鸟嘌呤核苷酸结合蛋白,β-1

异三聚体鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G 蛋白) 将跨膜受体接收的细胞外信号转导至效应蛋白。G 蛋白复合物的每个亚基由 3 个相应基因家族中的一个成员编码,α、β 和 γ(Hurowitz 等人,2000)。

▼ 克隆与表达

视网膜转导素是一种鸟嘌呤核苷酸调节蛋白,可激活感光细胞中的 cGMP 磷酸二酯酶。方等人(1986)鉴定并分析了牛转导素 β 亚基的 cDNA 克隆,并推断了 340 个氨基酸的蛋白质的一级结构。发现与酵母CDC4基因产物有显着的同源性。β-亚基多肽的相对分子质量为 37,375 Da,由 2.9-kb 的 mRNA 编码。检查的所有哺乳动物组织和克隆细胞系都包含至少 2 个与 β 相关的 mRNA,通常长 1.8 和 2.9 kb。作者认为,可能存在多种与 β 亚基相关的 mRNA,它们可以编码不同的蛋白质。

科迪纳等人(1986)从人类肝脏 cDNA 文库中克隆了一个全长 G 蛋白 β-1 亚基(GNB1)。他们发现推导的 340 个氨基酸的蛋白质与转导素 β 亚基的牛视网膜视杆细胞 cDNA 编码的蛋白质相同。

▼ 基因功能

使用共沉淀分析,Rosskopf 等人(2003)表明 GNB1 形成二聚体,分析了所有的伽马亚基。相互作用的强度是可变的,并且在 GNB1 和 GNG3( 608941 )、GNG10( 604389 )、GNG12 和 GNG13( 607298 ) 之间最强。

Murakami 等人使用免疫沉淀法(2019)表明,在小鼠骨髓来源的巨噬细胞中 Nlrp3 激活后,Gnb1 与 Nlrp3(606416) 的 pyrin( 608107 ) 结构域(PYD) 相互作用。通过与 Nlrp3 的相互作用,Gnb1 通过抑制由 Nlrp3 诱导的 Asc(PYCARD; 606838 ) 寡聚化来负调节 Nlrp3 炎症小体的激活。

▼ 基因结构

罗斯科普夫等人(2003)确定 GNB1 基因有 12 个外显子。前 2 个外显子和最后一个外显子是非编码的。

▼ 测绘

Sparkes 等人使用针对小鼠/人类体细胞杂交组的 cDNA 探针(1987)将 G 蛋白的人类 β-1 多肽对应到人类染色体1。Levine 等人(1990 年)通过对体细胞杂种的 Southern 分析证实了染色体 1 的分配,以及Levine 等人(1990)和莫迪等人(1991)通过原位杂交将分配区域化为 1pter-p31.2。

丹西格等人(1990)将小鼠 Gnb1 对应到远端 4 号染色体。

▼ 分子遗传学

智力发育障碍 42,常染色体显性遗传

在 13 名不相关的常染色体显性智力发育障碍患者 42(MRD42; 616973 ) 中,Petrovski 等人(2016)在 GNB1 基因中鉴定了 9 个不同的从头杂合错义突变(参见,例如,139380.0001 - 139380.0005)。通过外显子组测序鉴定突变并通过Sanger测序确认。这些患者是从一个由 5,855 名推测为原因不明的遗传疾病的个体组成的队列中确定的。Petrovski 等人没有进行患者细胞的功能研究和研究(2016 年)。然而,彼得罗夫斯基等人(2016)指出Yoda 等人(2015)已经确定了与血液学转化相关的 GNB1 基因中的体细胞突变。Petrovski 等人报道的患者中也被鉴定为种系突变的 3 个突变(D76G,139380.0001;I80T,139380.0002;I80N,139380.0003 )的功能研究(2016)减少了与几乎所有 G-α 亚基的结合和/或通过破坏 G-α/G-β/G-γ 相互作用界面赋予细胞因子非依赖性生长和经典 G 蛋白下游信号传导的激活。突变导致 PI3K-AKT-mTOR 和 MAPK 通路的激活,与功能获得一致。

