小核仁 RNA，H/ACA BOX，31

SNORA31 是一种小核仁 RNA，预计可作为指导 RNA 用于核糖体 RNA（rRNA）和小核 RNA（snRNA）的假尿苷化（ Lafaille et al., 2019 ）。

▼ 克隆与表达
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拉法耶等人（2019）报道，人类 SNORA31 是一种 130 核苷酸的 H/ACA框类 snoRNA，广泛表达。SNORA31 在脊椎动物中高度保守。

▼ 测绘
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拉法耶等人（2019）指出 SNORA31 基因定位到 13 号染色体，位于其宿主基因TPT1 的外显子 5 和 6 之间（ 600763 ）。

Gross（2021）基于 SNORA31 序列（GenBank AJ609441 ）与基因组序列（GRCh38）的比对将 SNORA31 基因定位到染色体 13q14.13 。

▼ 基因功能
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拉法耶等人（2019）发现 SNORA31 的纯合缺失，而不是杂合缺失，会损害人类中枢神经系统皮层神经元中 18S rRNA 残基 218 的假尿苷化。

▼ 分子遗传学
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在 5 名感染引起的急性脑病-10（IIAE10; 619396 ）的无关患者中，由于 HSV-1 感染表现为前脑疱疹性脑炎，Lafaille 等人（2019）在 SNORA31 基因中发现了 4 个杂合突变（ 619378.0001 - 619378.0004）。通过全外显子组测序发现并通过 Sanger 测序证实的突变在家族分离研究中显示出不完全外显率。所有这些都以非常低的频率出现在 gnomAD 数据库中（小于 3 x 10（-4））。体外功能研究表明，与对照组相比，患者的成纤维细胞（而非 B 细胞）对 HSV-1 和其他嗜神经病毒感染的易感性增加。患者来源的诱导多能干细胞（iPSC）皮质神经元也显示出对 HSV-1 感染的易感性增加。敏感性与 TLR3（ 603029 ）、STAT1（ 600555 ）和干扰素受体无关（参见 IFNAR1, 107450）途径。转录组分析显示，与对照神经元相比，患者来源的神经元细胞在响应 HSV-1 感染时发生了变化。外源性 β-干扰素（IFNB1; 147640 ）使 SNORA31 突变的神经元对 HSV-1 产生抗性，表明一种独特的机制。作者得出结论，发病机制涉及 SNORA31 的单倍体不足，这可能会改变人类转录组反应和对皮层神经元感染的控制，导致无法控制 HSV-1 感染。修饰的转录组反应可能会对控制病毒感染的 TLR3 或 IFNAR 诱导的 1 个或多个免疫效应子的表达产生不利影响，尤其会破坏中枢神经系统（CNS）皮质神经元固有免疫。

▼ 等位基因变体（ 4 精选示例）：
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.0001 脑病，急性，感染性（疱疹特异性），易感性，10
SNORA31、NT36TC
LaFaille 等人在感染引起的急性脑病 10（IIAE10; 619396 ）的2 名无关儿童（P1 和 P2）中表现为由HSV-1 引起的前脑疱疹性脑炎（2019）在 SNORA31 基因的保守核苷酸处鉴定了杂合 c.36T-C 转换。通过全外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变在 gnomAD 数据库中以低频率存在。两个家庭的隔离研究显示不完全外显。对转染突变的患者成纤维细胞和 HEK293 细胞的研究显示 SNORA31 表达降低，表明单倍剂量不足。患者分别来自摩洛哥和沙特阿拉伯。

.0002 脑病，急性，感染性（疱疹特异性），易感性，10
SNORA31、NT75C-G
在一名 20 岁的美国男性（P3）中，感染引起的急性脑病 10（IIAE10; 619396 ）表现为由HSV-1 引起的前脑疱疹性脑炎，LaFaille 等人（2019）在 SNORA31 基因的保守核苷酸处鉴定了杂合的 c.75C-G 颠换。通过全外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变在 gnomAD 数据库中以低频率存在。对转染突变的患者成纤维细胞和 HEK293 细胞的研究显示 SNORA31 表达降低，表明单倍剂量不足。

.0003 脑病，急性，感染性（疱疹特异性），易感性，10
SNORA31、NT96T-G
在一名 63 岁的法国男性（P4）中，感染诱发的急性脑病 10（IIAE10; 619396 ）表现为 HSV-1 引起的前脑疱疹性脑炎，LaFaille 等人（2019）在 SNORA31 基因的保守核苷酸处鉴定了杂合的 c.96T-G 颠换。通过全外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变在 gnomAD 数据库中以低频率存在。对转染突变的患者成纤维细胞和 HEK293 细胞的研究表明，SNORA31 表达正常，没有显性负效应。

.0004 脑病，急性，感染性（疱疹特异性），易感性，10
SNORA31、NT111T-C
在 7 个月大的葡萄牙男孩（P5）中，感染引起的急性脑病 10（IIAE10; 619396 ）表现为 HSV-1 引起的前脑疱疹性脑炎，LaFaille 等人（2019）在 SNORA31 基因的保守核苷酸处鉴定了一个杂合的 c.111T-C 转换。通过全外显子组测序发现并通过 Sanger 测序确认的突变在 gnomAD 数据库中以低频率存在。携带突变的患者未受影响的母亲的 HSV-1 抗体呈阳性，表明外显率不完全。对转染突变的患者成纤维细胞和 HEK293 细胞的研究表明，SNORA31 表达正常，没有显性负效应。