微 RNA 24-1
微小 RNA(miRNA) 是 20 到 25 个核苷酸的非编码 RNA,可调节基因表达。全长 miR24-1 前体被加工成 2 个成熟的 miRNA,miR189 和 miR24。第二个不同的基因 MIRN24-2( 610724 ) 也编码成熟的 miR24 序列( Abelson et al., 2005 ; Fu et al., 2005 )。
▼ 克隆与表达
傅等人(2005)从人胎肝 cDNA 文库中克隆了 miR24。miR24 序列是 UGGCUCAGUUCAGCAGGAACAG。
阿贝尔森等人(2005)发表了全长 miR24-1 的序列,这是一种 68 个核苷酸的 miRNA 前体,可加工成 2 个成熟的 miRNA,即 miR189 和 miR24。23 个核苷酸的 miR189 和 22 个核苷酸的 miR24 分别来自 miR24-1 的 5' 和 3' 末端。产后小鼠大脑的原位杂交检测到新皮质、海马、丘脑、基底神经节和小脑中的 miR189 表达。在人胎脑中,miR189在皮质板和中间区高表达。
▼ 基因功能
miR24
使用微阵列分析,van Rooij 等人(2006)在 2 个孤立的心脏肥大小鼠模型中上调的一组 miRNA 中鉴定出 miR24。Northern印迹分析显示miR24在特发性终末期衰竭人类心脏中的表达增加。培养的大鼠心肌细胞中 miR24 的过表达导致肥大性生长。转基因小鼠中 miR24 的心脏过表达是胚胎致死的。
米什拉等人(2007)表明 miR24 下调 DHFR( 126060 ) 的表达,并且 DHFR 转录本中 miR24 结合位点附近的 3 素 UTR 中的 829C-T SNP 干扰 miR24 结合并导致 DHFR 过表达。由于 DHFR 对甲氨蝶呤的代谢增加,SNP 与对化疗药物甲氨蝶呤的耐药性有关。
王等人(2008)发现 miR24-1通过下调激活素受体 ACVR1B( 601300 ) 的表达来调节红白血病 K562 细胞和 CD34( 142230 ) 阳性人脐带血造血祖细胞(HPC) 中的红细胞分化。miR24-1 通过与 ACVR1B 转录本的 3 素非翻译区中至少 1 个推定的 miR24 结合位点结合,降低了 mRNA 和蛋白质水平的 ACVR1B 表达。Stem-loop RT-PCR 分析显示成熟的 miR24 在 HPCs 中含量丰富,但在分化培养基中 3 天后其表达下降,miR24-1 表达降低后 ACVR1B 表达增加。通过用 miR24-1/miR189 前体载体转染 HEK293 细胞,Wang 等人(2008)还表明这些 miRNA 的表达可以解耦:miR189 在该系统中不表达。
miR189
阿贝尔森等人(2005)在 2 名抽动秽语综合征(GTS; 137580 ) 患者中发现了 SLITRK1 基因( 609678 )的 3 素 UTR 中 miR189 结合序列中的点突变( 609678.0002 )。为了检查这种突变对基因表达的影响,他们将全长 SLITRK1 3-prime UTR 插入报告基因的下游,并将构建体转染到小鼠神经母细胞瘤细胞系中。在 miR189 存在的情况下,SLITRK1 的表达下调,而增加 miR189 和 SLITRK1 之间结合的突变导致 SLITRK1 表达的进一步下调。
▼ 动物模型
推测DICER1( 606241 ) 介导哺乳动物中所有 miRNA 的加工。Otsuka 等人使用基因陷阱方法(2007 年)获得了 Dicer1 功能缺陷的小鼠,由于 Dicer1 表达亚型而没有经历胚胎致死。对这些小鼠腹腔巨噬细胞中病毒生长的分析揭示了对水疱性口炎病毒(VSV) 和单纯疱疹病毒 1 病毒的易感性,但对其他测试的病毒不敏感。对 VSV 的易感性不是由于增加的 VSV 细胞进入,也不是由于 I 型干扰素(例如,IFNA;147660)产生或 IFN 反应的缺陷。用含有 VSV 序列的质粒转染的小鼠巨噬细胞系的报告基因分析表明,miR24 和 miR93( 612984),它们在细胞系和腹腔巨噬细胞中均有表达,分别靶向编码病毒 RNA 依赖性聚合酶和聚合酶辅因子的 VSV 基因。进一步分析表明,miR24 和 miR93 抑制了小鼠巨噬细胞中 VSV 的增殖。缺乏 miR24 和 miR93 靶位点的 VSV 在野生型小鼠中比野生型 VSV 更具致病性。大冢等人(2007)得出结论,由于 Dicer1 缺陷导致 miR24 和 miR93 产生的损害导致对 VSV 的易感性增加。
▼ 测绘
土屋等人(2006)报道 MIRN24-1、MIRN23B( 610723 ) 和 MIRN27B( 610636 ) 基因聚集在染色体 9q22 上。
Hartz(2005)根据 MIRN24-1 序列( Abelson et al., 2005 ) 与基因组序列(build 35) 的比对,将 MIRN24-1 基因对应到染色体 9q22.32。
傅等人(2005)指出 miR24 由 9 号染色体(MIRN24-1) 和 19 号染色体(MIRN24-2) 上的基因编码。