在 16 名 MRD42 患者中,Lohmann 等人(2017)鉴定了 GNB1 基因中的 14 个突变,包括 2 个移码(139380.0007和139380.0008)、2 个剪接(139380.0006和139380.0009)和 10 个错义(参见例如139380.0010)。通过全外显子组测序鉴定突变;1个突变是从父母那里遗传的,10个是从头遗传的,3个突变的遗传因缺乏亲本样本而无法确定。Lohmann 等人使用基于细胞的生物发光共振能量转移(BRET) 测定(2017)证明,其中 7 个错义突变导致受体驱动的 G 蛋白激活不足。

赫马蒂等人(2018 年)报告了 18 名 MRD42 和 GNB1 基因从头杂合突变的患者。12 名患者具有先前鉴定的突变的杂合性,其中 8 名患者患有 I80T( 139380.0002 )。其中一种突变(C114Y;139380.0011)被鉴定为体细胞镶嵌状态。所有突变都是通过三重全外显子组测序发现的。

在一名患有 MRD42 的 4 岁女孩中,Szczaluba 等人(2018 年)在 GNB1 基因中发现了一个从头杂合错义突变(G77V;139380.0012)。该突变是通过三重全外显子组测序发现的,并通过 Sanger 测序确认。

癌症中的体细胞突变

尤达等人(2015)鉴定了 GNB1 基因中的杂合体细胞突变(参见,例如,D76G、139380.0001;I80T、139380.0002;I80N、139380.0003)和 GNB2(139390)基因在来自患有各种恶性肿瘤(包括实体瘤和血液系统恶性肿瘤)的患者的肿瘤组织中,包括急性淋巴细胞白血病(ALL; 613065 )、骨髓增生异常综合征(MDS; 614286 ) 和慢性淋巴细胞白血病(CLL; 151400)。体外和体内功能研究表明,所有突变都导致细胞因子非依赖性生长和经典 G 蛋白信号传导的激活。影响残基 K57、K78、I80、K89 和 M101 的经常性突变位于与 G-α 亚基和下游效应器相互作用的 G-β 蛋白表面。体外研究表明,大多数突变蛋白与 G-α 亚基的结合减少,随后激活 PI3K-AKT-mTOR 和 MAPK 信号通路。在骨髓肿瘤中发现了 11 个影响残基 K57 的突变,而在 B 细胞肿瘤中发现了 8 个影响残基 I80 的突变中的 7 个。将几个突变转染到鼠骨髓中导致了血液肿瘤的发展,PI3K-mTOR信号通路的药理学抑制导致存活率增加。然而,在一些肿瘤中,GNB1 突变与致癌激酶改变同时发生,例如 JAK2 的变化。147796 ) 或 BRAF( 164757 ),它们赋予抑制剂抗性。

▼ 动物模型

在 Rd4/+ 小鼠中,常染色体显性视网膜变性与几乎所有 4 号染色体的大倒位共同分离(Roderick 等人,1997 年)。为了确定这种表型的负责基因,Kitamura 等人(2006)专注于远端断点,发现它位于 Gnb1 基因的第二个内含子,编码转导素-β-1 蛋白,该蛋白直接参与光转导和光感受器的正常维持。北村等人(2006)确定在 Rd4/+ 视网膜开始视网膜变性之前,Gnb1 mRNA 和转导素-β-1 的水平是野生型视网膜的 50%。北村等人(2006)表明 Gnb1 基因的破坏是导致 Rd4/+ 视网膜疾病的原因。

▼ 等位基因变体( 12个精选示例):

.0001 智力发育障碍,常染色体显性遗传 42
白血病,急性淋巴细胞,体细胞,包括
GNB1、ASP76GLY
在一名 8.5 岁的德系犹太裔男孩患有常染色体显性智力发育障碍 42(MRD42; 616973 ),Petrovski 等人(2016)在 GNB1 基因的外显子 6 中发现了一个从头杂合的 c.227A-G 转换(c.227A-G, NM_002074.4),导致 asp76 到甘氨酸(D76G) 取代。通过外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变在外显子组测序项目(2013 年 3 月)或 ExAC 数据库(2015 年 1 月)或 4,326 名对照个体中未发现。未进行变体的功能研究和患者细胞的研究。尤达等人(2015)发现了与急性淋巴细胞性 T 细胞白血病(ALL; 613065 ) 相关的体细胞 D76G 突变)。D76G 通过破坏 G-α/G-β/G-γ 相互作用界面赋予细胞因子非依赖性生长和经典 G 蛋白下游信号传导的激活。

