锌指蛋白419
ZNF419 预计是一种转录因子( Martin et al., 2017 )。
▼ 克隆与表达
布罗恩等人(2011)指出 ZNF419 产生 7 个剪接变体。
▼ 测绘
布罗恩等人(2011)指出 ZNF419 基因对应到染色体 19q13.43。
▼ 分子遗传学
布罗恩等人(2011)评估了 2 名转移性肾细胞癌(RCC; 见144700 )患者的次要组织相容性抗原(MiHA) 特异性 T 细胞反应,这些患者接受了低强度调节干细胞移植和供体淋巴细胞输注治疗。一名患者病情稳定,伴有 CD8(见186910)阳性 T 细胞(CTL),可识别 SMCY(KDM5D;426000)并具有靶向表达 SMCY 的 RCC 肿瘤细胞的潜力。第二名患者经历了肺转移的部分消退,并且具有识别 RCC 细胞的 CTL。全基因组关联扫描显示,第二名患者的 CTL 识别出一种新的 HLA-B7 限制性 MiHA,该 MiHA 由 G-to-A SNP 引起。rs2074071 ) 在参与将外显子 4 连接到 ZNF419 基因的内含子 4 的剪接供体位点。由于 G-to-A SNP,与供体相比,受体的替代 ZNF419 转录本,作者称为 ZAPHIR(RCC 中的 ZNF419 选择性剪接多态性组织相容性抗原)包含不同的氨基酸序列。四聚体分析表明 ZAPHIR 特异性 CTL 在没有移植物抗宿主病的情况下发生(参见614395)。ZAPHIR 的公认 10 聚体肽是 IPRDSWWVEL。布罗恩等人(2011)得出结论,ZNF419 编码的 MiHA ZAPHIR 可能是异基因干细胞移植后特异性免疫治疗的靶点。
通过将 SNP 位置与剪接变体丰度数据相结合,Martin 等人(2017)在 ZNF419 基因的剪接受体位点上游鉴定了一个 SNP( rs11672136 ) 1 bp。SNP 的 T 等位基因与外显子 2 的包含相关,而 A 等位基因与外显子 2 的跳跃相关,导致锌指 DNA 结合结构域的缺失。马丁等人(2017)提出该域的丢失可能会影响 ZNF419 的下游目标。