NIDOGEN 1
Entactin 是一种 150-kD 硫酸化糖蛋白,是基底膜的主要成分,与层粘连蛋白形成高度稳定的非共价复合物(见150320)。杜尔金等人(1988)从 cDNA 克隆的测序中推导出小鼠 entactin 的完整氨基酸序列。
长吉等人(1989)报道了人类巢蛋白的完整氨基酸序列、推断的结构域和 RFLP。
▼ 基因功能
Bercsenyi 等人(2014 年)表明,神经肌肉接头处存在的巢蛋白(也称为 entactins)是破伤风神经元表面蛋白(TeNT) 结合的主要决定因素。通过使用小的巢蛋白衍生肽或遗传消融巢蛋白来抑制 TeNT 与巢蛋白的相互作用,可防止 TeNT 与神经元的结合,并保护小鼠免受 TeNT 诱导的痉挛性麻痹。Bercsenyi 等人(2014 年)得出结论,他们的研究结果表明,细胞外基质蛋白直接参与了神经肌肉接头处的破伤风神经元表面蛋白受体。
▼ 基因结构
杜尔金等人(1995)发现小鼠 entactin 基因的长度至少为 65 kb,包含 20 个外显子。小鼠基因的外显子组织与多肽组织成不同的结构和功能域密切相关。
齐默尔曼等(1995)描述了人类 nidogen 基因,该基因由 20 个外显子组成,长度至少为 90 kb。各种蛋白质亚结构域显示由单个外显子编码。CpG 岛存在于第一个外显子周围,从基因组序列的核苷酸 -400 到 +600。
▼ 生化特征
Chung 和 Durkin(1990)提供了结构证据,表明 entactin 可以作为基底膜中两种最丰富的分子之间的桥梁:IV 型胶原蛋白(见120130)和层粘连蛋白。
晶体结构
高木等人(2003)以 2.3 埃的分辨率测定了具有层粘连蛋白的 nidogen-1 G3-III 复合物的晶体结构。相互作用结构域的结构揭示了一个 6 叶片 tyr-trp-thr-asp(YWTD) β-螺旋桨结构域在与层粘连蛋白中的层粘连蛋白表皮生长因子样(LE) 模块 III3-5(LE3-5) 结合的巢蛋白中。层粘连蛋白 LE 模块 4(LE4) 在 β 螺旋桨的伪 6 折轴上结合到圆形剧场形表面,层粘连蛋白 LE3 结合在其边缘。关闭 β 螺旋桨充满水的中心孔的 phe 残基、圆形剧场的刚性和高度的形状互补性使得能够为 LE4 构建一个进化上保守的结合表面,其小尺寸具有前所未有的高亲和力。Wnt 辅助受体 LRP5 的超形突变(603506 ) 建议Takagi 等人(2003 年)类似的 YWTD β-螺旋桨界面用于结合在发育途径中起作用的配体。作为内吞受体起作用的 LDLR 蛋白( 606945 ) 还包含一个 YWTD β-螺旋桨结构域,与 nidogen-1 中存在的结构域相比,该结构域缺乏 β- 集线器中结合袋底部的封闭。螺旋桨。
▼ 测绘
马泰等人(1989)使用原位杂交将人类巢基因定位到染色体 1q43。奥尔森等人(1989)报告了映射研究和表达研究的细节。
詹金斯等人(1991)将 nidogen 基因(Nid )对应到小鼠 13 号染色体,并显示与米色(bg) 突变的联系。bg 突变被认为是 Chediak-Higashi 综合征(CHS; 214500 )的小鼠同源物。
▼ 分子遗传学
通过分析精子重组,Jeffreys 和 Neumann(2005)确定一个 NID1 热点与一个小卫星相关联,这表明热点可能使 DNA 易于串联重复。与邻近的 MS32 热点不同,NID1 中的交叉分辨率断点避开了小卫星,在热点内产生了冷点。在靠近 NID1 热点中心的位置,他们发现了一个 SNP,他们将其称为 M-57.8T/C,位于 MS32 热点上游 57.8 kb 处,似乎直接影响交叉起始的频率。定量基因转化分析表明,该 SNP 对基因转化和交叉频率的影响程度非常相似,这表明转化和交叉可能由相同的重组起始事件触发。抑制重组的 T 等位基因被过度传递给重组后代,
待确认的关联
参见131390.0001讨论 NID1 基因突变与 Dandy-Walker 畸形与枕部头膨出之间的可能关联(ADDWOC; 609222 )。
▼ 动物模型
Murshed 等人(2000)产生了 Nid1 缺陷小鼠并确定纯合小鼠既不产生 Nid1 mRNA 也不产生蛋白质。令人惊讶的是,纯合子小鼠是可生育的,并且它们的基底膜看起来正常。然而,在某些基底膜(例如,横纹肌内皮、心脏和肾脏)中,Nid2 表达通常很少增加,而不会上调 Nid2 的产生或改变 perlecan(HSPG2;142461)或层粘连蛋白的表达。作者得出结论,尽管 NID1 存在于所有正常的基底膜中,但与 LAMC1( 150290 )不同,它不是基底膜形成或维持所必需的。
▼ 等位基因变体( 1 示例):
.0001 意义未知的变体
NID1、GLN388TER
该变体被归类为意义不明的变体,因为尚未证实其对 Dandy-Walker 畸形伴枕部头膨出(ADDWOC; 609222 ) 的影响。
在一个大型 3 代越南家庭的 14 名受影响成员中,患有常染色体显性遗传 Dandy-Walker 畸形伴枕部头膨出,最初由Bassuk 等人报道(2004),达布罗等人(2013)确定了 NID1 基因中 c.1162C-T 转换(chr1:236,201,527; GRCh37) 的杂合性,导致 gln388-to-ter(Q388X) 替代预计会导致整个 G2 和 G3 区域的丢失NID1,包括直接与 LAMC1( 150290 )相互作用的 β-螺旋桨结构域。在 384 条越南对照染色体或 dbSNP(build 135)、1000 Genomes Project 或 NHLBI Exome Sequencing Project 数据库中未发现该突变。没有报告变体的功能分析。