SIX 同源基因 4
脊椎动物的六基因是果蝇'sine oculis'(so) 基因的同源物,主要在果蝇发育中的视觉系统中表达。SIX 基因家族的成员编码的蛋白质具有不同的 DNA 结合同源结构域和上游 SIX 结构域,这可能参与确定 DNA 结合特异性和介导蛋白质-蛋白质相互作用。SIX 家族中的基因已被证明在脊椎动物和昆虫发育中发挥作用或与组织分化状态的维持有关(Boucher 等人总结,2000)。
▼ 克隆与表达
川上等人(1996)将小鼠体内的 Six4 鉴定为一种转录因子,称为 AREC3,它与 Na,K-ATPase α-1 亚基基因启动子的正调控元件(ARE 位点)结合( 182310 )。奥托等人(1998)确定 Six4 在小鼠中的表达分布在发育中的大脑和脊髓的外套层、各种神经节、一些感觉器官和体节。
Ozaki 等人使用小鼠 Six4 cDNA 筛选人类 BAC 文库(1999)克隆了人类 SIX4 并通过搜索 EST 数据库分离了部分 cDNA 克隆。人类 SIX4 编码一个 781 个氨基酸的蛋白质,该蛋白质在六域和同源域内与其小鼠对应物具有 90% 的整体序列同一性和 100% 的同一性,表明这些蛋白质具有相同的 DNA 结合特异性。
▼ 基因结构
使用序列分析,Ozaki 等人(1999)确定小鼠和人类 SIX4 均由 3 个外显子编码。
▼ 测绘
通过荧光原位杂交,Ozaki 等人(1999)将人类 SIX4 基因对应到具有 SIX1 和 SIX6( 606326 ) 基因的簇中的染色体 14q23。
▼ 动物模型
Ozaki 等人使用基因靶向技术(2001)通过用框内报告基因替换 Six4 基因的一部分,产生了 Six4 缺陷小鼠。报告基因在杂合子小鼠中的表达表明,Six4 在颅和背根神经节、体节、耳和鼻基板、鳃弓、Rathke 袋、肢芽顶端外胚层脊和中肾中表达。纯合突变小鼠没有表现出形态异常并且听力明显正常。尾崎等人(2001)假设 Six 基因家族的其他成员可以弥补 Six4 的损失。