含有锚蛋白重复和 LEM 结构域的蛋白质 1

ANKLE1 是一种核酸酶,可切割多种分支 DNA 物种(Song 等,2020)。

▼ 克隆与表达
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通过数据库分析,Brachner 等人(2012)鉴定了来自不同物种的 ANKLE1 蛋白。人类 ANKLE1 包含 615 个氨基酸,预测分子量为 65 kD。它有 3 个 N 端锚蛋白(见612641) 重复、一个中央推定的 LEM 结构域和一个包含 GIY-YIG 基序的 C 端区域,以及 2 个推定的核输出信号(NES1 和 NES2)和 2 个推定的核定位信号(NLS1 和 NLS2)。ANKLE1 在后生动物中高度保守,特别是在包括 GIY-YIG 基序的 C 端区域。人和小鼠 ANKLE1 具有 54% 的氨基酸同一性。人骨髓的 RT-PCR 分析还揭示了一个次要的 ANKLE1 剪接变体,它编码了 LEM 结构域内缺少 375 至 400 个氨基酸的同种型。人体组织的半定量 RT-PCR 显示 ANKLE1 主要在骨髓中表达,在胎肝、胎脾和胎胸腺中也观察到高表达。

Zlopasa 等人使用突变分析(2016)将 NES2 和 NLS2 确定为人类 ANKLE1 中介导细胞核和细胞质之间穿梭的主要转运信号。在稳定状态下,核输出似乎超过了核输入,将 ANKLE1 排除在细胞核之外,使其主要位于细胞质中。

▼ 测绘
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Gross(2021)基于 ANKLE1 序列(GenBank BC125274 ) 与基因组序列(GRCh38)的比对将 ANKLE1 基因定位到染色体 19p13.11 。

▼ 基因功能
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Brachner 等人使用重组人类蛋白质(2012)表明,ANKLE1 通过其 LEM 结构域直接结合 BAF(BANF1; 603811 )。ANKLE1 具有由其 C 端 GIY-YIG 基序和切割 DNA 分子介导的内在核酸内切酶活性,从而激活 HeLa 细胞中的 DNA 损伤反应途径。ANKLE1 的 LEM 结构域是 DNA 切割以及诱导 DNA 损伤反应所必需的。

通过在 U2OS 细胞中异位表达人类 ANKLE1,Zlopasa 等人(2016)证明 ANKLE1 定位不会因 DNA 损伤信号传导或有丝分裂过程而改变。

Song 等人使用纯化的重组蛋白(2020)证明人类 ANKLE1 主要是一种结构选择性核酸酶,能够切割多种分支 DNA 物种。ANKLE1 切割靠近螺旋分支点的双链 DNA,突变分析表明,靠近分支点的切割需要 GIY-YIG 基序。