肿瘤相关钙信号传感蛋白2

单克隆抗体 GA733 来源于用人胃腺癌细胞系免疫小鼠。它对其他来源的癌具有特异性,例如宫颈癌、膀胱癌和肺癌。

▼ 克隆与表达

林嫩巴赫等人(1989)从人类结肠直肠癌细胞系中纯化抗原并确定其部分氨基酸序列。通过使用合成寡核苷酸探针,他们从整个人类基因组文库中分离出 2 个重组体。他们证明了一个GA733基因家族的存在。其中一个分离株没有内含子;它在胰腺癌细胞系和胎盘中转录。发现 GA733 蛋白含有与甲状腺球蛋白中出现 10 次( 188450 ) 和 HLA-DR 相关不变链( 142790 )中出现一次的重复单元同源的序列。

福纳罗等人(1995)从卵巢癌 cDNA 表达文库中克隆了编码 GA733-1 的 cDNA。cDNA编码预测的323个氨基酸的35,709 Da多肽,与GA733-2多肽(EPCAM;185535)有48%的相似性。同源区域聚集在 2 个胞质外结构域和假定的跨膜/胞质区域。一个潜在的细胞质磷酸化位点也是保守的。该基因也被命名为 M1S1,代表膜成分、染色体 1、表面标记 1。

▼ 基因结构

林嫩巴赫等人(1993)指出编码 GA733-1 的单外显子基因包含一个 323 个氨基酸的长 ORF,编码预测的 35.7-kD 蛋白质,具有 4 个潜在的 N-连接糖基化位点。作者发现 GA733-1 和 314 个残基 GA733-2 预测蛋白的氨基酸序列有 49% 相同。从 9 外显子 GA733-1 基因的额外序列研究和 GA733-1 和 GA733-2 基因的启动子区域的比较,Linnenbach 等人(1993)得出结论,GA33-1 基因是由 GA733-2 基因通过 mRNA 中间体重新定位而形成的。

▼ 测绘

林嫩巴赫等人(1993)使用人/啮齿动物体细胞杂交分析将 GA733-1 基因对应到 1p32-p31 或 1p13-q12。通过 FISH,Calabrese 等人(2001)将 TACSTD2 基因对应到 1p32。

▼ 分子遗传学

使用连锁分析,Tsujikawa 等人(1999)将凝胶状滴状角膜营养不良(GDLD; 204870 ) 对应到包括 M1S1 的 400 kb 关键区域。表达分析表明M1S1在角膜以及肾、肺、胎盘、胰腺和前列腺中表达。发现 20 个日本家庭的所有 26 名受影响成员都是纯合子或复合杂合子,有 4 个突变:gln118 到 ter(Q118X;137290.0001)、gln207 到 ter(Q207X;137290.0002)、ser170 到 ter(S170X;137290.0003)和 632del 137290.0004)。Q118X 突变占 40 个(82.5%) 疾病等位基因中的 33 个。蛋白表达分析显示突变的、截短的蛋白在核周区域聚集,而正常蛋白以均匀或细颗粒状分布在细胞质中。

任等人(2002)将 GDLD 的分子研究扩展到具有不同种族背景的患者。他们对来自印度、美国、欧洲和突尼斯的 8 个不相关的 GDLD 家族进行了连锁分析。在这些家族中的 7 个家族中,疾病位点定位于 1 号染色体短臂上的 16-cM 间隔,其中包括 M1S1 基因区域。此外,在受影响的个体中对包含 M1S1 基因整个编码区的 1.2-kb 片段进行了测序。在 6 个家庭和 2 个无关个体中发现了 7 个新突变。在一个家族中没有检测到序列异常,其中 GDLD 基因座也通过连锁分析从 M1S1 区域中排除。这些发现证明了 GDLD 的等位基因和基因座异质性。

▼ 等位基因变体( 8个精选示例):

.0001 凝胶状滴状角膜营养不良
TACSTD2、GLN118TER
辻川等人(1999)确定了 M1S1 基因中的 C-to-T 转换导致 M1S1 蛋白的密码子 118(Q118X) 处的 gln-to-ter 替换。在日本人群 的 40 个 GDLD( 204870 ) 疾病等位基因中的33 个中发现了这种突变。

.0002 凝胶状滴状角膜营养不良
TACSTD2、GLN207TER
在 2 名患有凝胶状滴状角膜营养不良的日本同胞( 204870 ) 中,Tsujikawa 等人(1999)鉴定了 M1S1 基因中的 C 到 A 颠换,导致 M1S1 蛋白的密码子 207(Q207X) 处发生 gln 到 ter 替换。这种突变是在纯合子中发现的。

.0003 凝胶状滴状角膜营养不良
TACSTD2, SER170TER
在 1 名患有凝胶状滴状角膜营养不良的日本患者( 204870 ) 中,Tsujikawa 等人(1999)鉴定了 M1S1 基因中的 C 到 A 颠换,这导致 M1S1 蛋白的密码子 170(S170X) 处发生 ser-to-ter 替换。这种突变是在纯合子中发现的。

.0004 凝胶状滴状角膜营养不良
TACSTD2,1-BP DEL,632A
在 2 名日本凝胶状滴状角膜营养不良患者中( 204870 ),Tsujikawa 等人(1999)鉴定了 M1S1 基因第 632 位核苷酸的单碱基对缺失(A)。该突变在日本患者中 被鉴定一次是纯合子,一次是复合杂合子与 Q118X 突变( 137290.0001 )。

.0005 凝胶状滴状角膜营养不良
TACSTD2,MET1ARG
在患有凝胶状滴状角膜营养不良(GDLD; 204870 ) 的印度家庭成员中,Ren 等人(2002 年)在 M1S1 基因的第 308 位核苷酸处发现了一个 T 到 G 颠换,导致了一个met1 到 arg(M1R) 突变。

.0006 凝胶状滴状角膜营养不良
TACSTD2, CYS119SER
在突尼斯的一个家庭中,Ren 等人(2002)在 M1S1 基因的 661 位核苷酸处发现了一个 T 到 A 的颠换,导致 cys119 到 ser(C119S) 的氨基酸变化。

.0007 凝胶状滴状角膜营养不良
TACSTD2、12-BP DEL/1-BP INS、NT772
哈等人(2003)报道了 M1S1 基因的新突变,导致越南家庭出现 GDLD( 137290 )。M1S1 基因测序揭示了从核苷酸位置 772 到 783 的一个 12 bp 片段的缺失,并插入核苷酸 T 代替缺失的片段。

.0008 凝胶状滴状角膜营养不良
TACSTD2, LEU186PRO
在一个 10 岁的日本男孩患有 GDLD( 137290 ),Taniguchi 等人(2005)确定了 TACSTD2 基因突变的复合杂合性:557T-C 转换,导致 leu186 到 pro(L186P) 取代和 Q118X( 137290.0001 )。谷口等人(2005)提出 L186P 突变可能会改变 TACSTD2 产物的结构,导致正常功能丧失。