.0002 智力发育障碍,常染色体显性遗传 42
骨髓增生异常综合征,躯体,包括
白血病,慢性淋巴细胞,躯体,包括
GNB1, ILE80THR
在 3 名不相关的常染色体显性智力发育障碍患者 42(MRD42; 616973 ) 中,Petrovski 等人(2016)在 GNB1 基因的外显子 6 中发现了一个从头杂合的 c.239T-C 转换(c.239T-C, NM_002074.4),导致 ile80 到 thr(I80T) 取代。通过外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变已针对外显子组测序项目(2013 年 3 月)和 ExAC(2015 年 1 月)数据库进行过滤。取代发生在与 G-α 亚基和下游效应器相互作用的 GNB1 蛋白表面。尤达等人(2015)已确定与血液学转化相关的体细胞 I80T 变异,包括骨髓增生异常综合征(MDS; 614286) 和慢性淋巴细胞白血病(CLL; 151400 )。I80T 被证明减少了与几乎所有 G-α 亚基的结合,这通过破坏 G-α/G-β/G-γ 相互作用界面赋予了经典 G 蛋白下游信号传导的非细胞因子依赖性生长和激活。彼得罗夫斯基等人(2016)注意到 I80T 在 ExAC 浏览器中被报告为低置信度变体,但暗示它可能是技术伪影或合子后突变。Petrovski 等人没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究(2016 年)。有关影响该残基的另一个突变,请参见139380.0003。

赫马蒂等人(2018 年)在 8 名 MRD42 患者中鉴定了 GNB1 基因中 I80T 突变的从头杂合性。

.0003 智力发育障碍,常染色体显性遗传 42
白血病,急性淋巴细胞,体细胞,包括
GNB1, ILE80ASN
在 2 名无血缘关系的常染色体显性智力发育障碍 42(MRD42; 616973 ) 患者中,Petrovski 等人(2016)在 GNB1 基因的外显子 6 中发现了一个从头杂合 c.239T-A 颠换(c.239T-A,NM_002074.4),导致 ile80 到 asn(I80N) 取代。通过外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变未在外显子组测序项目(2013 年 3 月)或 ExAC(2015 年 1 月)数据库或 4,326 名对照个体中发现。取代发生在与 G-α 亚基和下游效应器相互作用的 GNB1 蛋白表面。尤达等人(2015)已经确定了与血液学转化相关的体细胞 I80N 变异,包括急性淋巴细胞白血病(ALL;613065)。I80N 被证明减少了与几乎所有 G-α 亚基的结合,这通过破坏 G-α/G-β/G-γ 相互作用界面赋予了经典 G 蛋白下游信号传导的非细胞因子依赖性生长和激活。Petrovski 等人没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究(2016 年)。有关影响该残基的另一个突变,请参见139380.0002。

.0004 智力发育障碍,常染色体显性遗传 42
GNB1, LYS78ARG
在一个 13 个月大的男孩患有常染色体显性智力发育障碍 42(MRD42; 616973 ),Petrovski 等人(2016)在 GNB1 基因的外显子 6 中发现了一个从头杂合的 c.233A-G 转换(c.233A-G, NM_002074.4),导致 lys78 到 arg(K78R) 取代。通过外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变未在外显子组测序项目(2013 年 3 月)或 ExAC(2015 年 1 月)数据库或 4,326 名对照个体中发现。未进行变体的功能研究和患者细胞的研究。

.0005 智力发育障碍,常染色体显性遗传 42
GNB1,MET101VAL
在 2 名无血缘关系的常染色体显性智力发育障碍 42(MRD42; 616973 ) 患者中,Petrovski 等人(2016 年)在 GNB1 基因的外显子 7 中发现了一个从头杂合的 c.301A-G 转换(c.301A-G,NM_002074.4),导致了一个从 met101 到 val(M101V)的替换。通过外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变,针对 dbSNP、外显子组测序项目(2013 年 3 月)、ExAC(2015 年 1 月)和 1000 Genome Project 数据库进行过滤。未进行变体的功能研究和患者细胞的研究。

