25-KD 亚基核糖核酸酶 P/MRP
RPP25 是核糖核酸酶 P(RNase P) 和 RNase MRP 的蛋白质亚基,其参与处理前体 tRNA,参与处理前体 rRNA 和生成用于线粒体 DNA 复制的 RNA 引物。RNase P 和 RNase MRP 均由催化性 RNA 种类 H1 RNA(RPPH1; 608513 ) 和 RMP RNA(RMRP; 157660 ) 和 10 个共享蛋白质亚基组成,包括 RPP25(Welting 等人的总结,2004 年)。
▼ 克隆与表达
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通过从 HeLa 细胞中纯化人类 RNase P,然后搜索 EST 数据库,Guerrier-Takada 等人(2002)获得了 RPP25 的全长序列。人类 RPP25 包含 199 个氨基酸,预测分子量为 20.6 kD。人类、小鼠和果蝇 RPP25 直向同源物共享大约 20% 的氨基酸同一性。
Hands-Taylor 等人(2010)报道人类 RPP25 包含一个预测的 Alba 型核心域,两侧是 N 和 C 端延伸。RPP25 及其直向同源物的一个显着特征是带有保守 GYQxP 特征的长 C 端延伸。色谱分析表明 RPP25 主要作为溶液中的单体存在。
▼ 测绘
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Gross(2021)基于 RPP25 序列(GenBank BC002497 ) 与基因组序列(GRCh38)的比对将 RPP25 基因定位到染色体 15q24.2 。
▼ 基因功能
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Guerrier-Takada 等人使用纯化的重组蛋白(2002)表明人类 RPP25 结合 RNA。
Welting 等人使用下拉分析(2004)研究了人类 RNase MRP 复合体亚基之间的相互作用。在复合物中,RPP25 直接与 RPP20(POP7;606113)相互作用。作者在 RNase MRP RNA 成分中确定了 RPP25 的 2 个结合位点,一个在 P3 区域,另一个在 P4/P19 区域。
Hands-Taylor 等人(2010)确定人类 RPP20 和 RPP25 直接相互作用并形成化学计量比为 1:1 的异二聚体。这种相互作用主要是由 RPP20 和 RPP25 的 Alba 型核心域介导的。每个 RPP20-RPP25 异二聚体与 MRP RNA 的 P3 臂相互作用,形成化学计量比为 1:1:1 的复合物。
▼ 生化特征
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陈等人(2018)以 2.25 埃的分辨率确定了人 RPP20-RPP25 异源二聚体的晶体结构。整体结构揭示了 2 种结构相似的多肽,它们表现出核酸结合蛋白 Alba 超家族共有但不同的核心折叠特征。Rpp20-Rpp25 的异源二聚化界面也表现出进化保守性,每个异源二聚体的亚基之间的相对方向存在细微差异。Rpp20-Rpp25 的界面表明,与古菌 Alba 蛋白相比,RNA 结合不太可能引起蛋白质或异二聚体的实质性构象变化。Rpp20-Rpp25 的 RNA 结合表面几何形状与 Alba 蛋白二聚体的不同。
吴等人(2018)分别以 3.9 和 3.7 埃的分辨率确定了单独的人类 RNase P 全酶和与 tRNA-val(见615310)复合的低温电子显微结构。人类 RNase P 全酶类似于由 H1 RNA 组织的右手形夹子。H1 RNA 与所有蛋白质成分相互作用,这些成分反过来包裹 H1 RNA 并将其稳定在扩展构象中。RPP20和RPP25在结构内形成了一个马鞍形异二聚体,异二聚体与POP1(602486) 通过 RPP25 的 β-sheet 扩展。RPP20-RPP25 异源二聚体也与 H1 RNA 的 P3 分支相互作用。人类 RNase P 与 pre-tRNA-val 复合物的结构表明,tRNA 底物诱导 RNase P 催化中心的局部构象变化,将酶从非活性状态转变为活性状态。