二氢酰胺S-琥珀酰转移酶

DLST 基因编码二氢硫辛酰胺琥珀酰转移酶,它是柠檬酸循环(TCA) 中 α-酮戊二酸(α-KG) 脱氢酶复合物结构核心的组成部分。α-酮酸脱氢酶复合物(丙酮酸脱氢酶复合物、α-酮戊二酸脱氢酶复合物和支链α-酮酸脱氢酶复合物)是多酶复合物家族。它们位于线粒体中并催化 α-酮酸的氧化脱羧。这 3 种 α-酮酸脱氢酶复合物由 3 种不同的酶组成:α-酮酸脱氢酶(E1;300502)、二氢硫辛酰胺酰基转移酶(E2)和二氢硫辛酸脱氢酶(E3;238331)(Nakano 等人的总结,1993)。 .

▼ 克隆与表达

中野等人(1993)从人成纤维细胞 cDNA 文库中分离出对应于 DLST 的 cDNA。氨基酸序列分析支持他们之前的观察(Nakano 等,1993),即人二氢硫辛酰胺琥珀酰转移酶缺乏 E1 和/或 E3 结合位点的序列基序。通过 Northern 印迹分析,Ali 等人(1994)检测到 DLST 在外周组织和大脑中的普遍表达。

▼ 基因结构

中野等人(1993)发现 DLST 基因包含 3 个外显子和 4 个内含子,并且所有内含子的 5-prime 供体和 3-prime 受体位点的核苷酸序列符合 gt-ag 规则。

▼ 基因功能

DLST 是 α-酮戊二酸脱氢酶复合物的 E2 组分。与其他 2 种 α-酮酸脱氢酶复合物、丙酮酸脱氢酶复合物(见300502)和支链α-酮酸脱氢酶复合物(见608348)的 E2成分相比,α-KGDC E2 具有独特的结构由 2 个结构域组成,缺少 E3 和/或 E1 结合位点的序列基序(Patel 和 Harris,1995)。

▼ 测绘

通过荧光原位杂交,Nakano 等人(1993)发现 DLST 基因位于 14q24.2-q24.3,相关序列位于 1p31。支链α-酮酸脱氢酶复合物(DBT;248610)的二氢硫辛酰胺酰基转移酶基因是2型枫糖浆尿病(见248600)的突变位点,位于1p31。中野等人(1993)提到 DLST 基因突变可能是对应到 14q24.3 的家族性阿尔茨海默病的原因的可能性(AD3; 607822 )。阿里等人(1994)通过同位素原位杂交将 DLST 基因(用 KGDHC 表示)对应到 14q24.3。他们使用的 cDNA 也与 1p31 上的一个明显的 E2k 假基因交叉杂交。

▼ 分子遗传学

在 4 名患有副神经节瘤-7(PGL7; 618475 ) 的无关患者(患者 3-6 )中,Remacha 等人(2019)在 DLST 基因中发现了种系杂合错义突变(G374E; 126063.0001)。对来自 3 名患者的肿瘤组织的分析显示,由于父本染色体的单亲二体性(UPD),DLST 的杂合性(LOH) 丧失。尽管 3 名先证者有携带突变的无症状家庭成员,但与不完全外显率一致,但这些患者均没有该疾病的家族史;1 例患者的谱系表明是从头发生的。敲除人类 H838 细胞中的 DLST 基因导致 TCA 循环中碳流的显着阻断,这种缺陷可以通过野生型 DLST 修复,但不能通过 G374E 突变体修复。体外功能表达研究表明,与野生型相比,G374E 突变体的催化活性有所降低,导致高 α-KG/富马酸盐比率和肿瘤代谢物 2-羟基戊二酸(2HG) 的积累,特别是 L-2HG 对映异构体。对患者肿瘤的分析显示 DLST 的强免疫染色以及高甲基化表型,归类为非 CIMP(CpG 岛甲基化表型)簇,以及 HIF3A 表达增加的假缺氧状态。609976)。研究结果表明,DLST 可以充当肿瘤抑制基因,并强调 TCA 循环中的异常在副神经节瘤的发病机制中发挥作用。该突变是通过对 104 名无关 PGL 患者的候选 TCA 基因进行靶向二代测序发现的,并通过 Sanger 测序得到证实。在另外 3 个先证者中发现了 DLST 中的杂合错义变体(R231Q、D304N 和 Y422C),但对这 3 个其他错义变体的体外功能研究表明,它们在所使用的测定中表现得与野生型 DLST 相似。另一名患者携带杂合剪接位点突变,但这没有进一步研究。除了具有 G374E 变体的患者外,没有其他患者在肿瘤组织中显示出 LOH。然而,Remacha 等人(2019) 不能排除这些变体还有其他未知的影响。

▼ 等位基因变体( 1 选定示例):

.0001 副神经节 7
DLST, GLY374GLU( rs1270341616 )
在 4 名患有副神经节瘤-7(PGL7; 618475 ) 的无关患者(患者 3-6 )中,Remacha 等人(2019)鉴定了 DLST 基因外显子 14 中的种系杂合 c.1121G-A 转换(c.1121G-A,NM_001933),导致催化结构域中高度保守的残基发生 gly374 至 glu(G374E)取代。该突变是通过 TCA 循环中候选基因的靶向下一代测序发现并通过 Sanger 测序证实的,在 gnomAD 数据库的 123,121 个等位基因中发现了 2 个。对来自 3 名患者的肿瘤组织的分析显示,由于父本染色体中的单亲二体(UPD),DLST 的杂合性(LOH) 丢失。体外功能分析表明,该突变损害了蛋白质的催化活性,导致癌代谢物 2HG 的异常积累。