胎儿血红蛋白定量性状基因座 2
健康正常成人的胎儿血红蛋白(HbF) 水平差异很大。尽管大多数成年人的 HbF 低于总 Hb 的 0.6%,但 HbF 和 F 细胞(含有可测量 HbF 的红细胞)在健康成人中的分布是连续的。大约 10% 到 15% 的个体的 HbF 升高范围为 0.8% 到 5%,这种特征通常被称为胎儿血红蛋白的遗传性持久性(HPFH),通常在红细胞中分布不均。当与 β-地中海贫血(见613985)或镰状细胞性贫血(603903)共同遗传时,HPFH 可以将 HbF 输出增加到临床有益的水平(Thein 等人,2007 年)。
有关可能影响胎儿血红蛋白水平的基因座的一般表型描述和讨论,请参阅 HBFQTL1( 141749 )。
▼ 临床特征
登等人(1994)报道了来自印度古吉拉特邦的一个大家庭,其中成员患有β-地中海贫血和/或遗传性胎儿血红蛋白持续存在。含有 HbF 的细胞的存在作为与β-地中海贫血的孤立特征分离。先证者患有纯合β-地中海贫血,但具有与高循环HbF水平相关的轻度表型。他娶了一位患有杂合β-地中海贫血的无关女性。两个儿子是β-地中海贫血的纯合子,但没有从父亲那里继承 HPFH,这从他们的严重疾病中可以看出。对其余大家族的详细检查表明,许多成员的 HbF 增加了 0.8% 到 3.4%,而那些患有 β-地中海贫血的杂合子的 HbF 水平在 2.5% 到 24% 之间。F 细胞水平从 5.8% 到 26% 不等,与 HPFH 的异细胞形式一致。
▼ 测绘
登等人(1994)排除了与 HPFH 的印度大家庭中 11p 染色体上的 β-珠蛋白基因簇的联系。当分析中考虑到遗传修饰物的影响时,怀疑主要基因的影响,特别是 11p 上的 β-地中海贫血和 γ-G 基因(HBG2; 142250 ) 启动子中的多态性。通过Thein 等人报道的大印度亲属的后续行动(1994),克雷格等人(1996)发现与染色体 6q22.3-q23.1 上决定胎儿血红蛋白产生的基因座有联系。
加纳等人(1998 年)扩展了Craig 等人研究的亚裔印度血统(1996 年)由 57 个成员组成,使研究总数达到 210 个,并用 26 个额外的标记使 6q23 区域饱和。连锁分析显示数量性状基因座(QTL) 与标记 D6S976(θ = 0.0 时的 lod 分数 11.3)和 D6S270(θ = 0.0 时的 lod 分数 = 7.4)紧密连锁。关键重组事件将 QTL 置于 D6S270 和 D6S1626 之间跨越约 1.5 Mb 的 1 至 2-cM 区间内。此外,单倍型分析导致了对家谱的重新评估并确定了亲属中的其他关系。
Thein 等人通过对 2 组分别由 824 人和 1,217 人组成的北欧双胞胎进行基因分型(2007)发现胎儿 Hb 水平与染色体 6q23 上从 HBS1L 上游 33 kb 开始的 24 kb 片段之间存在很强的关联(两个面板的组合 p 值为 10(-50)到 10(-75))(612450) . 该区域被称为 HBS1L-MYB( 189990 ) 基因间多态性的“HMIP”。这 12 个标记显示出非常强的连锁不平衡。在此区间内具有最高值的标记是rs9399137(p = 10(-45)),它位于 HBS1L 基因的内含子 1a 中。另外两个标记也显示出显着值:rs52090901(p = 10(-5)),位于 HBS1L 基因外显子 1a 上游的 5 素非翻译区和rs6929404(p = 0.0002),位于 HBS1L 外显子 1a 和 MYB 基因的第一个外显子之间. 基于单倍型分析,Thein 等人(2007)估计该区域的标记占性状方差的 17.6%。与高 F 细胞水平相关的变体也与培养的红细胞中 HBS1L 的表达增加密切相关。
