高机动性组框 4
高迁移率组 B 蛋白家族的成员,例如 HMGB4,充当将染色质组织成活性和非活性染色质结构域的核结构因子(Catena 等人的总结,2009)。
▼ 克隆与表达
卡特纳等人(2009)从成人睾丸 cDNA 文库中克隆出小鼠 Hmgb4,并通过数据库分析,他们鉴定出人类 HMGB4。推断的小鼠和人类蛋白质分别含有 181 和 186 个氨基酸。HMGB4 具有 HMGB 框 A 和 B,但缺少其他 HMGB 家族成员中发现的酸性尾巴。小鼠组织的RT-PCR检测到Hmgb4在睾丸中高表达,在脑和肾中表达较弱,但在卵巢、肺、肝或肠中均未检测到。蛋白质印迹分析仅在睾丸中检测到表观分子量为 20 kD 的 Hmgb4。发育中的小鼠睾丸在常染色质中显示出动态 Hmgb4 表达,特别是在晚期粗线期精母细胞和圆形精子细胞中。Hmgb4 也在支持细胞核中表达。在伸长的精子细胞中,Hmgb4 定位于细胞核的基极。数据库分析仅在脊椎动物中检测到 HMGB4 的直系同源物。
通过 RT-PCR,Abraham 等人(2013)检测到从胚胎日(E) 12.5 小鼠培养的胚胎神经干细胞中 Hmgb4 的表达。在 E12 神经干细胞中未检测到 Hmgb4 表达,但在从 E14.5 和 E17.5 之间的胚胎培养的神经干细胞中是稳定的。
▼ 基因功能
通过小鼠睾丸核部分的核酸酶消化,Catena 等人(2009)发现 Hmgb4 与染色质相关。在小鼠中敲除 H1fnt 导致 Hmgb4 从细胞核的基极错误定位到更随机的分布。在转染的 GC-1 小鼠精原细胞中,Hmgb4 以剂量依赖性方式抑制报告基因的激活。
Rouhiainen 等人(2016)发现 HMGB4 与 C6 大鼠胶质母细胞瘤细胞的核部分中的核心组蛋白相互作用,但不与连接组蛋白相互作用。HMGB4 级分也显示出升高的 HDAC(参见 HDAC1, 601241 ) 活性。在人 NTERA2 畸胎癌细胞中敲除 HMGB4 会降低组蛋白 H3(参见602810)乙酰化,并提高组蛋白 H2a(参见613499)和 H4(参见602822)乙酰化和组蛋白 H3 lys27 三甲基化。对人和小鼠细胞的过表达和敲低研究表明,HMGB4 调节 PPP1R14A( 608153 ) 的表达,这是一种调节细胞粘附的关键磷酸酶,以及 NEUROD1( 601724),一种有效的神经分化因子。HMGB4 也被预测可以调节参与神经元前体细胞成熟和分化的基因。
▼ 基因结构
卡特纳等人(2009)确定 HMGB4 是一个无内含子基因。
▼ 测绘
Rouhiainen 等人(2016)指出 HMGB4 对应到 CSMD2 基因的内含子( 608398 )。
Hartz(2017)根据 HMGB4 序列(GenBank BC021180 ) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 HMGB4 基因对应到染色体 1p35.1。
卡特纳等人(2009)通过数据库分析将小鼠 Hmgb4 基因对应到 4 号染色体。