含三方基序的蛋白质 52
TRIM52 是一个非常规 TRIM 家族成员,它包含人类基因组中编码的最大 RING 域(Malfavon-Borja 等,2013)。TRIM52 涉及各种细胞功能的调节,包括感染、细胞周期进程和增殖(Fan 等人,2016 年;Benke 等人,2018 年)。
▼ 克隆与表达
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范等人(2016)指出,TRIM 蛋白通常包含一个保守的 RBCC 基序,其中包括一个环指结构域、1 或 2 个 B 框和一个卷曲螺旋区域,位于它们的 N 端一半。TRIM 蛋白的 C 端结构域是可变的。TRIM52 在 TRIM 蛋白中是独一无二的,因为它只包含 RING 域和 B框 域。
Fan 等人使用免疫荧光分析(2017)表明荧光标记的人类 TRIM52 定位于转染的 293T 细胞的细胞质和细胞核。
▼ 测绘
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Gross(2021)基于 TRIM52 序列(GenBank BC007372 ) 与基因组序列(GRCh38)的比对将 TRIM52 基因定位到染色体 5q35.3 。
▼ 基因功能
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Fan 等人使用蛋白质印迹分析(2016)表明 BHK-21 和 293T 细胞中人 TRIM52 的异位表达会削弱日本脑炎病毒(JEV) 的感染。需要 TRIM52 的 RING 域来控制 JEV 复制。TRIM52 的 RING 指结构域具有 E3 泛素连接酶活性,TRIM52 可以通过 RING 域依赖性 E3 连接酶活性在 293T 细胞中自我泛素化。TRIM52 与 JEV 病毒蛋白 Ns2a 发生物理相互作用,通过其依赖 RING 结构域的 E3 连接酶活性促进 Ns2a 的泛素化,并通过蛋白酶体途径介导 Ns2a 降解。
范等人(2017)发现 293T 细胞中的 TRIM52 过表达激活了核因子 kappa-B(NFKB;见164011)信号通路并诱导了NFKB介导的促炎细胞因子的产生。缺失分析表明,TRIM52 的 RING 结构域对于 NFKB 激活至关重要。TRIM52 过表达不影响 IKBA(NFKBIA;164008)和 p65(RELA;164014),NFKB 激活中的 2 个关键调节分子,因为 TRIM52 激活了 IKBA 下游的 NFKB。进一步的分析表明,TRIM52 参与了TNFA( 191160 ) 介导的NFKB活化并促进了 TNFA 诱导的促炎细胞因子的表达,并且 TRIM52 的表达是由促炎细胞因子诱导的。
Benke 等人使用 RT-PCR 分析(2018)显示TRIM52 mRNA在各种人类癌细胞系中以中等水平表达。TRIM52 是最佳细胞生长和存活所必需的,因为敲除 TRIM52 以依赖于细胞环境的方式降低了癌细胞的适应性。对 U87MG 异种移植小鼠模型的研究表明,敲除 TRIM52 也减少了肿瘤生长,因为敲除 TRIM52 的癌细胞在 G0/G1 细胞周期阶段积累,导致细胞周期进展和增殖减少。TRIM52 敲低诱导的整体 mRNA 变化与葡萄糖代谢反应的改变一致,但进一步的分析表明,TRIM52 敲低后癌细胞增殖的减少并非源于细胞能量产生的改变。相反,一项竞争分析表明,TRIM52 消融可能会降低 p53(TP53;191170 ) 依赖方式。
使用 RT-PCR 和蛋白质印迹分析,Hacker 等人(2019)表明 TRIM52 在所有测试的人类细胞系中均以中低水平普遍表达。TRIM52 消融显着降低了细胞健康。对人类 TRIM52 基因座的分析表明,TRIM52 从 TRIM52 转录起始位点直接上游的基因相邻 93 bp 基因间区域组成型表达,TRIM52 表达由多个转录因子驱动。在刺激条件(如高尔基体毒素)诱导的复杂细胞应激期间,TRIM52 表达上调,但 TRIM52 蛋白也被蛋白酶体迅速降解,使蛋白质保持在低稳态水平。TRIM52 的 RING、B框 和 C-末端结构域都有助于其降解,RING 结构域中的重复酸性环是主要的不稳定区域之一。
▼ 进化
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Malfavon-Borja 等(2013)分析了 TRIM 家族成员的阳性选择,以确定灵长类动物的候选抗病毒基因。他们发现 TRIM52 在 TRIM 基因中是独一无二的,因为它只编码 RING 和 B-Box 域,并且缺乏推定的病毒识别(B30.2) 域。TRIM52 通过来自 TRIM41 基因( 610530 ) 的基因复制产生,随后在多个哺乳动物和灵长类动物谱系中孤立丢失或假基因化 TRIM52。与其他 TRIM 蛋白相比,TRIM52 和 TRIM41 都显着扩展了 RING 结构域。RING 域仅在灵长类动物 TRIM52 中在正选择下进化,表明它代表了一种新的宿主-病毒相互作用界面。