包含卷曲螺旋结构域的蛋白质 186
CCDC186 控制跨高尔基网络中致密核囊泡(DCV) 的成熟(Ailion 等人,2014 年)。
▼ 克隆与表达
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艾利昂等人(2014)克隆了秀丽隐杆线虫 Ccdc186,他们称之为 Cccp1。两个交替剪接的转录本产生 734 和 743 个氨基酸的 Cccp1 亚型,两者都包含多个卷曲螺旋结构域。Cccp1 在其他后生动物(包括苍蝇和人类)中有一个保守的直系同源物,但在后生动物之外没有发现。人类 CCCP1 包含 898 个氨基酸。秀丽隐杆线虫 Cccp1 在大多数或所有神经元、肠和受精囊中表达,但不在咽、皮肤或肌肉中表达。荧光标记的 Cccp1 主要定位于神经元细胞体中的秀丽隐杆线虫核周斑点,并与 Rund1(RUNDC1; 619250 ) 和 Rab2( 179509 )共定位于跨高尔基网络。
Cattin-Ortola 等人(2017 年)表明,荧光标记的 Cccp1 位于线虫神经元中未成熟的 DCV 和反式高尔基体附近。荧光标记的和内源性大鼠 Cccp1 在大鼠胰岛素瘤细胞中显示出相似的定位。Cccp1 的 C 末端片段包含第三个卷曲螺旋结构域,作者称之为 CC3 结构域,对于 Cccp1 在秀丽隐杆线虫和大鼠细胞中的定位既必要又充分。Cccp1 直向同源物存在于大多数后生动物中,包括原始后生动物,以及与后生动物密切相关的 2 种单细胞生物。Cccp1 的 CC3 结构域是该蛋白质最高度保守的区域。
▼ 测绘
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Gross(2021)基于 CCDC186 序列(GenBank BC103499 ) 与基因组序列(GRCh38)的比对将 CCDC186 基因定位到染色体 10q25.3 。
▼ 基因功能
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使用遗传筛选,Ailion 等人(2014)将 Cccp1 确定为秀丽隐杆线虫 DCV 功能的调节剂。神经元中 Cccp1 的表达减少或过度表达会导致运动缺陷。酵母 2 杂交试验表明 Cccp1 与 GTP 结合和野生型 Rab2 发生物理相互作用。Cccp1 在 DCV 成熟中与 Rund1 和 Rab2 在相同的遗传途径中起作用,并且需要 Cccp1 和 Rund1 来介导 DCV 货物的分类。
使用下拉分析,Cattin-Ortola 等人(2017)表明,秀丽隐杆线虫 Cccp1 的 CC3 域对于 Cccp1 与 Rab2 结合是必要和充分的。CC3 对于 线虫 中的 Cccp1 神经元功能也是必要的,但还不够。大鼠 Cccp1(一种胞质蛋白)的 CC3 结构域介导其与细胞膜的关联。生物物理分析表明,秀丽隐杆线虫 Cccp1 具有高尔金的特征(见602502),因为它形成低聚物并具有细长的结构。
▼ 分子遗传学
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待确认的关联
关于常染色体隐性遗传婴儿型脑病与 CCDC186 基因双等位基因变异之间可能关联的讨论,请参见619249.0001和619249.0002。
▼ 等位基因变体( 2 精选示例):
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.0001 未知显着性的变体
CCDC186, GLN204TER
该变异被归类为意义不明的变异,因为它对婴儿型脑病的影响尚未得到证实。
在一名 4 岁男孩(患者 16W-0208)中,出生于沙特近亲父母,患有婴儿型脑病,Monies 等人(2017)在 CCDC186 基因的外显子 2 中发现了一个纯合的 c.610C-T 转换(c.610C-T,NM_018017),导致 gln204-to-ter(Q204X) 取代。该突变是通过全外显子组测序发现的,并通过 Sanger 测序证实。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计会导致功能丧失。这些患者是由 1,000 个疑似孟德尔疾病的沙特家庭组成的大型队列的一部分,这些家庭接受了全外显子组测序。患者发育迟缓、运动迟缓、智力发育受损并伴有言语迟缓、肌张力减退、视力不佳、睾丸未降、小阴茎和脑萎缩。
.0002 未知显着性的变体
CCDC186、SER256TER
该变异被归类为意义不明的变异,因为它对婴儿型脑病的影响尚未得到证实。
Brugger 等人在一个 15 个月大的女孩中,出生于塞内加尔的近亲父母,患有婴儿型脑病(2021)鉴定了 CCDC186 基因中的纯合 c.767C-G 颠换(c.767C-G,NM_018017.2),导致 ser256-to-ter(S256X) 取代。该突变是通过纯合子映射和全外显子组测序的组合发现并通过 Sanger 测序证实的,与家族中的疾病隔离。gnomAD 数据库中不存在纯合变体。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计会导致无义介导的 mRNA 衰减和功能丧失。患者在婴儿早期出现全面发育迟缓和肌张力减退。在 7 个月大时,她出现了严重的难治性癫痫性脑病,脑电图显示与高度心律失常相关,这与 West 综合征的临床诊断一致。其他特征包括小头畸形、生长迟缓、严重的整体发育迟缓,缺乏视觉固定,以及需要饲管的喂养困难。她在脑部 MRI 上有非特异性额颞叶萎缩,怀疑有胰腺外分泌缺陷。