Y框 结合蛋白 1
HLA II 类基因的表达受一系列顺式作用元件和反式作用因子的调节。已经确定了几个顺式作用元件,并被称为 Z 框、X 框、Y 框、八聚体和 TATA 框。Y 框包含一个倒置的 CCAAT 框。迪迪埃等人(1988)分离出编码 Y 框结合蛋白的 cDNA,称为 YB1 或 NSEP1。YB1 结合对 CCAAT 框有绝对要求,对 Y 框有相对特异性。它的分子量为 35,414,含有 18% 的碱性残基和推定的核定位信号。迪迪埃等人(1988)发现 YB1 和 HLA-DR(β) mRNA 水平呈负相关,表明 YB1 是一种负调节因子。
通过筛选含有人类表皮生长因子受体(EGFR; 131550 ) 增强子或人类 c-erbB2( 164870 ) 启动子的DNA 片段的人类胎盘 cDNA 表达文库,Sakura 等人(1988)分离出编码 DBPA( 603437 ) 和 DBPB(NSEP1) 的cDNA 。推断的 DBPA 和 DBPB 蛋白质共享一个中心区域,其中 109 个氨基酸中的 100 个在 2 个蛋白质之间是相同的。HeLa 细胞 RNA 的 Northern 印迹分析检测到 2.3-kb DBPB 转录本。
斯皮特科夫斯基等人(1992)通过筛选 HeLa 细胞 cDNA 表达文库和含有来自人乳头瘤病毒 18 型增强子的 YB1 识别位点的寡核苷酸克隆了编码 YB1 的 cDNA。他们指出,他们的 cDNA 序列与 DBPB 的序列相同(Sakura 等人,1988),并且与Didier 等人分离的 YB1 cDNA 的序列几乎相同(1988 年)。来自 24 周大的人类胎儿的 RNA 的 Northern 印迹分析显示 YB1 基因的差异表达。使用针对 YB1 合成肽的抗体对 HeLa 细胞和成纤维细胞提取物进行免疫印迹分析,鉴定出 42 kD 的核蛋白。
使用含有 MYC 基因( 190080 ) 基因的 NSE 的寡核苷酸作为探针,Kolluri 和 Kinniburgh(1991)从 HeLa 细胞 cDNA 表达文库中克隆了 NSEP1。推导出的 322 个氨基酸蛋白质包含 4 个推定的 DNA 结合结构域,其中 3 个富含碱性氨基酸。这些基本区域中的两个,basic-1 和 basic-2,形成蛋白质的双链 DNA 结合结构域。NSEP1 还具有富含 pro/ser/thr 的结构域和富含 asp/glu/gln 的结构域,这两者都让人联想到激活结构域。它还包含一个八肽单链 DNA 结合基序,与 RNA 结合蛋白的核糖核蛋白共有序列具有弱同源性。
工藤等人(1995)通过筛选与人类白唾液酸蛋白( 182160 ) 启动子结合的蛋白质,孤立出编码 DBPA 和 DBPB 的人类 cDNA 。人体组织的 Northern 印迹分析检测到骨骼肌和心脏中的 DBPB 表达水平最高。作者分离了几个 DBPB 处理的假基因,并确定它们对应到许多不同的染色体。
科尔斯等人(1996)通过筛选能够与人 GMCSF( 138960 ) 启动子中的阻遏元件结合的蛋白质,孤立出人 DBPA 和 DBPB cDNA 。推导出的 324 个氨基酸的 DBPB 蛋白包含一个中央冷休克结构域(CSD),它是一个高度保守的、大约 100 个氨基酸的结构域,与细菌冷休克蛋白相似。DBPB 的过表达导致 GMCSF 启动子的抑制。
▼ 基因功能
Fukada和 Tonks(2003)发现 Yb1 在 Rat1 细胞中的过表达导致 Ptp1b( 176885 ) 表达增加。Yb1 的消耗降低了 Ptp1b 的表达,增加了对胰岛素的敏感性,并增强了通过细胞因子受体 gp130(IL6ST; 600694 ) 的信号传导,这被 Ptp1b 的重新表达所抑制。Fukada 和 Tonks(2003)还发现 PTP1B 和 YB1 在几种人类癌细胞系和 II 型糖尿病动物模型中的表达之间存在相关性(参见125853)。他们得出结论,YB1 是 PTP1B 表达的重要调节因子。
Bhullar 和 Sollars(2011)发现 Ybx1 在造血前体细胞系小鼠红系髓样淋巴克隆 1(EML) 中高度表达,但在髓系分化期间它在髓系祖细胞和 Gmcsf 处理的 EML 细胞中下调。谱系阴性/Il7R( 146661 )-阴性/试剂框( 164920) 阳性/Sca1 阳性细胞和谱系阴性/Il7r 阴性/Kit 阳性/Sca1 阴性细胞与小鼠骨髓中的分化细胞(如粒细胞)相比表达高 Ybx1 水平。Ybx1 在不同发育阶段的髓样白血病细胞中高水平表达。在人白血病细胞系中敲除 YBX1 可抑制增殖能力、诱导细胞凋亡并诱导巨核细胞分化,以响应三氧化二砷处理。Bhullar 和 Sollars(2011)得出结论,YBX1 在骨髓分化过程中下调,白血病细胞中异常的 YBX1 表达可能通过阻断分化促进白血病的发展。
▼ 基因结构
牧野等人(1996)确定了 YB1 基因的第一个外显子和 2,000 个上游核苷酸的核苷酸序列。第一个外显子异常大,包含 166 bp 的编码序列和一个 331 bp 的非翻译区。第一个外显子周围的 GC 含量约为 70%,并且 CpG-free 区域位于非翻译序列中。主要转录起始位点之前的片段不包含 TATA 框、CCAAT 框或已知转录因子的结合序列。使用氯霉素乙酰转移酶(CAT) 基因的瞬时表达测定表明,从 +24 到 +281 的序列对 CAT 表达至关重要。对其他基因组噬菌体 DNA 的 PCR 分析表明,几个克隆来自假基因。
▼ 测绘
工藤等人(1995)使用原位杂交将人类 NSEP1 基因定位到 1p34-p33。通过荧光原位杂交,Makino 等人(1996)将 NSEP1 基因对应到 1p34。