小核糖核蛋白多肽E

SNRPE 编码 U snRNPs 的核心蛋白,这是前 mRNA 加工剪接体的关键因素(Pasternack 等人总结,2013 年)。

▼ 克隆与表达

许多系统性红斑狼疮( 152700 )患者循环使用针对广泛的小核核糖核蛋白复合物(snRNP) 的 Sm 自身抗体。一些抗 Sm 血清识别的蛋白质之一是 11,000-Da E 蛋白。该蛋白质是与 U 家族(U1、U2、U4、U5 和 U6)中所有已知 snRNA 相关的 4 个“核心”蛋白质之一(Wieben 等,1985;Stanford 等,1987)。

斯坦福等人(1988)给出了完整的核苷酸序列。最长的开放解读码组编码一种基本的 92 个氨基酸的蛋白质,其氨基酸序列与从纯化的 E 蛋白中获得的氨基酸序列完全一致。

在 RT-PCR 之后,Pasternack 等人(2013)进行了半定量 PCR,发现 SNRPE 无处不在,包括在皮肤和毛囊细胞中。免疫组织化学显示在毛囊、表皮和真皮的所有细胞的细胞核中存在 SNRPE。在 9 日龄 C57BL/6J 小鼠的背部皮肤中观察到相同的 SNRPE 免疫反应模式。

▼ 基因结构

E 蛋白的基因长 9 kb,包含 5 个外显子。该序列已知有 9 个密切相关的基因,这些基因具有加工假基因的几个特征(Neiswanger 等,1988)。

▼ 测绘

内斯万格等人( 1988 , 1990 ) 通过体细胞和原位杂交的组合将 E 蛋白基因定位到 1q32。内斯万格等人(1990)通过与 1q32 区域中的标记的遗传连锁证实了这一分配。他们指出,至少有一个 SNRPE 假基因与信号转导 G 蛋白基因( 139380 )相关联,该基因也对应到 1 号染色体。另外两个小核核糖核蛋白(snRNP) 成分——U1 RNA“真”多基因家族( 180680))和一组 I 类 U1 假基因——位于 1 号染色体上。一个 U2 snRNA 基因簇(RNU2;180690)位于 17 号染色体上,而 19 号染色体编码 U1 特异性 70K 蛋白(180740)。

▼ 分子遗传学

在一个 4 代西班牙家庭的受影响成员和 2 名散发性少毛症患者(HYPT11; 615059 ) 中,Pasternack 等人(2013)确定了 SNRPE 基因中 2 个不同突变的杂合性(128260.0001和128260.0002)。通过免疫荧光分析对突变 SNRPE 的亚细胞定位以及突变 SNRPE 蛋白掺入 U snRPS 是正常的,这表明这些变体改变了 U snRNP 在剪接中的功能,而不是它们的生物发生。

▼ 等位基因变体( 2 精选示例):

.0001 庸人自扰 11
SNRPE,1A-G
在患有少毛症的 4 代西班牙家庭的受影响成员中(HYPT11;615059),之前Just 等人报道过(1998)和一个无关的 12 岁英国女孩Pasternack 等人(2013)确定了 SNRPE 基因中 1A-G 转换的杂合性,改变了基因的起始密码子(MET1)。该突变在两个家族中都与疾病分离,并且在 880 条德国或 598 条西班牙对照染色体、dbSNP 或 1000 基因组计划数据库中均未发现。表达 SNRPE 1A-G 的 HEK293T 细胞的蛋白质印迹分析揭示了 N 端截短的蛋白质,表明该突变可能导致使用替代的框内下游起始密码子。

.0002 庸人自扰 11
SNRPE, GLY45SER
Pasternack 等人在一名患有少毛症的 8 岁突尼斯男孩(HYPT11; 615059 ) 中(2013)确定了 SNRPE 基因中 133G-A 转换的杂合性,导致 Sm 基序 1 中高度保守的残基发生 gly45 到 ser(G45S) 取代。据报道,他的父母不受影响,但无法获得用于分析。该突变未在 880 条德国对照染色体或 598 条西班牙对照染色体中发现,也未出现在 dbSNP 或 1000 基因组计划数据库中。HEK293T 细胞的功能分析表明,与野生型相比,突变体向 U snRNP 的掺入减少。