睾丸相关致癌长非编码 RNA

THORLNC 或 THOR,是一种保守的睾丸特异性长链非编码 RNA(lncRNA),似乎在肿瘤发生中发挥作用(Hosono 等,2017)。

▼ 克隆与表达
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Hosono 等人使用 RNA 测序分析(2017)将 THOR 鉴定为进化上保守的睾丸特异性 lncRNA。RACE 分析揭示了包含 2 个或 3 个外显子的 2 个人类 THOR 变体,Northern 印迹分析显示 H1299 人类肺腺癌细胞中有 3 个外显子转录物。定量 RT-PCR 证实了人体组织中的睾丸特异性表达。RNA 原位杂交显示 THOR 在精母细胞和精子细胞中表达,但在人类睾丸的周围组织中没有表达。作者还确定了小鼠和斑马鱼中的 THOR 直向同源物,RT-PCR 分析证实了这些物种的睾丸特异性表达,在早期发育期间表达升高。分馏分析表明,THOR 定位于 H1299 细胞的细胞质和细胞核。

Liu 等人使用 RT-PCR 分析和 RNA-FISH(2020)表明 THOR 转录物在 H1299 细胞的细胞质中很丰富。

▼ 基因结构
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细野等人(2017)确定 THORLNC 基因包含 3 个外显子。

▼ 测绘
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通过基因组序列分析,Hosono 等人(2017)将 THORLNC 基因定位到染色体 2q14.2。小鼠基因定位到 1 号染色体。

▼ 基因功能
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Hosono 等人使用定量 RT-PCR 分析(2017)表明 THOR 在广泛的人类癌症和癌细胞系中表达。癌细胞中 THOR 的敲除显着降低了它们的增殖能力和集落形成,而 THOR 过表达产生了相反的效果。这些结果在体内小鼠异种移植肿瘤模型中得到证实。RNA 下拉和质谱分析表明 THOR 直接与 IGF2BP1( 608288),THOR 的外显子 2 和 3 以及负责相互作用的 IGF2BP1 的 KH1、KH3 和 KH4 结构域。THOR-IGF2BP1 相互作用在小鼠和斑马鱼中是保守的。通过与 IGF2BP1 相互作用,THOR 调节 IGF2BP1 靶标 mRNA 的水平,因为与 THOR 的相互作用稳定了 IGF2BP1 与其靶标的相互作用。

Liu 等人使用敲除和敲除分析(2020)证实了 THOR 的致癌作用,因为 THOR 缺乏会降低培养的癌细胞和小鼠肿瘤异种移植模型的增殖、集落形成、集落大小、迁移、侵袭和伤口愈合能力。THOR富含N6-甲基腺苷(m6A)修饰,m6A修饰富集参与调节癌细胞增殖。击倒 METTL3( 612472),一种对 m6A 修饰至关重要的甲基转移酶,可显着降低 THOR 上的 m6A 水平并降低 H1299 细胞中的 THOR 表达。突变分析表明,6个预测的m6A修饰位点中有4个被m6A修饰,参与了THOR的调节功能。在确认的 4 个修饰位点中,2 个位点的 m6A 修饰促进了癌细胞增殖,而其他 2 个位点的修饰抑制了癌细胞增殖。m6A 修饰通过 m6A 阅读器 YTHDF1( 616529 ) 和 YTHDF2( 610640 ) 的协同作用改变了 THOR 的稳定性,从而调节 THOR 的转录或衰变,并最终介导 THOR 对细胞增殖的调节。

▼ 动物模型
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细野等人(2017)发现 thor -/- 斑马鱼有受精缺陷。敲除 thor 使斑马鱼对黑色素瘤形成有抵抗力,而人类 THOR 的异位表达增强了斑马鱼的黑色素瘤。