2 号染色体开放解读码组 69

通过大规模表达分析,Sterrenburg 等人(2004)将 C2ORF69(他们称为 FLJ38973 )鉴定为在人类原代成肌细胞培养物分化过程中上调的基因。

Lausberg 等人在 COS-7 细胞中的表达研究(2021)表明 C2ORF69 定位于接近但不符合 TOMM20( 601845 ),与定位到线粒体基质一致。删除 C2ORF69 的前 24 个氨基酸消除了线粒体定位。

王等人(2021)将 C2ORF69 定位到人成纤维细胞的线粒体中。在存在浓度增加的毛地黄皂苷的情况下用蛋白酶 K 处理 HEK293T 线粒体提取物表明,大多数 C2ORF69 与细胞质面上的线粒体外膜相关。

▼ 基因结构
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劳斯伯格等人(2021)指出 C2ORF69 基因有 2 个外显子。

▼ 测绘
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Gross(2021)基于 C2ORF69 序列(GenBank BC036456 ) 与基因组序列(GRCh38)的比对将 C2ORF69 基因定位到染色体 2q33.1 。

▼ 基因功能
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使用酵母 2-杂交系统,Lausberg 等人(2021)表明 C2ORF69 具有 35 个假定的相互作用伙伴,包括线粒体蛋白 BOLA3( 613183 )、CMPK2( 611787 )、ETFA( 608053 )、KLHDC9( 617375 ) 和SD4HB( 1 )。

▼ 分子遗传学
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在来自 4 个家族(德国、土耳其和 2 个库尔德语)的6 名合并氧化磷酸化缺陷-53(COXPD53;619423)的患者中,Lausberg 等人(2021)在 C2ORF69 基因中鉴定了相同的纯合突变( 619219.0001 )。在 2 个受影响的巴基斯坦同胞中,Lausberg 等人(2021)在 C2ORF69 基因( 619219.0002 ) 中发现了一个不同的纯合突变。通过全外显子组测序确定并通过 Sanger 测序确认的突变与家族中的疾病分离。

在来自 8 个无血缘关系的 COXPD53 家族的 12 名患者中,Wong 等人(2021)鉴定了 C2ORF69 基因中的纯合突变(619219.0001;619219.0003 - 619219.0006)。通过全外显子组测序发现并通过 Sanger 测序证实的突变与家族中的疾病分离。

▼ 动物模型
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王等人(2021)使用 CRISPR/Cas9 编辑产生 c2orf62 敲除斑马鱼。到 8 个月大时,与野生型斑马鱼相比,敲除斑马鱼的体重和身长都减少了,它们在 8 到 10 个月大时死于自发性癫痫发作。在受精后 7 至 11 天的敲除斑马鱼幼虫和 2 至 3 个月大的敲除斑马鱼中观察到由戊四唑(PTZ) 诱导的癫痫发作潜伏期减少。在 4 个月大时,基因敲除鱼显示出中枢神经系统炎症的迹象,包括 il1-β( 147720 )、tgf-β( 190180 ) 和 tnf-α( 191160 ) 的表达增加。

▼ 等位基因变体( 7 精选示例):
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.0001 复合氧化磷酸化缺陷 53
C2ORF69, 1-BP DEL, 298C
在来自 4 个家庭的 6 名患者中,包括 2 名无关的库尔德患者(家庭 1 和 2)、2 名德国同胞(家庭 3)和 2 名土耳其同胞(家庭 4),合并氧化磷酸化缺陷-53(COXPD53;619423),劳斯伯格等(2021)确定了 C2ORF69 基因中 1 bp 缺失(c.298delC,NM_153689.6)的纯合性,导致移码和过早终止(Gln100SerfsTer18)。通过全外显子组测序确定并通过 Sanger 测序确认的突变与家族中的疾病分离。在来自一名患者的淋巴细胞中,C2ORF69 RNA 的水平与对照组相当,但不存在该蛋白质,表明截短蛋白质的不稳定性。

在来自 3 个 COXPD53 家族的 5 名患者中,包括 2 名库尔德土耳其同胞(家族 1)、2 名伊朗同胞(家族 4)和一名伊拉克患者(家族 7),所有患者均为近亲出生,Wong 等人(2021)确定了 C2ORF69 基因中 c.298delC 突变的纯合性。通过全外显子组测序确定并通过 Sanger 测序确认的突变与家族中的疾病分离。该突变不存在于 gnomAD(v.2.1.1 和 v.3.1)或 TOPmed 数据库或由超过 50,000 个基因组/外显子组组成的内部数据库中。在家庭 7 中,该患者有 4 名同样受影响的已故同胞和 1 名同样受影响的活着的同胞,他们没有接受突变检测。