通过分析 1,794 个欧洲人,Menzel 等人(2007)发现 HMIP2 块的单倍型 2 可以解释几种血液学特征的差异,包括红细胞计数(0.6%)、平均红细胞体积(1.7%)、平均红细胞血红蛋白(2.1%)、血小板计数(0.6 %) 和单核细胞数(1.6%)。研究结果表明,6q23.3 上 HMIP 基因座的变异对除血红蛋白外的其他外周血细胞指数有影响。
在 238 名中国 β-地中海贫血携带者的队列中,So 等人(2008 年)在染色体 6q23 上的 HMIP 片段内鉴定了 29 个 SNP,它们与 HbF 水平轻度相关(多次测试校正后 p 值介于 0.003 和 0.039 之间)。Thein 等人没有发现任何 SNP(2007)与 93 名正常中国人的 HbF 水平显着相关。所以等人(2008)仍然得出结论,该基因间区域在调节胎儿血红蛋白表达中起作用。
在 2 个孤立的镰状细胞性贫血患者队列中,Lettre 等人(2008)发现 HBS1L-MYB 区间中的几个 SNP 与 HbF 水平之间存在显着关联。在 1,275 名非洲裔美国人和 350 名巴西人中,最显着的关联分别是rs9399137(p = 5 x 10(-11)) 和rs4895441(p = 4 x 10(-7))。该区域与不同 SNP 的关联相互孤立,但总体上可以解释 HbF 水平 5% 的差异。
为了在 BCL11A( 606557 )、HBS1L-MYB 和 β-珠蛋白基因座(参见141749 )处精细绘制 HbF 关联信号, Galarneau 等人(2010)对 190 名个体的这些基因座重新测序了 175.2 kb,其中包括 HapMap 欧洲 CEU 和尼日利亚 YRI 创始人以及 70 名患有镰状细胞性贫血的非洲裔美国人。作者发现了 1,489 个序列变体,包括 910 个以前未报告的变体。使用来自 HapMap、 Galarneau 等人的这些信息和数据(2010)在 1,032 名患有镰状细胞性贫血的非洲裔美国人中选择和基因分型 95 个 SNP,包括 HBS1L-MYB 基因座的 35 个。单标记回归分析确定rs9402686与 HbF 水平的相关性高于rs9399137,该基因座的前一个索引 HbF SNP(对于 rs9402686,p = 1.9 x 10(-13);对于rs9399137 , p = 3.5 x 10(-10))。
▼ 分子遗传学
潘迪特等人(2008)提供的证据表明 HBS1L 基因( rs2297339 )的 5 素非翻译区中的 32C-T SNP可能影响 HbF。C 等位基因与泰裔中国β-地中海贫血患者的 HbF 水平升高有关,特别是在 HBG2 多态性杂合子患者中( 142250.0028 )。预计 HBS1L中的 rs2297339 会赋予转录因子 AP4( 600743 ) 的结合位点,并可能影响基因表达。
沃尔伯格等人(2009)在红细胞系中发现核心基因间 HMIP2 块中的 3 个位点对 DNase I 切割高度敏感,表明染色质活跃。染色质免疫沉淀与微阵列(ChIP 芯片)分析显示在 65-kb 区间内有强烈的组蛋白乙酰化,包括原代人红细胞中的 HMIP2 和 HMIP3 块,但在不表达 MYB 的 HeLa 细胞中没有。在该区域确定了几种潜在的顺式调节元件和强 GATA1( 305371 ) 信号。研究结果表明,该区域包含远端调节序列,通过控制 MYB 表达可能在造血过程中发挥重要作用。
为了确定影响 HbF 水平的 HBS1L-MYB 基因座基因的身份,Galarneau 等人(2010)对 70 名镰状细胞性贫血患者进行了重新测序,并分别在 HBS1L 和 MYB 中发现了 6 个和 4 个罕见的错义变异。他们对 1,032 名镰状细胞性贫血患者的这些变异进行了基因分型,通过比较携带者和非携带者的标准化 HbF 水平来评估他们在基因水平上的负担。HBS1L 的结果不显着;然而,观察到 MYB 的显着差异(校正后的 p = 0.005),25 名携带者的 HbF 比 937 名非携带者平均高出 1.4%。这些数据表明 MYB 是在 HBFQTL2 基因座上与控制 HbF 产生有因果关系的基因。