乳房基本保守基因 1 - 核糖体蛋白 L13

亚当斯等人（1992）鉴定了一种代表 mRNA 的新 cDNA，该 mRNA 在良性乳腺病变中的表达水平显着高于在癌中的表达水平。在两种组织中，如通过与组织切片的原位杂交所确定的，在上皮细胞中的表达最高。从核苷酸序列推导出的蛋白质是高度碱性的，没有信号或跨膜序列，但有 2 个潜在的核定位信号。cDNA 与人类和其他哺乳动物基因组中的多个序列以及果蝇、Physarum 和 Schizosaccharomyces pombe 中的单个基因组序列杂交。因此，cDNA代表高度保守的基因序列。在人类细胞中仅鉴定出 1 个主要转录物，但怀疑存在多个假基因。

通过对 8 周龄健康小鼠生长板横截面的免疫组织化学，Le Caignec 等人（2019）证明了 RPL13 在来自肥大和重塑区的细胞中的表达。在位于骨髓隔室中的细胞中观察到较弱的免疫染色。在来自生长板的细胞中也检测到了其他三种核糖体蛋白 RPL3（ 604163 ）、RPS3（ 600454 ）和 RPS10（ 603632 ），并且所有 3 种都显示出与 RPL13 相同的定位模式。

▼ 测绘
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通过体细胞杂交和辐射杂交分析，Kenmochi 等人（1998）将 RPL13 基因定位到 16 号染色体。

勒凯涅克等人（2019）指出 RPL13 基因对应到 16q24.3。

▼ 基因功能
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使用 siRNA，Le Caignec 等人（2019）敲低了 HeLa 细胞中的 RPL13，并在 Northern 印迹分析中观察到 pre-rRNA 模式的严重改变。最显着的影响是前 rRNA 切割的缺陷，相对于 30S 和 21S 前 rRNA，41S 前 rRNA 的积累，以及 36S 和 36S-C 前 rRNA 的高水平。作者还观察到 12S 前体 rRNA 相对于其前体 32S 前体 rRNA 的水平下降。在用相同 siRNA 处理的对照淋巴母细胞系中观察到类似的模式。

Han 等人在仓鼠 BHK-21 细胞中使用敲低分析（2020）将 Rpl13 确定为口蹄疫病毒（FMDV）复制的重要因素。Rpl13 和 Ddx3（ 300160 ）通过Ddx3的 N 端区域相互作用，并且这两种蛋白质都与 FMDV 5-prime UTR 的内部核糖体进入位点（IRES）相关，从而促进 IRES 驱动的翻译并促进 FMDV 复制。Ddx3 的 C 端区域是其与病毒 IRES 关联所必需的。Rpl13 在 Ddx3 下游起作用，它与 IRES 的相互作用依赖于 Ddx3。Ddx3 与 Rpl13 合作支持 80S 核糖体的组装，以实现 FMDV mRNA 的最佳翻译起始，这也涉及 Eif3e（ 602210 ）和 Eif3j（603910 ）到 IRES。进一步分析表明，Rpl13调节功能也参与了塞内卡谷病毒和猪瘟病毒的感染，但与水泡性口炎病毒的感染无关。

▼ 分子遗传学
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在 4 名 Isidor-Toutain 型脊柱骺端发育不良（SEMDIT; 618728 ）的无关患者中，Le Caignec 等人（2019）在 RPL13 基因（ 113703.0001 - 113703.0004 ）中发现了在公共变异数据库中未发现的从头杂合突变。尽管突变蛋白稳定表达并整合到与野生型蛋白相似的 60S 核糖体亚基中，但培养物中的红细胞增殖和蔗糖梯度上的核糖体谱发生了变化，表明翻译动力学发生了变化。

▼ 等位基因变体（ 4 精选示例）：
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.0001 脊椎骨骺端发育不良，ISIDOR-TOUTAIN 型
RPL13、IVS5DS、GT、+1
在 Isidor-Toutain 型脊柱骺端发育不良（SEMDIST; 618728 ）的男孩（P1）中，最初由Isidor 等人描述（2013 年），Le Caignec 等人（2019）鉴定了 RPL13 基因内含子 5 中从头剪接突变（c.477+1G-T，NM_000977.3）的杂合性，导致 18 个氨基酸插入（Asn159_Val160ins18）。在 dbSNP（build 138）、1000 Genomes Project、NHLBI GO Exome Sequencing Project 或 ExAC/gnomAD 数据库中未发现该突变。对患者外周血 RNA 的 RT-PCR 显示出异常的较长片段，Sanger 测序显示包含内含子 5 的前 54 bp；对来自间充质干细胞的蛋白质裂解物的蛋白质印迹分析证实了 RT-PCR 结果。对来自患者成纤维细胞的总 RNA 的分析显示出正常的前 rRNA 模式，表明该突变体与野生型 RPL13 的掺入程度相同。

.0002 脊椎骨骺端发育不良，ISIDOR-TOUTAIN 型
RPL13、IVS5DS、TC、+2
在 Isidor-Toutain 型脊椎骨骺端发育不良（SEMDIST; 618728 ）的男孩（P2）中，最初由Isidor 等人描述（2013 年），Le Caignec 等人（2019）鉴定了 RPL13 基因内含子 5 中从头剪接突变（c.477+2T-C，NM_000977.3）的杂合性，导致 18 个氨基酸插入（Asn159_Val160ins18）。在 dbSNP（build 138）、1000 Genomes Project、NHLBI GO Exome Sequencing Project 或 ExAC/gnomAD 数据库中未发现该突变。对患者外周血 RNA 的 RT-PCR 显示出异常的较长片段，Sanger 测序显示包含内含子 5 的前 54 bp；来自类淋巴母细胞的蛋白质裂解物的蛋白质印迹分析证实了 RT-PCR 结果。对来自患者淋巴母细胞系的总 RNA 的分析显示出正常的前 rRNA 模式，表明该突变体以与野生型 RPL13 相同的程度掺入核糖体。与对照相比，患者淋巴母细胞中蔗糖梯度的核糖体谱显示游离 40S 与 60s 亚基的比例正常；然而，作者注意到患者样本中 80S 和 polysome 峰的减少，表明翻译动力学发生了变化。此外，作者使用患者 CD34+ 细胞研究了红细胞增殖，并观察到患者样本中只有终末期红细胞分化的晚期阶段受到影响。

.0003 脊椎骨骺端发育不良，ISIDOR-TOUTAIN 型
RPL13、IVS5DS、GA、+1
在患有 Isidor-Toutain 型脊柱骺端发育不良（SEMDIST; 618728 ）的男性患者（P3 ）中，Le Caignec 等人（2019）在 RPL13 基因的内含子 5 中确定了从头剪接突变（c.477+1G-A, NM_000977.3）的杂合性，导致 18 个氨基酸插入（Asn159_Val160ins18）。在 ExAC/gnomAD 数据库中未发现该突变。

.0004 脊椎骨骺端发育不良，ISIDOR-TOUTAIN 型
RPL13、ARG183PRO
在患有 Isidor-Toutain 型脊柱骺端发育不良（SEMDIST; 618728 ）的女性患者（P4 ）中，Le Caignec 等人（2019）确定了 RPL13 基因外显子 6 中从头 c.548G-C 颠换（c.548G-C，NM_000977.3）的杂合性，导致高度保守的 arg183-to-pro（R183P）取代残留物。在 dbSNP（build 138）、1000 Genomes Project、NHLBI GO Exome Sequencing Project 或 ExAC/gnomAD 数据库中未发现该突变。