LSM2蛋白

基于与 Sm 蛋白家族的序列同源性，在多种生物体中鉴定了 Sm 样蛋白（参见 SNRPD2；601061）。Sm 样蛋白包含 Sm 序列基序，该基序由 2 个区域组成，由一个可变长度的接头隔开，该接头折叠成一个环。Sm 样蛋白被认为形成存在于 tri-snRNP 颗粒中的稳定异聚体，这对于前 mRNA 剪接很重要。

▼ 克隆与表达

在寻找人类 Sm 样蛋白时，Achsel 等人（1999）纯化的（U4/U6.U5） tri-snRNP 中存在的分级蛋白质和分离的 7 种 Sm 样蛋白质，他们将其命名为 LSm2-LSm8。他们使用部分肽序列进行数据库搜索，鉴定并测序了 EST 克隆。使用通过对 HeLa cDNA 文库进行 PCR 扩增获得的额外序列，他们组装了 LSM2-LSM8 的全长 cDNA 序列。

萨尔加多-加里多等人（1999）搜索了 Sm 蛋白的数据库序列，并确定了酵母中 16 个潜在的 Sm 相关基因以及人类和古细菌中的一些 Sm 相关基因。使用 Sm 结构域的多序列比对，他们构建了酵母、人类和古细菌 Sm 和 Sm 样蛋白的系统发育树。

▼ 基因功能

使用电子显微镜，Achsel 等人（1999）观察到纯化的 LSm 蛋白形成一种即使在没有 RNA 的情况下也很稳定的异聚体，并表现出类似于 Sm 核心 RNP 结构的甜甜圈状结构。他们证明纯化的 LSm 异聚体在 U6 snRNA 的 3-prime 末端 U-tract 处特异性结合。他们还表明，LSm 蛋白在体外促进 U4/U6 RNA 双链体的形成，并得出结论，LSm 蛋白可能在 U4/U6 snRNP 形成中起作用。

Salgado-Garrido 等人使用免疫沉淀实验（1999）得出结论，酵母中存在与 RNA 结合的 7 种 Sm 样蛋白质的复合物。Lsm2-Lsm8 共沉淀 U4、U5 和 U6 snRNA，并直接与游离 U6 snRNP 中的 U6 snRNA 结合。此外，发现酵母 Lsm2-Lsm7 蛋白与 pre-RNase P RNA 相关，但与成熟 RNase RNA 无关。Salgado-Garrido 等人使用人类细胞提取物的免疫沉淀实验（1999）表明 LSM3 和 LSM4 蛋白与含有 U6 snRNA 的 snRNP 复合物特异性相关。萨尔加多-加里多等人（1999）得出结论，Sm 和 Sm 样蛋白在至少 2 个具有深层进化起源的功能保守复合物中组装。

通过破坏酵母中的 Sm 和 Sm 样基因，Salgado-Garrido 等人（1999）得出结论，编码与 U6 snRNA（Lsm2-8） 直接相关的 Sm 样蛋白的基因的破坏产生了可变的表型。Lsm2、Lsm3、Lsm4 和 Lsm8 对营养生长至关重要。Lsm5、Lsm6 和 Lsm7 对生长不是必需的；然而，它们的破坏会导致生长缓慢，尤其是在高温下。在含有 Lsm5、Lsm6 和 Lsm7 破坏的菌株中，U6 snRNA 的水平显着降低。Lsm1 和 Lsm9 对于营养生长是可有可无的，但 Lsm1 是 30 度最佳营养生长所必需的，并且对温度敏感。

英格芬格等人（2002）确定人类 LSM1 到 LSM7，但不是 LSM8，在细胞质病灶内的 HeLa 细胞中表达。该病灶还含有一种脱帽酶（DCP1/2） 和外切核酸酶 XRN1（ 607994 ）。野生型和突变型 LSM 蛋白的共表达以及荧光共振能量转移表明 LSM 蛋白形成了一种类似于酵母中发现的复合物。英格芬格等人（2002）得出结论，该病灶包含部分或完全组装的 mRNA 降解机制。

▼ 测绘

International Radiation Hybrid Mapping Consortium 将 LSM2 基因对应到 6 号染色体（ sts-AA035265 ）。