类风湿关节炎易感
NFKB1(164011)或NFKB2(164012)与REL(164910),RELA(164014)或RELB(604758)结合形成NFKB复合物。NFKB复合物被I-κB蛋白(NFKBIA,164008或NFKBIB,604495)抑制,该蛋白通过将NF-κB捕获在细胞质中而使其失活。I-kappa-B蛋白上的丝氨酸残基被激酶(IKBKA,600664或IKBKB,603258)磷酸化)标记它们通过泛素化途径进行破坏,从而激活NF-κB复合物。活化的NFKB复合物易位到细胞核中,并以kappa-B结合基序与DNA结合,例如5-prime GGGRNNYYCC 3-prime或5-prime HGGARNYYCC 3-prime(其中H是A,C或T; R是A或G为嘌呤; Y为C或T嘧啶)。
细胞遗传学位置:6p21.33
基因座标(GRCh38):6:31,546,850-31,558,828
Location | Phenotype | Phenotype MIM number |
Inheritance | Phenotype mapping key |
---|---|---|---|---|
6p21.33 | {Rheumatoid arthritis, susceptibility to} | 180300 | 3 |
▼ 克隆和表达
------
Albertella和Campbell(1994)在6p21的 BAT1(142560)与TNFB(153440)和TNFA(191160)簇之间的人类主要组织相容性复合物中鉴定了一个基因,命名为IKBL(I-kappa-B-like)。 3。从U937前单核细胞白血病细胞系文库中分离出cDNA,并预测其编码381个氨基酸的蛋白质。该蛋白质包含与I-kappa-B(164008)蛋白质家族相似的锚蛋白基序。该基因跨越13.5 kb的基因组DNA,其3-prime末端距TNFB的5-prime末端约12 kb。Northern印迹分析在几种细胞类型中检测到1.6-kb的mRNA,包括单核细胞,T细胞,B细胞和肝细胞。
▼ 分子遗传学
------
冈本等(2003)在NFKBIL1基因(601022.0001)的启动子区域中鉴定出了多态性,这代表了HLA区域内的第二个类风湿关节炎(RA; 180300)易感位点,第一个是HLA-DRB1(142857)。RA敏感等位基因-62T周围的核苷酸序列是转录因子δ-EF1(TCF8; 189909)的假定结合位点(Allcock等,2001)。检查41个δ-EF结合位点表明,所有这些位点都在该位置含有一个T等位基因(Sekido等,1994)。相反,不敏感的等位基因-62A可能会破坏δ-EF1的这个基序。
有关NFKBIL1基因变异与无深静脉血栓形成的慢性血栓栓塞性肺动脉高压(CTEPH)之间可能存在的关联的讨论,请参阅612862。
▼ 演变
------
Allcock等(1999)测序RT-PCR产物从中央MHC基因衍生的具有良好特征和保守的祖先单倍型。他们发现,IKBL基因位于中央MHC端粒末端附近的TNF簇附近,在大多数祖先单倍型之间都已经保守。但是,观察到一些变化。
▼ 等位基因变异体(1个选定的示例):
------
.0001类风湿关节炎,易感
NFKBIL1,-62T-A
冈本等(2003)确定了非HLA-DRB1(142857)主要组织相容性复合物关联的风湿性关节炎易感性等位基因(180300):NFKBIL1基因的-62T / A SNP的T等位基因。