癫痫发作的智力发育障碍60
AP50是网格蛋白包被的囊泡的AP2外壳组装蛋白复合物的50 kD成分。该复合物由2个大的100 kD成分组成,分别称为α(601026)和β(601025)亚基,50 kD成分(AP50)和一个17 kD蛋白质(602242)(Thurieau等总结)。等,1988)。
细胞遗传学位置:3q27.1
基因座标(GRCh38):3:184,174,854-184,184,090
▼ 克隆和表达
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Thurieau等(1988)从大鼠脑mRNA分离了AP50 cDNA,并表明预测的435个氨基酸蛋白是高度保守的。
Druck等(1995)使用大鼠cDNA作为探针克隆了人类同源物,他们将其命名为CLAPM1。
▼ 基因功能
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刘等(1994)表明,AP50是液泡ATPase的体外组装和活性所必需的,液泡ATPase可能是在内体和溶酶体酸化中发生质子泵激的原因。
克劳斯等(2006年)发现AP2复合物是COS-7和HeLa细胞中I型PIPK的调节因子(参见PIP5K1A; 603275)介导的PtdIns(4,5)P2合成。AP2通过其mu-2亚基在体外和天然蛋白提取物中直接与PIPKγ亚基的激酶核心结构域(PIP5K1C; 606102)相互作用。与mu-2结合的内吞货物蛋白刺激PIPK活性。克劳斯等(2006年)得出的结论是,存在一个由内吞货物蛋白,AP2M1和I型PIPK组成的正反馈回路,该回路可能提供特定的PtdIns(4,5)P2库。
▼ 基因结构
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Druck等(1995年)表明,CLAPM1基因包含6个外显子,跨越大约8 kb的基因组DNA。
▼ 测绘
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Druck等(1995年)通过与一组体细胞杂种DNA杂交,将CLAPM1分配给了3号染色体,并通过与3q28的原位杂交使其区域化。
Gross(2019)基于AP2M1序列(GenBank BC014030)与基因组序列(GRCh38)的比对,将AP2M1基因定位到3q27.1号染色体。
▼ 生化特征
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晶体结构
凯利等(2014年)确定了包含网格蛋白结合β-2铰链的AP2的结构,并开发了依赖于AP2的出芽测定。作者发现,自抑制机制可阻止网格蛋白AP2吸收网格蛋白。由质膜磷酸肌醇磷脂酰肌醇4,5-双磷酸酯和货物驱动的大规模构象变化减轻了这种自抑制作用,触发了网格蛋白的募集并因此形成了网格蛋白包被的芽的形成。凯利等(2014年)得出结论,这种分子转换机制可以将AP2的膜募集与其货物和网格蛋白结合的关键功能结合起来。
▼ 分子遗传学
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Helbig等在4名不相关的常染色体显性性智力发育障碍伴有癫痫发作的女孩中(MRD60; 618587)(2019)在AP2M1基因(R170W; 601024.0001)。前2名患者的突变是通过对314名具有相似表型的个体进行全外显子测序发现的。随后通过对2,310名具有相似表型的个体进行全外显子测序来确定另外2名患者。通过Sanger测序确认了突变的存在,并且在ExAC或gnomAD数据库中未找到该变体。分子建模表明,该突变引起AP2复合物的开放和闭合构象的熵增加,与热力学不稳定性一致。在AP2M1无效的HeLa细胞和Ap2m1无效的小鼠星形胶质细胞中进行的体外功能表达研究表明,与野生型AP2M1相比,R170W变体引起的内吞作用减少,这表明该突变对网格蛋白介导的内吞作用产生了不利影响,可能是由于对货物膜蛋白的识别受损。突变蛋白以正常水平表达,并正确定位在网格蛋白包被的凹坑中。Helbig等(2019)指出,AP2复合物介导了突触前囊泡蛋白和突触后离子通道的内吞分选,并推测神经元中某些货物膜蛋白和/或受体的内吞分选可能会破坏正常的突触传递。
▼ 等位基因变异体(1个选定的示例):
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.0001具有发育问题的智力发育异常60
AP2M1,ARG170TRP
Helbig等在4名不相关的常染色体显性性智力发育障碍伴有癫痫发作的女孩中(MRD60; 618587)(2019)在AP2M1基因中发现了一个从头杂合的c.508C-T过渡(c.508C-T,NM_004068.3),导致一个基本的磷脂结合斑块中的arg170到trp(R170W)取代稳定AP2的主动开放构象,以帮助与货物膜蛋白缔合。通过全外显子组测序发现并经Sanger测序证实的突变,在gnomAD或ExAC数据库中未找到。分子建模表明,该突变引起AP2复合物的开放和闭合构象的熵增加,与热力学不稳定性一致。在AP2M1无效的HeLa细胞和Ap2m1无效的小鼠星形胶质细胞中进行的体外功能性表达研究表明,与野生型AP2M1相比,R170W变体引起的内吞作用减少,提示该突变可能对网格蛋白介导的内吞作用产生不利影响,这可能是由于对货物膜蛋白的识别受损所致。突变蛋白以正常水平表达,并正确定位在网格蛋白包被的凹坑中。