neurog3 重新激活,并且也仅限于成熟胰腺中的胰岛。Rfx6-null 小鼠以预期的孟德尔比率出生,但未能正常进食,表现出大肠膨胀至小肠梗阻,并在产后 2 天内死亡。一些 Rfx6-null 小鼠的胰腺大小也减小了。为了测试对出生前基因表达的影响,Smith 等人(2010)从胚胎第 17.5 天的胰腺中收集 RNA,结果表明,除胰多肽(Ppy) 外,无效小鼠几乎没有胰岛激素基因的表达。
▼ 等位基因变体( 8个精选示例):
.0001 米切尔-莱利综合征
RFX6、IVS2、TC、+2
一名女婴,由近亲巴基斯坦父母所生,患有新生儿糖尿病、十二指肠和空肠闭锁、环状胰腺和胆囊发育不全(MTCHRS; 615710 ),最初由Mitchell 等人报道(2004 年)作为“家庭 1”,史密斯等人(2010)在 RFX6 基因的内含子 2 中的供体剪接位点确定了 +2T-C 转换的纯合性。未受影响的父母是突变的杂合子。从患者的尸检胰腺中扩增 RFX6 mRNA,该患者在 6.5 个月时死于多器官衰竭,证明没有正常剪接的转录本,并且在剪接突变上游的外显子 1 和 2 中未检测到 RNA,与无意义介导的衰变。该患者的已故哥哥患有类似疾病,患有新生儿糖尿病、卵圆孔未闭、十二指肠和空肠闭锁以及胰腺和胆囊发育不全,在 5 个月大时死于多器官衰竭。
.0002 米切尔-莱利综合征
RFX6、IVS1AS、AG、-12
一名女婴通过体外受精与捐赠的卵子受孕并患有新生儿高血糖、十二指肠网旋转不良以及胰腺和胆囊发育不全(MTCHRS; 615710 ),最初由Mitchell 等人报道(2004),史密斯等人(2010)确定了 RFX6 基因中剪接位点突变的复合杂合性:内含子 1 中受体位点的 -12A-G 转换和内含子 6 供体位点的 +2T-G 颠换( 612659.0003 )。患者在 9 岁时还活着,并且间歇性地停用胰岛素。
.0003 米切尔-莱利综合征
RFX6、IVS6、TG、+2
讨论Smith 等人在 Mitchell-Riley 综合征(MTCHRS; 615710 )患者中发现的 RFX6 基因内含子 6 供体位点的 +2T-G 颠换(2010),见612659.0002。
.0004 米切尔-莱利综合征
RFX6、SER217PRO
Chappell 等人先前报道的一名巴基斯坦女孩,其第一代表亲父母患有新生儿糖尿病、十二指肠闭锁、胆囊发育不全和肛门前位(MTCHRS; 615710 )(2008),史密斯等人(2010)鉴定了 RFX6 基因外显子 5 中 ser217 到 pro(S217P) 取代的纯合性,在 DNA 结合域和二聚化域之间的高度保守残基处。功能分析表明,S217P 仅适度降低 DNA 结合,不影响二聚体形成。该患者在超声检查中没有发现胰腺异常,存活 4.5 岁并且依赖胰岛素。未受影响的父母是突变的杂合子。
.0005 米切尔-莱利综合征
RFX6、ARG181GLN
在一名男婴中,该男婴由摩洛哥血统的近亲所生,患有先天性血色素沉着症、新生儿糖尿病、十二指肠和空肠闭锁、肠旋转不良、胰腺发育不全和胆囊发育不全(MTCHRS; 615710 ),最初由Martinovici 等人报道(2010),史密斯等人(2010)确定了 RFX6 基因外显子 4 中 arg181 到 gln(R181Q) 替换的纯合性。功能分析表明,改变 DNA 结合域中高度保守的氨基酸的 R181Q 突变完全消除了 DNA 结合。患者在生命的第三个月死亡。患有胰岛素依赖型糖尿病的母亲和空腹血糖受损的父亲都是该突变的杂合子。
.0006 米切尔-莱利综合征
RFX6、13-BP DEL、内含子/外显子 7
Smith 等人在出生后第 2 天(MTCHRS;615710)诊断出患有宫内发育迟缓和十二指肠闭锁的非近亲父母所生的男婴中(2010)确定了一个框外 13 bp 缺失的纯合性,包括 RFX6 基因外显子 7 的最后 5 个核苷酸和内含子 7 的前 8 个核苷酸。患者病程复杂,在 2.5 月龄时死于胃肠道出血。在怀孕期间患有妊娠糖尿病的母亲和被诊断患有 1 型糖尿病的父亲都是该突变的杂合子。
.0007 米切尔-莱利综合征
RFX6、ARG726TER
Sansbury 等人在两个患有 Mitchell-Riley 综合征( 615710 )的 9 岁土耳其双亲表亲中(2015)确定了 RFX6 基因中 2 个突变的复合杂合性:外显子 17 中的 c.2176C-T 转换,导致 arg726 到 ter(R726X) 取代,以及外显子 18 中的 c.2596C-T 转换,导致 arg866-to-ter(R866X; 612659.0008 ) 替换。4 位亲本各为 1 个突变的杂合子。注意到这 2 名受影响的表亲表现出比先前报道的患者相对温和的表型,包括糖尿病发病较晚,除了 1 名患者没有胆囊外没有肝脏病理学,以及更大的生存年龄,作者认为他们的突变可能导致不完全RFX6 的失活。
.0008 米切尔-莱利综合征
RFX6、ARG866TER
用于讨论 RFX6 基因的外显子 18 中的 c.2596C-T 转换,导致 arg866 到 ter(R866X) 取代,这在 2 位患有 Mitchell-Reilly 综合征的土耳其表亲的复合杂合状态中发现( 615710 )桑斯伯里等人(2015),见612659.0007。