.0002 复合氧化磷酸化缺陷 53
C2ORF69, 5-BP DEL, NT843
Lausberg 等人在 2 名患有联合氧化磷酸化缺陷 53(COXPD53; 619423 ) 的巴基斯坦同胞(5 族)中进行了研究(2021)确定了 C2ORF69 基因中 5 bp 缺失(c.843_847del,NM_153689.6)的纯合性,导致移码和过早终止(Lys282GlnfsTer55)。通过全外显子组测序鉴定并通过Sanger测序证实的突变在父母中以杂合状态存在。

.0003 复合氧化磷酸化缺陷 53
C2ORF69,1-BP DEL,280G
在突尼斯患者(家庭 2)中,由近亲父母所生,患有联合氧化磷酸化缺陷-53(COXPD53;619423),Wong 等人(2021)确定了 C2ORF69 基因中 1 bp 缺失(c.280delG,NM_153689.5)的纯合性,导致移码和过早终止(Glu94SerfsTer24)。通过全外显子组测序发现并通过Sanger测序证实的突变在父母中以杂合状态存在。该突变不存在于 gnomAD(v.2.1.1 和 v.3.1)或 TOPmed 数据库或由超过 50,000 个基因组/外显子组组成的内部数据库中。

.0004 复合氧化磷酸化缺陷 53
C2ORF69, 5-BP DEL, 588TTTAA
在 3 名沙特阿拉伯患者(第 3 家庭)中,一个血缘家庭合并氧化磷酸化缺陷-53(COXPD53;619423),Wong 等人(2021)确定了 C2ORF69 基因中 5 bp 缺失(c.588delTTTAA,NM_153689.5)的纯合性,导致移码和过早终止(Asn196LysfsTer4)。通过全外显子组测序鉴定并通过Sanger测序证实的突变在父母中以杂合状态存在。据报道,该突变在公共数据库中具有 0.00002 的次要等位基因频率,但没有报告纯合子。还有一个同样受影响的家庭成员已故,没有接受这种突变的检测。

.0005 复合氧化磷酸化缺陷 53
C2ORF69, 3-BP DEL, NT311
在埃及患者(家庭 5)中,由近亲父母所生,患有联合氧化磷酸化缺陷-53(COXPD53;619423),Wong 等人(2021)确定了 C2ORF69 基因中 3 bp 缺失(c.311_313del,NM_153689.5)的纯合性,导致保守位点(Leu104_Tyr105delinsHis)的缺失和插入。通过全外显子组测序发现并通过Sanger测序证实的突变在父母中以杂合状态存在。

.0006 复合氧化磷酸化缺陷 53
C2ORF69, 17-BP DEL, NT909
在叙利亚患者(619423)中,由近亲父母所生,患有联合氧化磷酸化缺陷-53(COXPD53;619423),Wong 等人(2021)确定了 C2ORF69 基因中 17 bp 缺失(c.909_925del,NM_153689.5)的纯合性,导致移码和过早终止(Ser304LeufsTer29)。通过全外显子组测序发现并通过Sanger测序证实的突变在父母中以杂合状态存在。该突变不存在于 gnomAD(v.2.1.1 或 v.3.1)或 TOPmed 数据库或由超过 50,000 个基因组/外显子组组成的内部数据库中。该患者有 2 个未检测突变的受影响的已故同胞。

.0007 复合氧化磷酸化缺陷 53
C2ORF69、TRP310TER
在土耳其患者(8 号家庭)中,出生于近亲父母,患有联合氧化磷酸化缺陷-53(COXPD53;619423),Wong 等人(2021)确定了 C2ORF69 基因中 c.929G-A 转变(c.929G-A,NM_153689.5)的纯合性,导致 trp310 到 ter(W310X)取代。通过全外显子组测序鉴定并通过Sanger测序证实的突变在父母中以杂合状态存在。该突变不存在于 gnomAD(v.2.1.1 和 v.3.1)或 TOPmed 数据库或由超过 50,000 个基因组/外显子组组成的内部数据库中。