RHO GTP酶激活蛋白39
ARHGAP39 属于 RHO 的一个保守家族(参见 RHOA,165390)GTP 酶激活蛋白(RHOGAPs)并且是 ROBO1(602430)排斥上皮细胞和轴突所必需的(Lundstrom 等人,2004)。
▼ 克隆与表达
通过筛选大脑中表达的大 cDNA,Nagase 等人(2000)克隆了 ARHGAP39,他们称之为 KIAA1688。推导出的 1,094 个残基蛋白包含 RHOGAP、WW 和肌球蛋白/驱动蛋白尾部结构域。RT-PCR ELISA 检测到成人和胎儿人体组织和成人大脑区域中普遍存在的表达,在脊髓、成人和胎儿大脑以及睾丸中的表达水平最高。
伦德斯特罗姆等人(2004)克隆并鉴定了果蝇 Arhgap39,他们将其命名为 Vilse。人和果蝇 VILSE 具有相似的域结构,具有 2 个 N 端 WW 域和 C 端 MyTH4 和 RHOGAP 域。作者指出,在人类中发现了第二个 VILSE 同源物,它具有额外的 extensin-2 结构域。
▼ 基因功能
使用酵母 2 杂交分析,Lundstrom 等人(2004)表明人类 VILSE 的 WW 结构域与 ROBO1 的细胞内 CC2 结构域结合,类似于果蝇中的发现。苍蝇和人类 VILSE 都刺激 GTP 水解 RAC1( 602048 ) 和效率较低的 CDC42( 116952 ),但不刺激 RHOA。伦德斯特罗姆等人(2004)提出 ROBO1 排斥是通过 VILSE 使 RAC1 局部失活介导的。
Lim 等人使用质谱分析来鉴定与啮齿动物 NG108 细胞中的内源 Cnk2( 300724 ) 支架相互作用的蛋白质(2014)将 Vilse 确定为主要的约束合作伙伴。人体细胞研究表明,VILSE-CNK2 相互作用是由 VILSE 的 WW 结构域和 CNK2 的脯氨酸基序介导的。
▼ 测绘
通过辐射混合分析,Nagase 等人(2000)将 ARHGAP39 基因对应到染色体 8 或 15。
Gross(2014)基于 ARHGAP39 序列(GenBank AB051475 ) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 ARHGAP39 基因对应到染色体 8q24.3。