接触相关蛋白样 3
CNTNAP3 属于涉及细胞粘附和细胞间通讯的多结构域跨膜蛋白家族(参见 NRXN1, 600565 )的一个亚组( Traut 等人,2006)。
▼ 克隆与表达
通过对从大小分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,Nagase 等人(2000)克隆了 CNTNAP3,他们将其命名为 KIAA1714。推断的 1,057 个氨基酸的蛋白质显示出细胞粘附蛋白的特征,分别与 CASPR2(CNTNAP2; 604569 ) 和 CASPR4(CNTNAP4; 610518 ) 共享 49% 和 72% 的序列同一性。RT-PCR ELISA 检测到整个成人大脑、肾脏和脊髓以及胎儿肝脏和大脑中的中间表达。在心脏、脾脏和卵巢中检测到较弱的表达,而在其他检查的组织中几乎没有表达。在大脑中,在小脑、尾状核、海马和黑质中发现最高表达。
通过数据库搜索类似于 CASPR(CNTNAP1; 602346 ) 和 CASPR2 的序列,然后筛选星形细胞瘤 cDNA 文库,Spiegel 等人(2002)克隆了 CASPR3。推导出的 1,288 个氨基酸蛋白质包含一个大的细胞外 N 端结构域、一个跨膜结构域和一个短的 C 端细胞质区域。胞外结构域包含盘状蛋白和纤维蛋白原样结构域、2 个 EGF 样重复序列和 4 个层粘连蛋白 G(LNS) 结构域,它们构成球状凝集素样折叠;C 末端终止于 PDZ 结构域结合位点。CASPR3 缺少在 CASPR 和 CASPR2 中发现的 protein-4.1(EPB41; 130500 ) 结合序列。Spiegel 等人(2002)还克隆了 2 个可变剪接异构体 CASPR3TM 和 CASPR3S,它们分别编码 1,154 和 612 个氨基酸的蛋白质。两者都缺乏第一个 EGF 结构域和一小部分纤维蛋白原样区域。此外,CASPR3S 在纤维蛋白原样区域之后结束,可能代表分泌的 CASPR3 同种型。Northern 印迹分析检测到人脑和脊髓中 6.1 kb 转录物的受限表达。原位杂交和免疫荧光研究检测到 CASPR3 沿轴突在胼胝体、脊髓、小脑和周围神经中的篮状细胞以及少突中的表达。对人胶质母细胞瘤细胞系和大鼠脑膜裂解物进行免疫沉淀分析后的蛋白质印迹分析识别出表观分子量为 135 和 180 kD 的 CASPR3 蛋白。
▼ 基因功能
Spiegel 等人(2002)证明 CASPR3 的细胞质结构域与 MINT1(APBA1; 602414 ) 的 PDZ 结构域相互作用,但与 CASK( 300172 ) 的 PDZ 结构域不相互作用;CASPR3 的最后一个氨基酸的去除消除了相互作用。
▼ 基因结构
Spiegel 等人(2002)确定 CASPR3 基因包含 24 个外显子。
▼ 测绘
通过辐射混合分析,Nagase 等人(2000)将 CNTNAP3 基因对应到 9 号染色体。通过基因组序列分析,Spiegel 等人(2002)将基因定位到 9q11。