核糖体蛋白 L13A
RPL13A属于高度保守的L13核糖体蛋白家族,是60S核糖体亚基和成熟80S核糖体的组成部分。RPL13A 作为 γ-干扰素(IFNG; 147570 ) 激活的翻译抑制剂(GAIT) 复合物的一个组成部分具有核糖体外功能,其在炎症期间介导翻译沉默(Kour 等人的总结,2019 年)。
RPL13A 是 4 种内含子小核仁 RNA(snoRNA) 的宿主基因:U32(SNORD32A)、U33(SNORD33)、U34(SNORD34) 和 U35(SNORD35A)(Higa 等,1999)。
▼ 克隆与表达
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通过比较建模和结构分析,Das 等人(2013)在 203 个氨基酸的人类 RPL13A 蛋白中鉴定了 2 个潜在的 RNA 结合基序(氨基酸 53 到 75 和 169 到 179)。
通过序列分析,Kour 等人(2019)表明,除了进化上保守的 N 端球状结构域外,人类 RPL13A 还包含真核生物特异性 C 端延伸。N 端球状结构域和真核生物特异性 C 端结构域都包含假定的核定位信号(NLS) 和 RNA 结合序列。
▼ 基因结构
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比嘉等人(1999)确定 RPL13A 基因包含 8 个外显子,跨度约为 4.2 kb。其启动子区具有 CREB (CREB1; 123810 ) 结合位点、TATA 样序列和聚嘧啶束。基因组织和启动子特征在小鼠 Rpl13a 中是保守的。此外,启动子特征在 RPS11( 180471 ) 中是保守的,它在小鼠和人类中与 RPL13A 串联。小鼠和人类 RPL13A 基因的内含子 2、4、5 和 6 分别包含 U32(SNORD32A)、U33(SNORD33)、U34(SNORD34) 和 U35(SNORD35A) 小核仁 RNA(snoRNA) 的基因。
▼ 测绘
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通过序列分析,Higa 等人(1999)确定 RPL13A 和 RPS11 基因在染色体 19q13.3 上相距约 4.6 kb。基因以相同的方向转录。Rpl13a 和 Rpl11 的串联排列在小鼠中是保守的,7 号染色体上的基因间隔约 1.6 kb。
▼ 基因功能
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Mukhopadhyay 等(2008)指出 RPL13A 的磷酸化对于 GAIT 复合物对炎症基因的翻译抑制至关重要。他们发现 IFN-γ 激活了激酶级联反应,其中 DAPK(DAPK1; 600831 ) 激活了 ZIPK(DAPK3; 603289),然后在人 U937 细胞中磷酸化 RPL13A 的 ser77。DAPK-ZIPK 对 RPL13A 的磷酸化不仅是激活 RPL13A 和随后从核糖体中释放所必需的,也是 GAIT 介导的翻译沉默所必需的。GAIT 介导的翻译沉默然后靶向并抑制 DAPK 和 ZIPK 表达,使 RPL13A 返回到非磷酸化、无活性的形式。这种负反馈电路将细胞恢复到基础状态,允许随后通过重复刺激重新诱导 GAIT 目标转录物。
通过酵母 2-杂交筛选人类睾丸 cDNA 文库,Sato 等人(2011)鉴定RPS7(603658)和作为RPL13A SRY(480000)-interacting蛋白质。下拉测定证实 SRY 的 HMG 框是其与 RPS7 和 RPL13A 相互作用所必需的。在瞬时转染的 COS1 细胞中,SRY、RPS7 和 RPL13A 共定位于核斑点中。
贾等人(2012)发现氧化修饰的低密度脂蛋白(LDLox) 通过选择性降解 RPL13A 并防止在人骨髓细胞中形成活性、成熟的 GAIT 复合物来抑制 GAIT 介导的翻译控制。RPL13A 的磷酸化是其被泛素化系统识别和降解所必需的。GAPDH( 138400 ) 通过与新释放的磷酸化 RPL13A 结合并保护其免受蛋白酶体降解,从而充当新释放的磷酸化 RPL13A 的分子伴侣。然而,LDLox S-亚硝基化的 GAPDH 使 GAPDH 的保护功能失活,导致磷酸化的 RPL13A 泛素化和降解以及 GAIT 复合物活性的丧失。
通过突变和梯度沉降分析,Das 等人(2013)发现人类 RPL13A 的 arg68 对其结合 rRNA 并整合到核糖体中是必不可少的。免疫荧光分析显示 RPL13A 在核糖体生物发生过程中与核仁素(NCL; 164035),但这种易位不足以掺入核糖体。RPL13A 与核仁蛋白结合或其易位到核仁中不需要 Arg68。RPL13A 在生物发生过程中被整合到 90S 前核糖体中,并且是 90S 前核糖体的有效 rRNA 甲基化所必需的。将 RPL13A 组装到 GAIT 复合物中不需要核糖体掺入,也不需要 IFN-γ 诱导的 RPL13A 在 ser77 磷酸化。相反,ser77 的磷酸化阻止了 RPL13A 在核糖体生物发生过程中掺入核糖体。
通过突变分析,Kour 等人(2019)在人 RPL13A 的真核生物特异性 C 端延伸中鉴定出相互排斥的氨基酸,这些氨基酸直接参与核糖体掺入和 GAIT 介导的翻译沉默。C 端延伸内预测的 NLS 中的突变影响 RPL13A 的核仁易位,但不影响核易位,表明 RPL13A 中存在多种复杂的核输入信号。
▼ 动物模型
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李等人(2016)生成 Rpl13a-snoless 小鼠,其中 Rpl13a 基因中的所有 4 个内含子 snoRNA 都被删除,但 Rpl13a 正常表达。纯合的 Rpl13a-snoless 小鼠出生时形态正常,孟德尔比率,可生育,并且没有明显的病理生理表型。然而,来自 Rpl13a-snoless 胚胎的成纤维细胞显示出减少的氧化应激反应。Rpl13a-snoless 小鼠具有改善的葡萄糖耐量和胰岛素分泌,这是由于响应葡萄糖挑战的胰岛胰岛素分泌增加所致。更大的胰岛胰岛素分泌是由于线粒体质子泄漏增强引起的 Rpl13a-snoless 胰岛中较低的活性氧。Rpl13a-snoless 小鼠对致糖尿病刺激的反应有所改善,这提供了 Rpl13a snoRNA 导致小鼠高血糖的证据。