测序几个细胞发一篇SCI？卵母细胞研究了解一下~

卵母细胞的研究可以解释关于配子形成过程的众多谜题，在辅助生殖、农牧育种、基础研究等多种领域都有重要的应用意义。受制于起始样本量低，卵母细胞的测序研究依赖于单细胞水平的核酸扩增和建库技术，这恰恰是安诺优达单细胞产品的拿手好戏！

近期，安诺优达不断收到多位合作客户文章见刊的喜讯，恰逢很多小伙伴咨询卵母细胞研究如何发文，这里小编赶忙整理出了我们的最新合作文章，涉及到了人、小鼠、猪不同物种的卵母细胞研究，满足您的各项需求~

 

 

01

 

Inhibition of HDAC6 by tubastatin A disrupts 小鼠 oocyte meiosis via regulating histone modifications and mRNA expression

 

 

发表日期：2020.7.31

发表期刊：J Cell Physiol

影响因子：5.546

合作单位：吉林大学第一医院

 

样本选择

 

小鼠卵母细胞（Tub‐A处理组和对照组，每组5个生物学重复）

 

研究技术

 

Smart-Seq2单细胞转录组测序

 

技术路线

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主要内容

 

组蛋白脱乙酰酶6（HDAC6）可使&α;-微管蛋白发生脱乙酰基，从而参与小鼠卵母细胞的成熟过程，而如何调节卵母细胞中HDAC6的表达仍然未知。研究者发现小鼠卵母细胞普遍存在高HDAC6表达，而且在启动子区域有较低的甲基化水平。于是加入HDAC6抑制剂tubastatin A（Tub-A）来研究HDAC6在卵母细胞成熟中的作用。结果表明，抑制HDAC6会导致减数分裂进程停滞，扰动纺锤体/染色体组装以及着丝粒-微管附着，但不会损害纺锤体装配检查点功能。此外，抑制HDAC6不仅会增加&α;-微管蛋白的乙酰化程度，还会提高H4K16的乙酰化状态，并降低H3T3和H3S10的磷酸化水平。最后，单细胞RNA测序显示，在Tub-A处理的卵母细胞中，细胞周期相关基因CCNB1、CDK2、SMAD3、YWHAZ和甲基化相关基因DNMT1和DNMT3B的表达被显著抑制。结果表明，HDAC6通过调节卵母细胞减数分裂过程中的几个关键的组蛋白修饰和mRNA转录，在染色体凝聚和着丝粒行使功能中发挥重要作用。

 

 

02

 

Advanced maternal age alters expression of maternal effect genes that are essential for human oocyte quality

 

 

发表日期：2020.2.26

发表期刊：Aging

影响因子：4.83

合作单位：华中农业大学

 

样本选择

 

人卵母细胞（年轻组（age≤30）和年长组（age≥40），每组3个生物学重复）

 

研究技术

 

Smart-Seq2单细胞转录组测序

 

技术路线

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主要内容

 

为了研究产妇年龄对卵母细胞质量的影响，本文使用单细胞RNA测序来检测卵母细胞的整体转录组信息，并鉴定人成熟卵母细胞中受年龄增长影响的关键基因。研究者从成熟卵母细胞中分离mRNA用于scRNA-Seq，其中三个卵母细胞来自于年轻组（≤30），另外三个卵母细胞来自年长组（≥40），共鉴定了357个有组间表达差异的基因。上调的基因在转录激活、氧化应激和免疫功能相关的功能有富集，而下调的基因则与催化活性相关。通过蛋白质相互作用网络分析发现了关键候选基因TOP2B，通过在年轻小鼠成熟卵母细胞中敲降TOP2B，证明了TOP2B是影响卵母细胞质量和早期胚胎发育的关键基因。这些结果将为女性卵巢衰老的分子机制提供新的认识，并为评估高龄产妇卵母细胞的质量建立新标准。

 

 

03

 

Single cell RNA-seq reveals molecular pathways altered by 7, 12-dimethylbenz[a]anthracene treatment on pig oocytes

 

 

发表日期：2020.8.21

发表期刊：Theriogenology

影响因子：2.094

合作单位：长江大学

 

样本选择

 

猪卵母细胞（DMBA处理组和对照组，每组3个生物学重复）

 

研究技术

 

Smart-Seq2单细胞转录组测序

 

技术路线

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主要内容

 

对家畜卵母细胞的质量和发育能力往往有较高的要求，而卵母细胞质量会受到包括环境污染物在内的内部和外部因素的共同影响。先前研究已经证明，7、12-二甲基苯并[a]蒽（DMBA）会引发核和卵质不同步成熟，降低了猪卵母细胞的发育能力，然而其潜在的分子机制尚不清楚。研究者利用单细胞RNA-Seq研究了猪MII卵母细胞在DMBA处理下的转录组变化，并发现了丰度差异显著（P<0.05）的19个蛋白质编码基因和156个新的长非编码RNA（lncRNA），富集于糖鞘脂生物合成、尼古丁成瘾、基础转录因子和核苷酸切除修复等多种信号通路中。用MAPK和PLC信号通路抑制剂处理猪卵丘-卵母细胞复合体（COCs）可以抑制DMBA提高第一极体排出率的影响。此外，将DMBA与250 mM AA2P（一种维生素C衍生物）和100 mM辅酶Q10（CoQ10）共同孵育可以显著降低DMBA诱导的高活性氧（ROS）水平，并部分缓解DMBA诱导的高第一极体排出率，但成熟卵母细胞的卵裂和囊胚发生率仍然很低。研究表明，单细胞RNA-Seq可以帮助揭示DMBA处理的猪卵母细胞分子信号通路的动态，补充抗氧化剂只能恢复DMBA对猪卵细胞造成的部分影响。

 

科研成果的产出，是对老师们科研工作的认可，也是对安诺优达认真、专业的服务态度的褒奖。安诺优达单细胞科研团队将继续用专业的服务回馈广大科研合作伙伴！

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作为国内单细胞测序技术整体解决方案的提供商，目前安诺优达单细胞多组学研究具有全面的产品，覆盖三大组学（基因组、转录组、表观组），拥有丰富的项目经验、合作单位100+、物种经验50+、多篇高分文章IF累计350+，能够有针对性并准确服务于不同的研究领域及研究策略，使得科研工作者可以更深入地了解细胞间的异质性。我们已备好单细胞多组学研究解决方案，期待与您一起，探索生命之美。

 

 

参考文献

1. Sui L, Huang R, Yu H, Zhang S, Li Z. Inhibition of HDAC6 by tubastatin A disrupts 小鼠 oocyte meiosis via regulating histone modifications and mRNA expression[J]. J Cell Physiol. 2020;235（10）:7030-7042. doi:10.1002/jcp.29599

2. Zhang JJ, Liu X, Chen L, et al. Advanced maternal age alters expression of maternal effect genes that are essential for human oocyte quality[J]. Aging. 2020;12（4）:3950-3961. doi:10.18632/aging.102864

3. Yang CX, Song ZQ, Pei S, et al. Single cell RNA-seq reveals molecular pathways altered by 7, 12-dimethylbenz[a]anthracene treatment on pig oocytes[J]. Theriogenology. 2020;157:449-457. doi:10.1016/j.theriogenology.2020.08.020