CXXC 手指蛋白 1
在其 DNA 结合域内包含 CXXC 基序的蛋白质,例如 CXXC1,识别 CpG 序列并调节基因表达(Carlone 和 Skalnik,2001)。
▼ 克隆与表达
通过使用 CpG 基序探针筛选骨髓细胞 cDNA 文库,然后进行 EST 数据库分析,Voo 等人(2000)克隆了全长 CXXC1,他们称之为 CGBP。推导出的 656 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 76 kD。CGBP 包含一个 N 末端 PHD 结构域,随后是一个 CXXC 结构域、一个中央基本区域、一个卷曲螺旋结构域和一个靠近其 C 末端的不完美 PHD 结构域。Northern 印迹分析在所有检查的组织中检测到 2.6-kb CGBP 转录物。骨髓细胞系的核提取物的蛋白质印迹分析检测到表观分子量为 88 kD 的内源性 CGBP。
Fujino 等人在成纤维细胞 cDNA 文库的 1 杂交筛选中使用胶原酶基因( 120353 )上游元件的串联重复序列(2000)克隆了 CXXC1,他们称之为 PCCX1。他们在 CXXC1 中的碱性区域之前确定了一个酸性区域,以及 2 个潜在的 PEST 序列和几个类似于核定位信号的序列。
使用免疫荧光染色,Tian 等人(2018)发现 Cxxc1 在所有减数分裂阶段都存在于精子细胞核中,直到在精子细胞中降至无法检测到的水平。
▼ 基因功能
Voo 等人(2000)证明 CGBP 结合了一个含有 CpG 基序的探针。CGBP 未能结合其中 CpG 基序发生突变或甲基化的寡核苷酸,并且它不结合单链 DNA 或 RNA 探针。将 CpG 二核苷酸引入不相关的寡核苷酸序列足以产生 CGBP 的结合位点。电泳迁移率变动分析通过内源性 CGBP 检测到 DNA 结合活性。CGBP 在使用含有 CpG 基序的启动子的报告基因测定中显示出反式激活活性。
藤野等人(2000)发现 CXXC1 的酸性区域显示出高反式激活能力,但由于抑制酸性区域的区域,包括 C 末端区域,全长蛋白无活性。他们发现 CXXC1 在细胞衰老和永生化的所有阶段都以组成型形式表达,但在蛋白质水平上,随着细胞接近危机,出现了缺乏 C 末端区域的较短形式。藤野等人(2000)得出结论,CXXC1 被去除 C 末端抑制区的蛋白水解切割激活。
Lee 和 Skalnik(2002)发现内源性 CGBP 定位于人和小鼠细胞系中的核斑点。斑点集中在 DAPI 光染色区域,与 CGBP 定位于细胞核的常染色区域一致。CGBP 几乎完全与分级细胞的核基质部分相关。突变分析表明,蛋白质的酸性、碱性和卷曲螺旋结构域内的多个区域提供协同信号,从而导致斑点核分布。
通过免疫沉淀和质谱分析,Lee 和 Skalnik(2005)确定 CXXC1,他们称为 CFP1,是哺乳动物 Set1 组蛋白 H3-Lys4 甲基转移酶复合物的一个组成部分(见611052)。共聚焦显微镜显示 CXXC1 和 Set1 共定位于与常染色质相关的核斑点。缺乏 CXXC1 的小鼠胚胎干细胞在诱导分化后表现出 4 倍过量的组蛋白 H3-K4 甲基化,表明 CXXC1 限制了 Set1 组蛋白甲基转移酶的活性。Lee 和 Skalnik(2005)提出,除了胞嘧啶甲基化外,CXXC1 还是组蛋白修饰的关键表观遗传调节因子。
通过寻找所有 CpG 岛共有的蛋白质,Thomson 等人(2010)发现 Cfp1 高度富集,它在体外选择性地结合非甲基化 CpG。单等位基因甲基化 CpG 岛的染色质免疫沉淀证实 Cfp1 与体内非甲基化 CpG 位点特异性相关。Cfp1 结合染色质的高通量测序确定了与小鼠大脑中非甲基化 CpG 岛和 H3K4me3 位点的显着一致性。CpG 岛的 H3K4me3 水平在 Cfp1 耗尽的细胞中显着降低,这与 Cfp1 与 H3K4 甲基转移酶 Setd1 相关的发现一致(参见611052)。为了测试非甲基化 CpG 密集序列是否足以建立 H3K4me3 的结构域,Thomson 等人(2010)分析了整合到小鼠基因组中的人工 CpG 簇。尽管没有启动子,插入招募 Cfp1 并创造了 H3K4me3 的新峰。Thomson 等人的数据(2010)指出,非甲基化 CpG 岛的主要功能是通过与 Cfp1 和其他可能发现 CpG 的蛋白质的相互作用来遗传影响局部染色质修饰状态。
使用免疫共沉淀,Tian 等人(2018)表明 Cxxc1 与 Prdm9( 609760 ) 相互作用并与小鼠精母细胞中 的三甲基化组蛋白 3(参见602810 ) 赖氨酸 4(H3K4me3) 结合。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Fujino 等人(2000)将 CXXC1 基因对应到染色体 18q21.1。使用 Southern 印迹分析,Voo 等人(2000)确定 CXXC1 是单拷贝基因。
▼ 动物模型
通过同源重组,Carlone 和 Skalnik(2001)创造了缺乏 Cgbp 的小鼠。没有获得可行的 Cgbp 无效动物,并且在交配后 6.5 和 12.5 天(dpc) 之间没有获得 Cgbp 无效胚胎。在 6.5 dpc 时,大约四分之一的植入部位看起来是空的,没有完整的胚胎。Cgbp 无效囊胚是可行的并且能够孵化和形成内细胞团和滋养外胚层。Carlone 和 Skalnik(2001)得出结论,CGBP 对于种植体周围发育至关重要。
田等人(2018)发现具有生殖细胞特异性 Cxxc1 敲除的雄性小鼠具有生育能力,睾丸大小正常,没有可检测到的精子发生缺陷,生殖细胞凋亡也没有增加。相比之下,尽管卵巢形态和卵泡形成正常,但 Cxxc1 生殖细胞特异性敲除雌性小鼠是不育的。进一步的研究表明,尽管 Cxxc1 与精母细胞中的 Prdm9 和 H3K4me3 相互作用,但它对于小鼠的减数分裂重组并不是必需的。Cxxc1 不是 Prdm9 在热点结合所必需的,它们随后被 Prdm9 依赖的 H3K4 三甲基化激活,或 DNA 双链断裂形成、修复或交叉形成。