包含卷曲螺旋结构域的蛋白质 59
CCDC59 是一种甲状腺转录因子,可调节肺细胞中的表面活性蛋白 B(SPB,或 SFTPB;178640)和 SPC(SFTPC;178620)启动子(Yang 等,2006)。
▼ 克隆与表达
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Yang 等人使用酵母 1-杂交筛选人肺 cDNA 文库(2001)基于 CCDC59 与 SPB 近端启动子区域的相互作用,克隆了 CCDC59,他们将其称为 BR22。预测的 241 个氨基酸的 BR22 蛋白包含 3 个潜在的二分核定位信号。Northern印迹和RT-PCR分析表明BR22在所有检查的人体组织中都表达为1.3-kb的转录本。
Yang 等人使用蛋白质印迹分析(2003)发现内源性 CCDC59,他们称之为 TAP26,在 HEK293 细胞中具有 34 kD 的表观分子质量,而计算出的分子质量为 26 kD。免疫组织化学染色显示,TAP26在人肺细胞中与 SPB 和甲状腺转录因子-1(TTF1,或 NKX2-1;600635)协同表达。
▼ 基因功能
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Yang 等人使用酵母 2-杂交分析(2001)表明 BR22 与 TTF1 相互作用,用纯化的重组蛋白进行的体外结合试验证实了直接相互作用。BR22 和 TTF1 在转染的 HEK293 细胞中形成复合物,并协同作用以增加人 SPB 启动子的反式激活活性。
Yang 等人使用免疫沉淀分析(2003)表明内源性 TAP26 和 TTF1 相互作用并在 H441 人肺上皮细胞中形成复合物。
使用染色质免疫沉淀分析,Yang 等人(2006)将 TAP26 鉴定为人肺细胞中 SPB 和 SPC 启动子复合物的组分。TAP26 通过与 TTF1 相互作用激活这些启动子。TTF1/TAP26 复合物以剂量依赖性方式刺激 H441 细胞中的 SPB 和 SPC 启动子活性。在 H441 细胞中,TAP26 单独诱导 SPB 启动子活性,但不诱导 SPC 启动子活性。然而,在小鼠肺 MLE12 细胞中,TTF1/TAP26 复合物或 TAP26 仅刺激 SPB 启动子活性,而不刺激 SPC 启动子活性。研究结果表明,SPC 启动子对复合物的反应机制与 SPB 启动子不同,TTF1 和 TAP26 都不是 MLE12 细胞中 SPC 启动子的限制因素。RT-PCR 分析表明,与 MLE12 细胞相比,H441 细胞中 TTF1 和 TAP26 的表达较低,表明 TTF1/TAP26 复合物激活的 SPC 启动子活性已经在 MLE12 细胞中得到优化,但在 H441 细胞中没有得到优化。此外,MLE12 细胞中 TTF1/TAP26 复合物对 SPC 启动子的刺激需要 SPC 启动子近端区域的 TTF1 结合位点 T4 和 T5。
▼ 基因结构
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杨等人(2003)确定 CCDC59 基因包含 4 个外显子。
▼ 测绘
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通过数据库分析,杨等人(2003)将 CCDC59 基因定位到染色体 12q。他们在染色体 6q 上发现了一个 CCDC59 假基因。
Gross(2021)基于 CCDC59 序列(GenBank AF161477 ) 与基因组序列(GRCh38)的比对将 CCDC59 基因定位到染色体 12q21.31 。