β-1,3-葡萄糖醛酸转移酶 2
GLCATS 参与 HNK1(见151290)碳水化合物表位的合成。GLCATS 将β-1,3 键中的葡萄糖醛酸转移到不同糖蛋白和糖脂中发现的Gal-β-1,4-GlcNAc 残基的末端半乳糖。HNK1表位在细胞-细胞和细胞-基质相互作用中起作用。
▼ 克隆与表达
通过对来自成年海马 cDNA 文库的克隆进行随机测序,Nagase 等人(2001)克隆了 GLCATS,他们将其命名为 KIAA1963。推导出的蛋白质含有488个氨基酸。RT-PCR ELISA 显示在成人和胎儿大脑中表达中等,在成人睾丸和卵巢中表达低水平。在成人神经组织中,GLCATS 在脊髓和海马中高度表达,在所有其他测试的成人大脑区域中表达为中度至高度。
Marcos 等人使用与大鼠 Glcats 序列的同源性(2002)确定了人类 EST 和 GLCATS 的基因组克隆。推导出的 324 个氨基酸的蛋白质包含一个跨膜区、一个富含脯氨酸的结构域和一个 C 端催化结构域,其中包含 4 个高度保守的区域(基序 I 到 IV)。GLCATS 还具有 2 个推定的 N-糖基化位点。人和大鼠蛋白质具有 89% 的同源性,在催化结构域中具有最高的同一性。Northern印迹分析检测到气管中的表达,但在检查的任何其他组织中没有检测到,包括脊髓。通过 PCR,作者检测到视网膜中的 GLCATS 表达。
伊米亚等人(2002)克隆小鼠 Glcats。推导出的 324 个氨基酸的蛋白质具有 II 型膜拓扑结构。Northern印迹分析在脑中检测到Glcats表达,但在肝或肾中未检测到。
▼ 基因功能
伊米亚等人(2002)发现在 COS-1 细胞中转染和表达的小鼠 Glcats 对糖蛋白表现出葡萄糖醛酸转移酶活性。
▼ 基因结构
马科斯等人(2002)确定 GLCATS 基因包含 4 个外显子,跨度约为 85 kb。
伊米亚等人(2002)分析了小鼠 Glcats 基因的近端 5 素侧翼区域。该区域的特点是 GC 含量高,并且不包含规范的 TATA 框或 CCAAT 框。伊米亚等人(2002)确定了几个响应元素的结合位点。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Nagase 等人(2001)将 GLCATS 基因对应到 6 号染色体。Marcos等人(2002)绘制了染色体 6q13 内微卫星标记之间的 GLCATS 基因。
通过 FISH,Imiya 等人(2002)将小鼠 Glcats 基因定位到 1 号染色体的 A4-B 区域。