SYNDECAN 2
SDC2 是一种包含 BAR 结构域的蛋白质,参与循环内体(RE) 生物发生( Giridharan et al., 2013 )。
▼ 克隆与表达
通过肝素酶处理后细胞表面相关的硫酸乙酰肝素蛋白聚糖的聚丙烯酰胺凝胶电泳,Lories 等人(1987)证明存在表观分子量为 125,000、90,000、64,000、48,000 和 35,000 的核心蛋白。90-kD 和 48-kD 核心蛋白共享单克隆抗体 6G12 的表位,Marynen 等人(1989)用于从人肺成纤维细胞表达文库中分离 cDNA。Southern印迹分析表明存在1个或有限数量的对应于48/90-kD cDNA的基因。
跨膜硫酸乙酰肝素蛋白聚糖,其 cDNAs 是由Marynen 等人从人肺成纤维细胞中克隆出来的(1989)也称为纤维多糖或 syndecan-2( David et al., 1992 )。它与 MYC 基因位于同一区域。正如Spring 等人指出的那样(1994),syndecan 家族的 4 个成员与 MYC 基因家族的 4 个成员表现出显着的物理关系。
▼ 测绘
通过与一组人-小鼠体细胞杂交 DNA 的 Southern 杂交和原位杂交,Marynen 等人(1989)表明硫酸乙酰肝素蛋白聚糖核心蛋白定位于 8q22-q24(基底膜硫酸乙酰肝素蛋白聚糖(HSPG2;142461)对应到染色体 1。)
Gross(2021)根据 SDC2 序列(GenBank BC030133 ) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 SDC2 基因对应到染色体 8q22.1。
▼ 基因功能
博巴特等人(2003 年)证明,包括 SDC2 在内的多聚糖可以通过 HIV-1 gp120 与硫酸乙酰肝素链的结合,在反式 HIV 受体中发挥作用。流式细胞术分析证明了内皮细胞上的 SDC 表达。与内皮细胞系上的 SDC 结合的 HIV 保持其感染性至少 1 周,而未结合的病毒则少于 1 天。博巴特等人(2003 年)表明,血管系统内富含 SDC 的内皮细胞可以提供促进 HIV 在 T 细胞中复制的微环境。
Ethell 等人使用酵母 2 杂交实验、免疫共沉淀试验和体外下拉试验(2000)证明小鼠 synbindin(TRAPPC4; 610971 ) 直接与大鼠 syndecan-2 相互作用。酵母 2-杂交分析还表明,synbindin 与大鼠 syndecan-4(SDC4; 600017)。突变分析表明,这种相互作用需要 synbindin 的 PDZ 样结构域和 Sdc2 的 C 末端结构域中的 EFYA 基序。用 synbindin 和 Sdc2 转染的原代大鼠海马神经元沿树突棘成簇表达蛋白质。缺乏 EFYA 基序的 Sdc2 形成了缺乏 synbindin 的簇,表明 synbindin 聚类依赖于 Sdc2。Synbindin 与突触膜组分中的 Sdc2 共免疫沉淀。埃塞尔等人(2000)建议 SDC2 通过与 synbindin 的相互作用将细胞内囊泡募集到突触后位点来诱导树突棘形成。
科尔斯等人(2011)报道 RPTP-σ,也称为 PTPRS( 601576 ),在感觉神经元延伸中双峰作用,介导 CSPG( 155760 ) 抑制和 HSPG 生长促进。共享 HSPG-CSPG 结合位点的晶体学分析揭示了一种构象可塑性,可容纳具有相似亲和力的多种糖胺聚糖。硫酸乙酰肝素及其类似物在溶液中诱导 RPTP-σ 胞外域寡聚化,而硫酸软骨素可抑制这种寡聚化。RPTP-σ 和 HSPGs 在培养中感觉神经元的斑点中共定位,而 CSPGs 占据细胞外基质。科尔斯等人(2011)得出的结论是,他们的结果导致了一个模型,其中蛋白聚糖可以通过竞争控制共同受体的寡聚化对神经元延伸产生相反的影响。
Giridharan 等人在 HeLa 细胞中使用免疫沉淀分析(2013)证明 SYND2 的 SH3 结构域与 MICALL1( 619563 ) 的 14 个富含脯氨酸的结构域中的 2 个直接相互作用。SYND2 与 MICALL1 和 EHD1 共定位(605888) 在管状 REs,SYND2 和 MICALL1 显示出与管状膜相似的关联动力学。敲低分析表明,MICALL1 和 SYND2 之间的相互作用是它们定位到管状 REs 所必需的,而 EHD1 稳定了 MICALL1 和 SYND2 之间在循环小管上的相互作用。脂质覆盖分析显示 MICALL1 和 SYND2 与 REs 膜中的磷脂酸结合,用于定位和 RE 小管生物发生。进一步的分析表明,MICALL 和 SYND2 能够从含磷脂酸的膜中产生小管。
▼ 细胞遗传学
石川刷等人(1997)发现 SDC2 基因的 3 素末端位于 27 岁女性患者的易位断点近端约 30 kb,平衡易位 46,X,t(X;8)(p22. 13;q22.1) 与多发性外生骨疣和自闭症有关( Bolton et al., 1995 )。X染色体的断点位于胃泌素释放肽受体基因(GRPR;305670)的第一个内含子,可能与自闭症(209850 )有因果关系) 提出。由于 SDC2 基因产物的生物学功能之一与骨形成中的细胞聚集有关,因此作者建议干扰其作为多发性外生骨疣机制的功能。位置效应优先;在 PAX6 基因( 607108 )的 3 素末端发生的易位远至大约 100 kb 似乎对该基因具有破坏性,并且与无虹膜症有关。
▼ 分子遗传学
在一个由 330 名患有系统性硬化症的个体组成的队列中(见181750),Banka 等人(2015)观察到 SDC2 基因中的 c.211T-A 颠换导致 ser71-to-thr(S71T) 错义多态性( rs1042381 ) 与预防疾病之间存在统计学关联。次要等位基因频率在患者中为 0.122,而在 308 名本地对照中为 0.167,在 Exome Variant Server 数据库中为 0.182(优势比为 0.52,p 小于 1 x 10(-5))。基于其在结缔组织中的推定表达选择该基因进行研究。