微RNA 193B
MicroRNA(miRNA),例如 MIR193B,主要通过与靶 mRNA 的 3 素 UTR 结合,从而在转录后调节基因表达,导致 mRNA 不稳定或翻译抑制(Leivonen 等人,2011 年)。
▼ 克隆与表达
莱沃宁等人(2011)将成熟的人类 MIR193B 序列报告为 AACUGGCCCUCAAAGUCCCGCU。
孙等人(2011)将成熟小鼠 Mir193b 序列报告为 AACUGGCCCACAAAGUCCCGCU。数据库和 RT-PCR 分析表明,位于小鼠 16 号染色体 5-kb 区域内的Mir193b 和 Mir365(MIR365A; 614735 ) 是共转录的。14 个小鼠组织的实时 PCR 显示 Mir193b 和 Mir365 在棕色脂肪中高表达。Mir193b 在其他组织中表达较弱,包括附睾和皮下白色脂肪。Mir193b 和 Mir365 在棕色脂肪细胞培养物中的脂肪生成过程中均高度表达。
▼ 基因结构
徐等人(2011)确定了串联 MIR193B 和 MIR365A 基因上游的转录起始位点。他们确定了共同启动子区域内 SP1( 189906 ) 和 NF-kappa-B(参见164011 ) 的功能结合位点。
▼ 测绘
Hartz(2012)基于成熟 MIR193B 序列(AACUGGCCCUCAAAGUCCCGCU) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 MIR193B 基因对应到染色体 16p13.12。
徐等人(2011)表明 MIR193B 和 MIR365A 基因位于第 16 号染色体上。
孙等人(2011)在小鼠 16 号染色体上绘制了彼此相距约 5 kb 的 Mir193b 和 Mir365a 基因。
▼ 基因功能
莱沃宁等人(2011)之前发现 MIR193B 靶向雌激素受体-α(ESR1; 133430 ) 并抑制雌激素诱导的乳腺癌细胞生长。使用蛋白质组学和质谱分析,他们确定了 14-3-3-zeta(YWHAZ; 601288 )、SHMT2( 138450 ) 和 AKR1C2( 600450) 作为 MCF-7 人乳腺癌细胞中的其他主要 MIR193B 靶标。共转染实验证实,MIR193B 下调含有 SHMT2 或 YWHAZ 的 3 素 UTR 或 AKR1C2 的 5 素 UTR 的报告基因的表达。用抗 MIR193B 中和 MIR193B 导致 SHMT2 和 AKR1C2 蛋白水平升高,而 YWHAZ 蛋白的上调较少。通过小干扰 RNA 敲除这些靶基因的特定组合抑制了 MCF-7 细胞的生长。莱沃宁等人(2011)指出,这些 MIR193B 靶基因参与细胞信号传导和类固醇激素的产生,他们得出结论,MIR193B 在抑制乳腺癌细胞中类固醇依赖性生长方面具有多种作用。
Sun等人使用实时PCR(2011)发现,在从小鼠肩胛间棕色脂肪和棕色前脂肪细胞中培养的基质血管细胞分化后,Mir193b 和 Mir365 的表达显着上调。当在诱导棕色脂肪分化期间引入时,靶向 Mir193a( 614733 )、Mir193b 或 Mir365 的拮抗剂可减少培养细胞中的脂质积累和脂肪形成标志物的表达。然而,分化后这些miRNA的敲除几乎没有效果。Mir193a、Mir193b 或 Mir365 的表达抑制小鼠 C2C12 成肌细胞分化为多核肌管。染色质免疫沉淀分析显示棕色脂肪特异性转录因子 Ppar-α(PPARA; 170998) 直接结合 Mir193b-Mir365 的启动子区域。孙等人(2011)得出结论,Mir193b-Mir365 是棕色脂肪分化的重要调节因子,部分是通过抑制肌生成。