结直肠癌,易感性,3

SMAD7 基因(602932) 中的变异会影响结直肠癌的易感性,因此此条目使用了数字符号(# )。

有关结直肠癌的表型描述和遗传异质性的讨论,请参见114500。

▼ 测绘

为了识别结直肠癌的风险变异,Broderick 等人(2007)进行了全基因组关联研究,对 940 名家族性结直肠肿瘤患者的 550,163 个 SNP 进行基因分型,其中 627 名患有结直肠癌,313 名患有晚期腺瘤,以及 965 名对照。他们评估了 3 个复制样本组(7,473 个病例,5,984 个对照)中选定的 SNP,并在与结直肠癌相关的 SMAD7 基因中鉴定了 3 个 SNP。在 4 个样本集中,rs4939827与结直肠癌之间的关联具有高度统计学意义(P = 1.00 x 10(-12))。研究中鉴定的所有 3 个 SNP 都对应到 SMAD7 内含子 3 内的连锁不平衡块。

在鉴定结直肠癌易感性等位基因的全基因组关联研究的第一阶段,Tomlinson 等人(2008)对 940 例家族性结直肠肿瘤病例(627 例结直肠癌病例,313 例高危腺瘤)和 965 例对照中的 550,163 个 tagSNP 进行了基因分型。他们在Broderick 等人鉴定的 SMAD7 基因的内含子 3 中的相同 3 个 SNP 处发现了强关联(2007 年)。

在一项全基因组关联研究中,Tenesa 等人确定了与结直肠癌风险相关的基因座(2008)对 1,012 个早发性苏格兰结直肠癌病例和 1,012 个第一阶段对照中的 555,510 个 SNP 进行了基因分型。在第 2 阶段,作者对 2,057 个苏格兰病例和 2,111 个对照中的 15,008 个最高级别的 SNP 进行了基因分型。然后,作者对来自 7 个人群的 14,500 例病例和 13,294 名对照的 1 期和 2 期联合分析中排名最高的 5 个 SNP 进行了基因分型。他们复制了 SNP rs4939827的关联(优势比 = 1.2;P = 7.8 x 10(-28))。rs4939827的直肠癌风险高于结肠癌。