鞭毛内转移相关蛋白

IFTAP 是一种转录抑制因子(Hong 等人,2008 年),与鞭毛内转运复合物 A(IFTA)相互作用,介导纤毛蛋白的转移(Takahara 等人,2019 年)。

▼ 克隆与表达
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塞布拉特等人(2005)克隆了小鼠 Iftap,他们将其称为 Nwc,并在包括人类在内的各种物种中鉴定了它的直系同源物。小鼠和人类 NWC 分别包含 221 和 244 个氨基酸。NWC 在进化上高度保守,其外显子/内含子结构和定位在 RAG 基因座内(参见 RAG1, 179615) 在脊椎动物中保守。RT-PCR 显示 Nwc 在所有检查的小鼠组织中均有表达。然而,Nwc 在 Rag1 阴性未成熟和成熟的 T 和 B 淋巴细胞中不表达。使用 5-prime RACE,作者发现 Rag1 启动子控制了 T 和 B 淋巴细胞中的 Nwc 表达,Nwc 转录为 Rag1-Nwc 杂合 mRNA 分子。在其他细胞类型中,Rag1 启动子是沉默的,Nwc 的表达受 Rag2 基因( 179616 )外显子 2 和 3 之间的启动子控制,该基因在 T 和 B 淋巴细胞中沉默。作者还鉴定了人和鸡胸腺细胞中的混合 RAG1-NWC 转录本。

李等人(2005)基于它与 SARS 冠状病毒的非结构蛋白 10 的相互作用,从人胚胎肺 cDNA 文库中克隆了 IFTAP。在后续行动中,Hong 等人(2008)报道称人类 IFTAP,他们称之为 HEPIS,包含 147 个氨基酸和 5 个 CK2(见115440)磷酸化位点。Northern印迹分析表明,HEPIS主要在人肺、肝、卵巢和肾中表达,在肌肉和骨骼中表达较低。

使用报告小鼠,Kasztura 等人(2016)发现 Nwc 蛋白在睾丸中高表达,在脑和骨髓中表达较低。

▼ 基因结构
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塞布拉特等人(2005)确定 IFTAP 基因包含 6 个外显子,跨度约为 70 kb。

▼ 测绘
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通过数据库分析,Hong 等人(2008)将 IFTAP 基因定位到 11 号染色体。

Gross(2021)基于 IFTAP 序列(GenBank BC009561 ) 与基因组序列(GRCh38)的比对将 IFTAP 基因定位到染色体 11p12 。

塞布拉特等人(2005)报道了 IFTAP 基因图谱位于人类、小鼠和其他脊椎动物的 RAG 基因位点内。IFTAP 以与上游 RAG1 基因相同的方向转录,与 RAG2 的转录方向相反。IFTAP 的 5-prime UTR 位于 RAG2 基因的内含子 2 内。

▼ 基因功能
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使用记者系统,Hong 等人(2008)表明,HEPIS 通过与 BTF3( 602542 )(RNA 聚合酶 II 起始复合物的组分)以及靶基因的 TATA 序列相互作用,抑制由各种元件诱导的转录。HEPIS 的表达降低了转染的 HeLa 细胞的增殖,但敲除人成纤维细胞中的 HEPIS 并没有显着改变增殖。

使用共免疫沉淀分析,Kasztura 等人(2016)确定了几种蛋白质作为小鼠睾丸中候选 Nwc 结合伙伴,包括参与纤毛形成和功能的蛋白质。免疫染色显示,Nwc 位于诱导纤毛发生后从 NIH3T3 细胞表面突出的大多数初级纤毛中。

使用免疫沉淀分析,Takahara 等人(2019)表明人类 IFTAP,他们称之为 C11ORF74,通过 IFT122( 606045 ) 亚基与 IFTA 复合物相互作用。这种相互作用是由 IFT122 的 N 端 WD40 重复区和 C11ORF74 的 C 端保守区介导的。在缺乏 IFTA 亚基 IFT139 的细胞中,C11ORF74 在纤毛尖端积累,表明纤毛内 C11ORF74 转移与 IFTA 复合物相关。然而,人 TERT-RPE1 细胞中的 C11ORF74 敲除分析表明 C11ORF74 不参与 IFT 颗粒的转移,而是参与了 BBSome(见209900)和 ARL6(608845)的纤毛定位。

▼ 动物模型
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卡斯图拉等人(2016)发现缺乏 Nwc 的小鼠没有表现出明显的形态学、解剖学、生理学或生殖异常。同样,Takahara 等人(2019)发现 C11orf74 -/- 小鼠表现出正常的外观和生育能力,没有任何纤毛功能障碍特征的症状。