核仁前 rRNA 加工蛋白 NIP7
NIP7 是精确的 pre-rRNA 加工和核糖体生物合成所需的 RNA 结合蛋白( Morello et al., 2011 )。
▼ 测绘
Gross(2021)基于 NIP7 序列(GenBank AF085360 ) 与基因组序列(GRCh38)的比对,将 NIP7 基因对应到染色体 16q22.1 。
▼ 基因功能
莫雷洛等人(2011)发现在人类细胞中敲除 NIP7 会降低增殖率,导致细胞在 G1-S 过渡期积累。分级分析显示 NIP7 耗尽细胞中 40S 核糖体亚基显着减少。进一步的分析揭示了 NIP7 缺陷细胞中 pre-rRNA 加工水平的缺陷。NIP7 结合核仁中的前核糖体颗粒,从而参与早期的前 rRNA 加工反应。体外分析显示 NIP7 与 poly(U) 和 poly(AU) RNA 相互作用。
通过酵母 2 杂交筛选人胎儿脑 cDNA 文库,Morello 等人(2011)鉴定了RNA结合蛋白FTSJ3(618411) 作为 NIP7 的互动伙伴。NIP7 和 FTSJ3 之间的相互作用依赖于 RNA,因为它是通过 RNA 分子发生的。免疫荧光分析显示表位标记的 NIP7 和 FTSJ3 在转染的 HeLa 细胞的核仁中共定位。在 HEK293 细胞中敲除 FTSJ3 会破坏 NIP7 与核仁中前核糖体的结合,导致前 rRNA 加工缺陷。NIP7 和 FTSJ3 都参与了人类细胞中的 pre-rRNA 加工和核糖体合成,但 FTSJ3 主要是早期加工步骤所必需的,而 NIP7 是导致 18S rRNA 合成的晚期加工步骤所必需的。HEK293 细胞中 FTSJ3 的条件性敲低降低了细胞增殖率。
▼ 生化特征
刘等人(2004)确定了人类 NIP7 的晶体结构,他们将其称为 KD93,分辨率为 1.9 埃。KD93由2个相互连接的α-β结构域组成,称为N和C结构域,通过短α螺旋连接。KD93 的 C 结构域与一些 RNA 修饰酶的 RNA 结合 PUA 结构域相匹配。