半乳糖变旋酶
GALM 基因编码半乳糖变旋酶( EC 5.1.3.3 ),该酶将 β-D-半乳糖转化为 α-D-半乳糖,这是 Leloir 途径的第一步(Wada 等人总结,2019 年)。
▼ 克隆与表达
通过使用乳酸乳球菌半乳糖变旋酶(Galm) 的蛋白质序列作为查询的数据库搜索,Timson和 Reece(2003)确定了人类 GALM。通过分析凝胶过滤,细菌表达和纯化的 GALM 蛋白具有 32 kD 的分子量。
▼ 基因功能
使用旋光法,Timson 和 Reece(2003)表明,将 GALM 添加到半乳糖或葡萄糖的糖溶液中导致糖突变旋转率增加,半乳糖观察到更高的速率。Timson 和 Reece(2003)分别突变了 3 个 GALM 残基,这些残基与 L. lactis Galm 的晶体结构的催化作用有关,并发现突变的 GALM 蛋白具有降低的变旋酶活性。
▼ 生化特征
索登等人(2004)确定了 GALM 的 X 射线晶体结构,包括未结合的和与 β-D-半乳糖复合的。GALM 折叠成 2 个 α 螺旋和 29 个 β 链,通过 25 个经典反向转弯连接。存在两个顺式肽键,并且 glu307 和 his176 的侧链位于适合分别充当催化碱和酸的位置。半乳糖与 GALM 结合后未观察到显着的结构变化。
▼ 测绘
楚等人(1975)提出了 gal-1-PT、酸性磷酸酶、MDH-1 和 gal-plus-activator(GLAT) 的同线性以及分配到 2 号染色体的细胞杂交证据。
▼ 分子遗传学
Wada 等人在 8 名患有半乳糖血症(GALAC4; 618881 ) 的无关日本儿童中,在 GALK1( 604313 )、GALE( 606953 ) 或 GALT( 606999 ) 基因中未发现突变(2019)鉴定了 GALM 基因中纯合或复合杂合状态的 5 种不同突变( 137030.0001 - 137030.0005))。前 2 名患者的突变通过基于 trio 的全外显子组测序发现,随后患者的突变通过 Sanger 测序确定。在 4 个家族中证实了突变与表型的分离。与对照细胞相比,2 名患者的类淋巴母细胞中 GALM 活性降低,3 名患者的外周血单个核细胞缺乏 GALM 蛋白。使用 3 个变体进行的放线菌酮蛋白质稳定性测定表明,与野生型相比,蛋白质稳定性显着降低。研究结果表明突变的功能丧失效应。
岩泽等人(2019 年)通过 COS-7 细胞中的表达研究和/或酶功能研究检查了 ExAC 数据库中 66 个流行的、未报告的 GALM 变体(57 个错义、7 个停止增益、2 个移码)。29 个变体不产生或产生微弱的蛋白质表达,并被归类为致病性。五个变体具有低蛋白质表达和低酶活性,并被归类为可能致病。其余 32 种变异基于 30 种正常的酶活性和 2 种轻度降低的酶活性被分类为良性。另外一个普遍的剪接位点突变被认为是致病的。
▼ 等位基因变体( 5个精选示例):
.0001 半乳糖血症 IV
GALM,1-BP DEL,294C
在 2 名不相关的日本半乳糖血症 IV(GALAC4; 618881 ) 儿童中,Wada 等人(2019)确定了 GALM 基因突变的复合杂合性。两个孩子都携带一个 1 bp 缺失(c.294delC,NM_138801.2),导致移码和提前终止密码子(Ile99LeufsTer46);患者 1 还携带 c.244C-T 转换,导致 arg82 到 ter(R82X; 137030.0002 ) 替换,患者 2 携带 c.799C-G 颠换,导致 arg267 到 gly(R267G; 137030.0003 ) 在保守残基上的取代。这些突变是通过基于三重奏的外显子组测序发现的,并通过 Sanger 测序确认。通过对另外 6 名半乳糖血症儿童进行 Sanger 测序,Wada 等人(2019)确定了1(患者3)中c.294delC突变的纯合性。在所有 3 个家族中,突变都与疾病分离。和田等人(2019 年)在纯合子患者的淋巴母细胞中显示缺乏 GALM 酶活性,并且在 PBMC 中缺乏蛋白质表达。与野生型相比,293FT 细胞中具有缺失或 R82X 变体的 GALM 表达显示蛋白质表达降低,而 R267G 变体显示蛋白质表达和稳定性降低。
.0002 半乳糖血症 IV
GALM,ARG82TER
讨论 GALM 基因中的 c.244C-T 转换(c.244C-T,NM_138801.2),导致 arg82-to-ter(R82X) 取代,在复合杂合状态的患者中发现Wada 等人的半乳糖血症 IV(GALAC4; 618881 )(2019),见137030.0001。
.0003 半乳糖血症 IV
GALM,ARG267GLY
讨论 GALM 基因中的 c.799C-G 转换(c.799C-G,NM_138801.2),导致 arg267 到甘氨酸(R267G)取代,这在半乳糖血症患者的复合杂合状态中发现Wada 等人的IV(GALAC4; 618881 )(2019),见137030.0001和137030.0004。
.0004 半乳糖血症 IV
GALM,GLY142ARG
通过对 6 名不相关的日本半乳糖血症 IV(GALAC4; 618881 )患者的 GALM 基因进行 Sanger 测序, Wada 等人(2019)确定了一个 c.424G-A 转换(c.424G-A, NM_138801.2),导致在保守残基处发生 gly142 到 arg(G142R) 取代。该突变在 3 名患者(患者 5、6、8)中是纯合的,在 1 名(患者 7)中是具有 c.799C-G 转换的复合杂合的,导致 arg267 到甘氨酸(R267G;137030.0003)取代。与野生型相比,GALM 在 293FT 细胞中的任何一种变体的表达显示出降低的蛋白质表达和稳定性。在 gnomAD 数据库中,仅在非洲人群中的 1 个个体中发现 G142R 突变处于纯合状态。
.0005 半乳糖血症 IV
GALM,TRP311TER
通过 Sanger 对一名患有半乳糖血症 IV(GALAC4; 618881 )的日本儿童(患者 4) 中的 GALM 基因进行测序, Wada 等人(2019)确定了 c.932G-A 转换(c.932G-A,NM_138801.2)的纯合性,导致 trp311-to-ter(W311X) 替代。与野生型相比,GALM 与 W311X 变体在 293FT 细胞中的表达显示出降低的蛋白质表达和稳定性。