苹果酸酶 2
线粒体 NAD(+) 依赖性苹果酸酶(ME2;EC 1.1.1.39 ) 将苹果酸转化为丙酮酸,并参与神经递质 γ-氨基丁酸(GABA) 的神经元合成(Greenberg 等人,2005 年总结)。ME2是由核基因决定的线粒体酶的一个例子。
▼ 克隆与表达
通过使用基于胰蛋白酶肽序列的简并引物进行 PCR,Loeber 等人(1991)从纤维肉瘤 cDNA 文库中克隆了 ME2。推导出的 584 个氨基酸前体蛋白的计算分子量为 65.4 kD。转录本的 5 元非翻译区包含一个 80 个核苷酸序列,该序列非常富含 G/C(76.3%)。ME2 包含一个线粒体前导序列、一个两亲性 α 螺旋、一个 ADP 结合折叠和一个推定的二核苷酸结合域。
▼ 基因功能
洛伯等人(1991)报道,在大肠杆菌中表达的重组人 ME2 的比活性没有线粒体前导序列,与从人肌肉中纯化的 NAD(+) 依赖性 ME 的比活性相似。重组酶使用 NAD(+) 而不是 NADP(+) 作为辅因子。ATP具有抑制作用,延胡索酸降低了苹果酸脱羧的Km。通过分析重组蛋白,Loeber 等人(1991)证明活性 ME2 四聚体由相同的亚基组成,并且该蛋白质不需要广泛的翻译后修饰即可获得活性。
江等人(2013)表明 p53( 191170 ) 抑制三羧酸循环相关苹果酸酶 ME1( 154250 ) 和 ME2 在人和小鼠细胞中的表达。这两种苹果酸酶对 NADPH 的产生、脂肪生成和谷氨酰胺代谢都很重要,但 ME2 具有更深远的影响。通过抑制苹果酸酶,p53 调节细胞代谢和增殖。ME1 和 ME2 的下调通过不同的 MDM2-( 164785 ) 和 AMP 活化蛋白激酶(AMPK;参见602739 )相互激活 p53) 以前馈方式介导的机制,支持该途径并增强 p53 活化。ME1 和 ME2 的下调也调节 p53 激活的结果,导致强烈诱导衰老,但不会导致细胞凋亡,而苹果酸酶的强制表达会抑制衰老。江等人(2013)得出结论,他们的发现定义了苹果酸酶的生理功能,证明了维持 p53 激活的正反馈机制,并揭示了新陈代谢与 p53 介导的衰老之间的联系。
▼ 基因结构
柳原等人(2001)确定 ME2 基因包含 16 个外显子。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Yanaihara 等人(2001)将 ME2 基因对应到染色体 18q21。
▼ 分子遗传学
有关 ME2 基因中由 9 个单核苷酸多态性(SNP) 组成的单倍型与特发性全身性癫痫(参见 IGE,600669)之间可能关联的讨论,请参见154270.0001。
▼ 历史
线粒体苹果酸酶的电泳变体已在小鼠( Shows et al., 1970 ) 和人类( Cohen and Omenn, 1972 ) 中得到证实。波维等人(1975)证实了线粒体苹果酸酶的多态性,Burchell 等人(1977)研究了它的性质。Roychoudhury 和 Nei(1988)将等位基因变异的基因频率数据制成表格。ME2 缺乏 Friedreich 共济失调( 229300 ),在强制性杂合子中具有中等水平。
Kompf 等人(1985)在 6pter-p24 上发现 ME2 和凝血因子 XIII 的 A 亚基(F13A; 134570 ) 密切相关。在 0.10 的重组分数下获得了 4.33 的最大 lod 分数。由于 F13A 与 HLA 相关联,并且Kompf 等人(1985)发现 ME2 不是,因此建议 ME2 在 6p 上必须位于 F13A 的远端。
▼ 等位基因变体( 1 示例):
.0001 重新分类 - 意义不明的变体
ME2,单倍型(rs674351,rs584087,rs585344, rs608781,rs642698,rs674210,rs645088, rs649224,rs654136)
这种变体,以前称为癫痫,特发性一般化,易感性,已根据Lenzen 等人的研究结果重新分类(2005)。
格林伯格等人(2005)报道了特定9-SNP单倍型的鉴定是,当存在于纯合状态,增加了对青少年发病特发性全身性癫痫(参见IGE,风险600669)6倍(优势比,6.1; 95%CI, 2.9-12.7) 与检查的任何其他基因型相比。他们的分析同时使用了病例对照和基于家庭的关联方法,得出了强有力的证据表明 ME2 基因易患 IGE。作者还观察到 IGE 综合征亚组之间的关联。易感性单倍型由 SNP rs674351、rs584087、rs585344、rs608781、rs642698、rs674210、rs645088 定义、rs649224和rs654136。
伦岑等人(2005)分析了 600 名德国 IGE 患者的 ME2 多态性的等位基因和基因型频率,其中 416 名青少年发病,666 名德国对照。在对照组和整个 IGE 组(p 大于 0.22)或青少年发病 IGE 组(p 大于 0.25)之间,任何 ME2 多态性的等位基因和基因型频率均无显着差异。与对照组相比,当以纯合状态存在时,在 IGE 患者中没有发现假定的风险赋予单倍型存在关联的迹象(p 大于 0.18)。