.0006 智力发育障碍,常染色体显性遗传 42
GNB1、IVS6AS、GT、-1
在一名患有常染色体显性遗传智力发育障碍 42(MRD42; 616973 )的 2 岁沙特阿拉伯男孩中, Lohmann 等人(2017)在 GNB1 基因的内含子 6 中发现了一个从头杂合的 c.268-1G-T 颠换(c.268-1G-T,NM_002074),预计会导致剪接异常。通过三重全外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变不存在于 ExAC 数据库或包含 4,361 个外显子组的内部数据库中。未进行功能研究。

.0007 智力发育障碍,常染色体显性遗传 42
GNB1、4-BP DEL、NT272
在一名患有常染色体显性智力发育障碍 42(MRD42; 616973 )的 5 岁以色列男孩中, Lohmann 等人(2017 年)在 GNB1 基因的外显子 7 中发现了一个从头杂合的 4-bp 缺失(c.272_275del,NM_002074),预计会导致移码。通过三重全外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变不存在于 ExAC 数据库或包含 4,361 个外显子组的内部数据库中。未进行功能研究。

.0008 智力发育障碍,常染色体显性遗传 42
GNB1、2-BP DEL、NT915
在一名患有常染色体显性遗传智力发育障碍 42(MRD42; 616973 )的 8 岁沙特阿拉伯患者中, Lohmann 等人(2017 年)在 GNB1 基因的外显子 10 中发现了一个从头杂合的 2-bp 缺失(c.915_916del,NM_002074),预计会导致移码。通过全外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变不存在于 ExAC 数据库或包含 4,361 个外显子组的内部数据库中。未进行功能研究。

.0009 智力发育障碍,常染色体显性遗传 42
GNB1、IVS10AS、GT、-1
在一名患有常染色体显性智力发育障碍 42(MRD42; 616973 )的 6 岁印度女孩中, Lohmann 等人(2017)在 GNB1 基因的内含子 10 中发现了一个从头杂合的 c.917-1G-T 颠换(c.917-1G-T,NM_002074),预计会导致剪接异常。通过全外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变不存在于 ExAC 数据库或包含 4,361 个外显子组的内部数据库中。未进行功能研究。

.0010 智力发育障碍,常染色体显性遗传 42
GNB1, ARG96LEU
在 3 名以色列、印度和墨西哥种族的常染色体显性智力发育障碍 42(MRD42; 616973 ) 先证者中,Lohmann 等人(2017)确定了 GNB1 基因中相同 c.287G-T 颠换(c.287G-T, NM_002074) 的从头杂合性,导致 arg96 到 leu(R96L) 取代。通过三重全外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变不存在于 ExAC 数据库或包含 4,361 个外显子组的内部数据库中。未进行功能研究。

.0011 智力发育障碍,常染色体显性遗传 42
GNB1, CYS114TYR
在一名患有常染色体显性遗传智力发育障碍 42(MRD42; 616973 )的 7 岁西班牙裔女孩(患者 3)中, Hemati等人(2018 年)确定了 GNB1 基因中 c.341G-A 转换(c.341G-A,NM_002074.4)的镶嵌现象,导致 cys114 到 tyr(C114Y)取代。该突变是通过三重全外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的,在患者的 163 个读数中的 29 个中鉴定出,代表 18% 的等位基因部分。未进行功能研究。与 Hemati等人的其他 MRD42 患者相比,该患者的表型相对温和(2018)归因于 C114Y 突变的镶嵌状态。

.0012 智力发育障碍,常染色体显性遗传 42
GNB1、GLY77VAL
Szczaluba 等人在一名患有常染色体显性遗传智力发育障碍 42(MRD42; 616973 )的 4 岁患者中(2018)确定了 GNB1 基因外显子 6 中 c.230G-T 颠换(c.230G-T,NM_001282539.1)的杂合性,导致 gly77-to-val(G77V) 取代。通过三重全外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变在她的父母中没有发现。未进行功能研究。