ORM1样蛋白1
Hjelmqvist 等人通过对对应到 2 号染色体上 RP26 基因座( 608380 ) 的克隆进行测序,然后筛选视网膜 cDNA 文库和胎盘 RNA 的 3-prime 和 5-prime RACE(2002)克隆了 ORMDL1。推导出的 153 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 17.4 kD。ORMDL1 包含 4 个假定的跨膜结构域,并与 ORMDL2( 610074 )、ORMDL3( 610075 )共享 83%、84% 和 99% 的氨基酸同一性) 和小鼠 Ormdl1,分别。它还与其酵母直系同源物 Orm1 和 Orm2 具有显着的同源性。RT-PCR 在检查的所有成人和胎儿组织中显示 ORMDL1 表达。Northern 印迹分析在所有测试组织中检测到 1.4、2.5 和 3.3 kb 的转录本,胰腺、胎盘和脑中的水平适中,骨骼肌和肺中的水平最低。转染 COS-7 细胞后,荧光标记的 ORMDL1 用内质网标记定位。
▼ 基因结构
Hjelmqvist 等人(2002)确定 ORMDL1 基因包含 5 个外显子并且跨越至少 17 kb。第一个外显子未翻译。启动子区域没有 TATA 框,但它有几个 SP1( 189906 ) 结合位点。CpG 岛覆盖上游区域的一部分、第一个外显子和第一个内含子的一部分。
▼ 基因功能
Breslow 等人从酿酒酵母中的无偏功能基因组方法开始(2010)将 ORM 蛋白鉴定为鞘脂合成的负调节因子,它与丝氨酸棕榈酰转移酶( 605712 )形成保守的复合物,丝氨酸棕榈酰转移酶是鞘脂生产中的第一个限速酶。布雷斯洛等人(2010)还定义了一种调节途径,当鞘脂生产被破坏时,ORM 蛋白的磷酸化可减轻其抑制活性。ORM 基因表达的变化或其磷酸化位点的突变导致鞘脂代谢失调。布雷斯洛等人(2010)得出的结论是,他们的工作将 ORM 蛋白鉴定为鞘脂稳态的关键介质,并提出了鞘脂失调导致儿童哮喘发展的可能性。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Hjelmqvist 等人(2002)将 ORMDL1 基因对应到染色体 2q32.2。他们在染色体 10p14 上发现了一个假定的 ORMDL1 假基因。