智力低下、上颌前突、斜视; SINE OCULIS 结合蛋白同源物
伯克等人(2010)在 6 号染色体区域内确定了与综合征和非综合征智力障碍相关的 SOBP( 613671 )。推导出的 873 个氨基酸蛋白包含一个 N 端核定位信号(NLS),然后是 2 个 FCS 型锌指基序、一个富含脯氨酸的区域(PR1)、一个推定的 RNA 结合基序区域和一个 C-末端 NLS 嵌入第二个富含脯氨酸的基序(PR2)。伯克等人(2010)还鉴定了编码推断的232个氨基酸蛋白质的变体。SOBP 在各种人体组织中表达。在胚胎第 14 天,原位杂交检测到整个发育中的小鼠大脑中的 Sobp 表达,皮质板中有强烈的染色。在出生后和成年小鼠大脑中,Sobp 在所有神经元中均有表达,边缘系统染色强烈。V层皮质神经元、海马、梨状皮质、丘脑背内侧核、杏仁核和下丘脑中表达最高。Sobp 在边缘系统中的出生后表达对应于活跃的突触发生时间。
▼ 基因结构
伯克等人(2010)确定 SOBP 基因跨越约 171 kb 并包含 7 个外显子,其中最后一个是未翻译的。CpG 岛与上游启动子和外显子 6 内的第二个推定启动子相关。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Birk 等人(2010)将 SOBP 基因对应到染色体 6q21。
▼ 分子遗传学
Basel-Vanagaite 等人报告了来自以色列阿拉伯近亲家庭的 7 名受影响的同胞,他们患有智力低下、上颌前突和斜视(MRAMS; 613671 )(2007),伯克等人(2010)鉴定了 SOBP 基因中的纯合突变(R661X; 613667.0001 )。
▼ 动物模型
Jackson circler(jc) 突变小鼠携带 Sobp 基因突变,并表现出与 Corti 器官异常和缺乏前庭诱发电位相关的盘旋行为。使用蛋白质组学分析,Birk 等人(2010)确定了 24 种在 jc/jc 脑中与 +/jc 脑相比异常表达的蛋白质,包括 2 种相互作用的蛋白质,dynamin(见602377)和 Pacsin1(606512)。
▼ 等位基因变体( 1 示例):
.0001 智力低下、上颌前突和斜视
SOBP,ARG661TER
Basel-Vanagaite 等人报告了来自以色列阿拉伯近亲家庭的 7 名受影响的同胞,他们患有智力低下、上颌前突和斜视(MRAMS; 613671 )(2007),伯克等人(2010)在 SOBP 基因的外显子 6 中发现了纯合 1981C-T 转换,导致 arg661 到 ter(R661X) 替换。预计该突变会导致蛋白质的 212 个残基被截断,这将导致第二个富含脯氨酸的结构域(PR2) 以及 C 端 NLS 和可能对蛋白质的功能。在来自以色列阿拉伯人的 300 条对照染色体中未观察到该突变。伯克等人(2010)表明在突触发生期间边缘系统中 SOBP 基因的破坏导致这些患者的认知异常。