主要组织相容性复合物,I 类,F 类
在对单体 6 突变细胞系中主要组织相容性复合物进行物理定位的过程中,Ragoussis 等人(1989)发现了一个新的 I 类基因 cda12,它不同于 HLA-A( 142800 )、HLA-B( 142830 )、HLA-C( 142840 )和 HLA-E( 143010 )。它定位在 HLA-A 的 50 kb 内。拉古西斯等人(1989)建议命名为 HLA-F。杰拉蒂等人(1990)同样分离并测序了 HLA-F 基因。
杰拉蒂等人(1992)报道了酵母人工染色体(YAC) 克隆的分离和表征,该克隆跨越超过 1.2 Mb 的连续区域,包括 18 个特征 I 类序列中的 14 个。其中六个序列编码经典的移植抗原 HLA-A、-B 和 -C 以及较少多态性的 HLA-E、-F 和 -G( 142871 )。在剩下的 12 个序列中,4 个是全长假基因,8 个是缩写假基因,其中 3 个包含单个内含子/外显子片段。通过限制酶作图和使用基因座特异性探针,Geraghty 等人(1992)对所有 I 类基因和序列进行了排序,并将它们定位在该区域内。此外,确定了 4 个 I 类基因的转录方向。
▼ 测绘
正如他们在染色体 6p21.3 上人类 MHC 图的介绍中所概述的,I 类区域的基因序列从着丝粒到端粒是 EAHEJAHGF(Campbell 和 Trowsdale,1993)。
来自意大利北部 14 个无关家庭的连锁研究,Gasparini 等人(1993)得出结论,遗传性血色素沉着病位点(HFE; 235200 ) 与 HLA-F 着丝粒。一个特别丰富的双重组家族是该结论的基础。卡兰德罗等人(1995)使用来自 HLA-F 基因 3 素端的微卫星标记和来自 HLA-F 基因 5 素端的微卫星标记来研究 HFE 基因座相对于这些标记和其他标记的位置。他们得出结论,HFE 基因座与 HLA-F 端粒有关,而 HLA-F 又与 HLA-A 端粒有关。
▼ 基因功能
Lunemann 等人使用细胞培养系统、具有人源化肝脏的小鼠和丙型肝炎病毒(HCV) 感染个体的原代肝组织(2018)表明 HCV 感染上调了 HLA-F 的表达。上调的 HLA-F 与 KIR3DS1(参见604946)相互作用并激活自然杀伤细胞,从而控制 HCV 复制。
▼ 进化
为了分析人类主要组织相容性复合物发生的分子动力学,Shiina 等人(1999),检查了 HLA I 类区域的连续 1,796,938-bp 序列,连接了 MICB( 602436 ) 和 HLA-F 之间的基因。在分析的序列中识别出总共 127 个基因或潜在的编码序列,建立了每 14.1 kb 一个的高基因密度。758 个微卫星的鉴定为 HLA I 类相关疾病基因的高分辨率定位提供了工具。最重要的是,椎名等人(1999)确定最小构建块的重复复制和随后的多样化产生了今天的MHC。目前非必需的 HLA-F 和 MICE 基因已成为当今具有免疫能力的 HLA-ABC 和 MICA/B 基因的祖细胞,这为“出生和死亡”的进化提供了实验证据,这与我们对进化力量的理解具有普遍相关性驱动脊椎动物多基因家族。似乎 HLA-F 是祖先 MHC-I 基因,在复制后产生了 MICE 和 HLA-G。这一论点得到大量物理证据的证实:系统发育树分析、HLA-G、MICE 和 HLA-F 之间的短基因组距离,以及当今 MICE 是“问题最少”的 MIC 假基因这一事实(相比之下到 MICC、MICD 和 MICF。